MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 2524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022107	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022107	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022107	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022107	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022107	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022107	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022107	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022107	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022107	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022107	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022107	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022107	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022107	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022107	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022107	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022107	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022107	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022107	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022107	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_022107	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022107	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022107	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022107	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022107	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022107	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022107	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022107	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022107	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022107	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022107	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022107	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022107	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022107	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022107	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022107	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022107	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022107	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022107	CAAAAA	2	12	6250	6261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022107	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022107	CTT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022107	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022107	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022107	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022107	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022107	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022107	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022107	TTC	3	9	9175	9183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022107	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022107	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022107	GAA	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022107	A	6	6	9285	9290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022107	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022107	CCT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022107	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022107	TAG	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022107	AGAA	2	8	11203	11210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022107	CTT	2	6	11243	11248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022107	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022107	TCA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022107	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022107	ATT	2	6	13374	13379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022107	AAG	2	6	13391	13396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022107	TTA	2	6	13417	13422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022107	AAGG	2	8	13439	13446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022107	AAG	2	6	13451	13456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022107	AAC	2	6	13535	13540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022107	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022107	CTT	2	6	14958	14963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022107	CAAA	2	8	16073	16080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022107	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022107	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022107	CAAT	2	8	17545	17552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022107	GTT	2	6	17631	17636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022107	AGA	2	6	18377	18382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022107	CTT	3	9	19893	19901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022107	T	6	6	19900	19905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022107	T	6	6	19907	19912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022107	GAA	2	6	20418	20423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022107	A	6	6	20480	20485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022107	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022107	A	6	6	20555	20560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022107	GGA	2	6	20612	20617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022107	AGA	3	9	20652	20660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022107	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022107	TGG	2	6	20871	20876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022107	AAC	2	6	20910	20915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022107	AGC	2	6	20927	20932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022107	GCCA	2	8	21021	21028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022107	TGA	2	6	21128	21133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022107	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022107	TCC	2	6	21245	21250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022107	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022107	CGCT	2	8	21269	21276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022107	TTAA	2	8	21290	21297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022107	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022107	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022107	AAT	2	6	21421	21426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022107	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022107	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022107	T	10	10	24589	24598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022107	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022107	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022107	ACT	2	6	26529	26534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022107	A	6	6	26545	26550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022107	T	7	7	26557	26563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022107	T	7	7	27871	27877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022107	TAA	2	6	27882	27887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022107	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022107	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022107	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022107	AGA	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022107	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022107	CTG	2	6	33123	33128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022107	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022107	T	9	9	36420	36428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022107	CTT	2	6	36480	36485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022107	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022107	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022107	TAA	2	6	38818	38823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022107	T	6	6	38838	38843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022107	AAG	2	6	38859	38864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022107	A	8	8	40116	40123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022107	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022107	T	6	6	40131	40136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022107	CTC	2	6	40137	40142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_022107	AAG	2	6	40222	40227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022107	T	8	8	40312	40319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022107	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022107	TGCAA	2	10	42329	42338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022107	A	6	6	42583	42588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022107	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022107	A	7	7	42632	42638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022107	CAAAA	2	10	42647	42656	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022107	A	7	7	42653	42659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022107	GAT	2	6	42677	42682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022107	AAG	2	6	42683	42688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022107	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022107	A	6	6	42723	42728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022107	GGA	2	6	42735	42740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022107	TAA	2	6	42833	42838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022107	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022107	TGTT	2	8	43818	43825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022107	A	8	8	43857	43864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022107	AATA	2	8	44057	44064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022107	ACT	2	6	44065	44070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022107	AAG	2	6	45916	45921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022107	GCA	2	6	45926	45931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_022107	AG	3	6	48045	48050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022107	TGT	2	6	48064	48069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022107	T	8	8	48610	48617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022107	GTC	2	6	48742	48747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_022107	T	8	8	48887	48894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022107	A	6	6	48938	48943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022107	T	6	6	49048	49053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022107	AGA	2	6	49563	49568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_022107	AT	3	6	100094	100099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_022107	TAA	3	9	106923	106931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_022107	CTC	2	6	114035	114040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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442	NC_022107	ACA	2	6	181633	181638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_022107	G	6	6	181981	181986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
451	NC_022107	GA	3	6	182017	182022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022107	AGA	2	6	182045	182050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_022107	AAGA	2	8	182165	182172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_022107	T	7	7	182293	182299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_022107	GTT	2	6	185227	185232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_022107	T	7	7	185650	185656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022107	T	6	6	185662	185667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_022107	T	7	7	185712	185718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_022107	T	6	6	185757	185762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_022107	TTG	2	6	187727	187732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022107	TAT	2	6	187807	187812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_022107	T	6	6	192975	192980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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