MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359

Total Repeats: 11115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022606	A	7	7	2325367	2325373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_022606	AAAT	2	8	2325398	2325405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_022606	GTT	2	6	2325446	2325451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_022606	ATT	2	6	2325562	2325567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_022606	TTA	2	6	2325571	2325576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_022606	ATC	2	6	2325637	2325642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_022606	T	6	6	2325679	2325684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_022606	A	6	6	2325705	2325710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_022606	GAC	2	6	2325716	2325721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_022606	AAACT	2	10	2325727	2325736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11011	NC_022606	TAC	2	6	2326779	2326784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_022606	AG	3	6	2326813	2326818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_022606	CT	3	6	2326840	2326845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_022606	T	7	7	2326845	2326851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_022606	TTTA	2	8	2326927	2326934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_022606	TAA	2	6	2326951	2326956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_022606	ATTC	2	8	2326971	2326978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_022606	TA	4	8	2327056	2327063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_022606	A	6	6	2327130	2327135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_022606	CTTT	2	8	2329036	2329043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_022606	TCTTA	2	10	2329070	2329079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11022	NC_022606	A	6	6	2329152	2329157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_022606	TTG	2	6	2329200	2329205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_022606	A	6	6	2329229	2329234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_022606	T	7	7	2330724	2330730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_022606	A	6	6	2330736	2330741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_022606	ACT	2	6	2330792	2330797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_022606	ATT	2	6	2330815	2330820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_022606	TGT	2	6	2330845	2330850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_022606	CTAA	2	8	2330874	2330881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_022606	ATTT	2	8	2330902	2330909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_022606	TTG	2	6	2330917	2330922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_022606	TAGT	2	8	2331757	2331764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_022606	AAG	2	6	2331779	2331784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_022606	TCC	2	6	2332238	2332243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_022606	AAAGAA	2	12	2332894	2332905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_022606	ATA	2	6	2333026	2333031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_022606	TAA	2	6	2333038	2333043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_022606	T	10	10	2333076	2333085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_022606	TTG	2	6	2333104	2333109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_022606	CTT	2	6	2333183	2333188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_022606	ACAAA	2	10	2333219	2333228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11043	NC_022606	TAAAT	2	10	2334063	2334072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_022606	T	7	7	2334143	2334149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_022606	CCT	2	6	2335915	2335920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_022606	CTAG	2	8	2335955	2335962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_022606	AAC	2	6	2335970	2335975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_022606	TAT	2	6	2336011	2336016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_022606	A	7	7	2336777	2336783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_022606	T	6	6	2336809	2336814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_022606	TTCT	2	8	2336883	2336890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11052	NC_022606	GATAA	2	10	2336902	2336911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_022606	TTC	2	6	2336932	2336937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_022606	GTT	2	6	2336988	2336993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_022606	GAT	2	6	2337030	2337035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_022606	CAT	2	6	2337037	2337042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_022606	TTGAT	2	10	2337149	2337158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_022606	GTA	2	6	2337194	2337199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_022606	T	7	7	2337209	2337215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_022606	CATTG	2	10	2337224	2337233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11061	NC_022606	TTC	2	6	2337280	2337285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_022606	TTC	2	6	2337385	2337390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_022606	ATT	2	6	2337511	2337516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_022606	CTT	2	6	2337555	2337560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_022606	TAA	2	6	2337571	2337576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_022606	AAT	2	6	2337630	2337635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_022606	TTGT	2	8	2337676	2337683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_022606	GTT	2	6	2337716	2337721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_022606	TCA	2	6	2337741	2337746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_022606	T	6	6	2337768	2337773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_022606	TTCAT	2	10	2337776	2337785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11072	NC_022606	AGT	2	6	2337854	2337859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_022606	CTT	2	6	2337942	2337947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_022606	CAT	2	6	2337990	2337995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_022606	ATA	2	6	2338108	2338113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_022606	AAT	2	6	2338259	2338264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_022606	GAA	2	6	2338321	2338326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_022606	CTCCAT	2	12	2338404	2338415	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_022606	A	6	6	2338493	2338498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_022606	CCT	2	6	2340015	2340020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11081	NC_022606	TA	3	6	2340044	2340049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_022606	T	6	6	2340100	2340105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_022606	A	7	7	2340147	2340153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_022606	A	7	7	2340168	2340174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_022606	ATT	2	6	2342919	2342924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_022606	TCC	2	6	2342925	2342930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_022606	TCTATT	2	12	2342941	2342952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11088	NC_022606	TAA	2	6	2342960	2342965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_022606	TGCT	2	8	2342976	2342983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_022606	ATT	2	6	2344771	2344776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_022606	TAC	2	6	2344777	2344782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_022606	ATT	2	6	2344795	2344800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_022606	ATT	2	6	2344851	2344856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_022606	A	8	8	2344861	2344868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_022606	CTT	2	6	2344894	2344899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_022606	TA	3	6	2344900	2344905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_022606	TAA	2	6	2344950	2344955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_022606	TTTTA	2	10	2345783	2345792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_022606	ACT	2	6	2347092	2347097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_022606	A	9	9	2347119	2347127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_022606	CCT	2	6	2347295	2347300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_022606	TC	3	6	2347311	2347316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_022606	ATT	2	6	2347353	2347358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_022606	GAA	2	6	2347364	2347369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_022606	A	6	6	2347368	2347373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_022606	ATTC	2	8	2347405	2347412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_022606	TAA	2	6	2347440	2347445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_022606	T	7	7	2347467	2347473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_022606	TTA	2	6	2347495	2347500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_022606	T	6	6	2347525	2347530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_022606	T	7	7	2347588	2347594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_022606	T	7	7	2347596	2347602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_022606	T	6	6	2347750	2347755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022606	TAAA	2	8	2347761	2347768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_022606	TTTA	2	8	2347802	2347809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.