MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022121	CCG	2	6	623371	623376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_022121	A	7	7	623385	623391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_022121	CTTCT	2	10	623393	623402	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1504	NC_022121	CTC	2	6	623411	623416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_022121	A	6	6	623436	623441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_022121	AAG	2	6	623451	623456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_022121	AGA	2	6	623515	623520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022121	AAG	2	6	623571	623576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022121	T	6	6	623611	623616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022121	TCG	2	6	623618	623623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_022121	TCGC	2	8	623638	623645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_022121	TCT	2	6	623707	623712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_022121	GAT	2	6	623758	623763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_022121	T	6	6	623791	623796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022121	TAAG	2	8	625076	625083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_022121	A	6	6	625112	625117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_022121	AGA	2	6	625125	625130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022121	GATT	2	8	625199	625206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022121	TTC	2	6	628833	628838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022121	T	6	6	628858	628863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022121	CCT	2	6	628864	628869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_022121	T	6	6	629483	629488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022121	CT	3	6	629568	629573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_022121	TTTCC	2	10	629574	629583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1525	NC_022121	CTTC	2	8	629609	629616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_022121	ATC	2	6	629622	629627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_022121	A	6	6	632041	632046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_022121	GTGA	2	8	632083	632090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_022121	TCT	2	6	633936	633941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_022121	AT	3	6	633960	633965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022121	A	9	9	633968	633976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_022121	T	6	6	634000	634005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022121	A	8	8	636982	636989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_022121	CTCC	2	8	636993	637000	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1535	NC_022121	A	6	6	637001	637006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022121	TTC	2	6	637014	637019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_022121	TTG	2	6	637040	637045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022121	T	7	7	637513	637519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022121	ATTAA	2	10	637526	637535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_022121	A	6	6	637580	637585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022121	CCT	2	6	639917	639922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_022121	CCT	2	6	641107	641112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_022121	A	6	6	646130	646135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_022121	A	8	8	646162	646169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022121	T	7	7	646202	646208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_022121	A	6	6	646212	646217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_022121	A	7	7	646219	646225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022121	GA	3	6	649095	649100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_022121	GA	3	6	649107	649112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022121	AGG	2	6	649139	649144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022121	CCT	2	6	649153	649158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_022121	A	8	8	649162	649169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022121	AC	3	6	649183	649188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_022121	GCT	2	6	649189	649194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_022121	AATT	2	8	649220	649227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_022121	TTA	2	6	649233	649238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_022121	ATTA	2	8	649264	649271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_022121	TAG	2	6	649307	649312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022121	TTATTT	2	12	649320	649331	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022121	T	7	7	649329	649335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_022121	AG	3	6	650449	650454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_022121	T	6	6	651931	651936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022121	GT	3	6	651947	651952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022121	CTTT	2	8	653278	653285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_022121	AAC	2	6	654371	654376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_022121	TTG	2	6	654382	654387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_022121	A	7	7	654401	654407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_022121	A	7	7	654435	654441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022121	A	6	6	654451	654456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022121	CTC	2	6	654495	654500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_022121	ATT	2	6	656584	656589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022121	CA	3	6	656596	656601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_022121	A	6	6	656674	656679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022121	CAGG	2	8	656698	656705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_022121	TTC	2	6	656746	656751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_022121	AAT	2	6	656839	656844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_022121	TCC	2	6	656963	656968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_022121	TCCT	2	8	659085	659092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_022121	ATC	2	6	659097	659102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_022121	GAT	2	6	659111	659116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022121	T	6	6	659239	659244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_022121	AAC	2	6	660325	660330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_022121	TG	3	6	660338	660343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_022121	CTA	2	6	662389	662394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_022121	GGA	2	6	662447	662452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_022121	A	6	6	663794	663799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_022121	C	6	6	663832	663837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1588	NC_022121	CTC	2	6	663887	663892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_022121	A	7	7	663898	663904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_022121	T	6	6	665905	665910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_022121	CTT	2	6	665919	665924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_022121	AAG	2	6	665937	665942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_022121	T	6	6	665944	665949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022121	TCT	2	6	665956	665961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_022121	AT	3	6	665967	665972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_022121	TC	4	8	667799	667806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_022121	GAA	2	6	670678	670683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_022121	T	6	6	670689	670694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_022121	A	6	6	670758	670763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022121	CT	3	6	670764	670769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_022121	ATT	2	6	671487	671492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022121	AAAT	2	8	671520	671527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_022121	CCT	2	6	671544	671549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_022121	AAGA	2	8	674153	674160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_022121	CA	3	6	674190	674195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_022121	AC	3	6	674208	674213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_022121	GAAT	2	8	674225	674232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022121	CAT	2	6	674234	674239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_022121	CTC	2	6	674279	674284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_022121	CCT	2	6	674294	674299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_022121	CTC	2	6	674342	674347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_022121	CAT	2	6	674351	674356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_022121	AACA	2	8	674385	674392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_022121	AATC	2	8	675236	675243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_022121	TCAA	2	8	675248	675255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_022121	GAAG	2	8	675263	675270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_022121	ACA	2	6	677392	677397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_022121	CT	3	6	677398	677403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_022121	ATC	2	6	677416	677421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_022121	ACA	2	6	677424	677429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_022121	GTT	2	6	677435	677440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022121	ATA	2	6	681817	681822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022121	CTG	2	6	681831	681836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_022121	AACT	2	8	681855	681862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_022121	CTC	2	6	682854	682859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_022121	AGAA	2	8	682862	682869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022121	ACC	2	6	682900	682905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_022121	A	6	6	682949	682954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022121	AGG	2	6	682964	682969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_022121	A	6	6	683016	683021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_022121	AAC	2	6	684717	684722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_022121	TC	3	6	685979	685984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_022121	T	7	7	686019	686025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_022121	TAAAA	2	10	686055	686064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_022121	A	6	6	686061	686066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_022121	GAAA	2	8	686074	686081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_022121	CGC	2	6	686090	686095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1638	NC_022121	ATC	2	6	686097	686102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_022121	CT	3	6	686112	686117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1922	NC_022121	GAAG	2	8	838658	838665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_022121	CTA	2	6	840703	840708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1932	NC_022121	AG	3	6	847439	847444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_022121	AG	3	6	847448	847453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1935	NC_022121	TAC	2	6	847532	847537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1937	NC_022121	CCT	2	6	848246	848251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1944	NC_022121	GAAG	2	8	854652	854659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_022121	TAA	2	6	854796	854801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_022121	TA	3	6	854809	854814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_022121	T	6	6	854815	854820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1954	NC_022121	CGC	2	6	855223	855228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1955	NC_022121	GT	3	6	855229	855234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_022121	AGA	2	6	855279	855284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_022121	AAG	2	6	855320	855325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_022121	CAG	2	6	855344	855349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1961	NC_022121	GCC	2	6	855704	855709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1962	NC_022121	GAG	2	6	855711	855716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1968	NC_022121	CAT	2	6	856234	856239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1978	NC_022121	TGG	2	6	856639	856644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_022121	GAA	2	6	856665	856670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1980	NC_022121	AGT	2	6	856752	856757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1989	NC_022121	ATA	2	6	857514	857519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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