MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022607	TGT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022607	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022607	TTCC	2	8	228	235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022607	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022607	TAA	2	6	406	411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022607	AAT	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022607	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022607	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022607	T	7	7	579	585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022607	TCAT	2	8	620	627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022607	TA	3	6	633	638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022607	TA	3	6	644	649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022607	A	6	6	669	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022607	A	6	6	696	701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022607	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022607	GAAC	2	8	771	778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022607	AC	3	6	777	782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022607	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022607	A	7	7	2090	2096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022607	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022607	T	6	6	2155	2160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022607	TC	3	6	2190	2195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022607	T	6	6	2229	2234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022607	GTT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022607	TCT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022607	CCT	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022607	TATT	2	8	4530	4537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022607	TGC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022607	GTG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022607	A	7	7	4787	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022607	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022607	TAA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022607	AATT	2	8	4918	4925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022607	TAT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022607	TTG	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022607	ATT	2	6	4976	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022607	T	7	7	4996	5002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022607	TAA	2	6	5442	5447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022607	CTTCTG	2	12	5480	5491	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022607	GTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022607	A	7	7	5542	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022607	CTC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022607	TAT	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022607	TTAC	2	8	5894	5901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022607	T	7	7	5970	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022607	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022607	TAG	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022607	ACG	2	6	6205	6210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022607	ATCCC	2	10	6359	6368	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_022607	T	7	7	6389	6395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022607	TTC	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022607	TGAA	2	8	6474	6481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022607	AAT	2	6	6509	6514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022607	AAAT	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022607	TTG	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022607	ATT	2	6	6652	6657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022607	A	6	6	7353	7358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022607	TAG	3	9	7388	7396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022607	CA	3	6	7426	7431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022607	TG	3	6	7435	7440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022607	TAC	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022607	TCAT	2	8	7513	7520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022607	GAT	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022607	AAAG	2	8	7682	7689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022607	GGTT	2	8	7723	7730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022607	GGAAA	2	10	7745	7754	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022607	GCC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022607	GAG	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022607	T	7	7	7808	7814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022607	A	7	7	7841	7847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022607	ACAG	2	8	7868	7875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022607	CGG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022607	AGC	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022607	TGT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022607	T	7	7	8031	8037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022607	A	7	7	8089	8095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022607	GA	3	6	8198	8203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022607	GA	3	6	8205	8210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022607	ATC	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022607	A	6	6	9552	9557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022607	AAT	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022607	T	6	6	10418	10423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022607	GCT	2	6	10479	10484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022607	T	7	7	10499	10505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022607	TTTTA	2	10	10527	10536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022607	TATT	2	8	10537	10544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022607	TTA	2	6	10545	10550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022607	GATA	2	8	10681	10688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022607	TA	4	8	10702	10709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022607	TAAA	2	8	10711	10718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022607	TA	3	6	10741	10746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022607	ATA	2	6	10749	10754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022607	AT	3	6	11633	11638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022607	T	7	7	11642	11648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022607	AGG	2	6	11649	11654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022607	ATTT	2	8	12238	12245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022607	A	6	6	12264	12269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022607	T	7	7	12296	12302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022607	TA	3	6	12342	12347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022607	A	6	6	12415	12420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022607	TAT	2	6	12421	12426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022607	T	7	7	12432	12438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022607	TTG	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022607	TAT	2	6	12460	12465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022607	TAAAA	2	10	12484	12493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022607	TTGA	2	8	12502	12509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022607	AT	3	6	12533	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022607	AAT	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022607	TAG	2	6	12614	12619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022607	ATT	2	6	12620	12625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022607	ATC	2	6	12626	12631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022607	TA	3	6	13377	13382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022607	TC	3	6	13977	13982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022607	TCAT	2	8	14007	14014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022607	A	7	7	14048	14054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022607	TATT	2	8	14105	14112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022607	TAA	2	6	14120	14125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022607	CTTC	2	8	14157	14164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022607	TAA	2	6	14201	14206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022607	A	6	6	14242	14247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022607	TCTT	2	8	14450	14457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022607	CTT	2	6	14591	14596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022607	AAG	2	6	14752	14757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022607	TGATT	2	10	14886	14895	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022607	AAT	2	6	14921	14926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022607	ATA	2	6	14954	14959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022607	GCT	3	9	15114	15122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022607	GTCAA	2	10	15183	15192	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022607	ACA	2	6	15193	15198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022607	ATA	2	6	15270	15275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022607	TTTG	2	8	15285	15292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022607	TCTTT	2	10	15421	15430	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022607	AGA	2	6	15452	15457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.