MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 2677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021899	ATAG	2	8	572874	572881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021899	C	6	6	575433	575438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1503	NC_021899	G	6	6	575454	575459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021899	TTG	2	6	575915	575920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021899	CT	3	6	575922	575927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_021899	GCAC	2	8	575943	575950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_021899	AAAGG	2	10	577257	577266	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021899	CTC	2	6	577889	577894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_021899	TAT	2	6	577913	577918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021899	A	6	6	577936	577941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021899	CCA	2	6	578016	578021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_021899	ACG	2	6	578033	578038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021899	AAG	2	6	578071	578076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021899	GCAC	2	8	578082	578089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_021899	A	8	8	578128	578135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021899	CT	3	6	582064	582069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_021899	AGT	2	6	582468	582473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021899	CA	3	6	588396	588401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_021899	TTC	2	6	590590	590595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021899	CTTC	2	8	590597	590604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_021899	CA	3	6	592318	592323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_021899	CAAA	2	8	592439	592446	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_021899	GGC	2	6	592447	592452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021899	CA	3	6	592484	592489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_021899	GAA	2	6	592584	592589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021899	A	6	6	592680	592685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021899	A	6	6	592727	592732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021899	ACCT	2	8	593638	593645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_021899	TACA	2	8	593660	593667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_021899	AG	3	6	593674	593679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021899	GCA	2	6	593721	593726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021899	A	7	7	593760	593766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021899	TAT	2	6	596938	596943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021899	T	12	12	596946	596957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021899	AGCA	2	8	596958	596965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_021899	A	6	6	596975	596980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021899	TAC	2	6	596982	596987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021899	GA	3	6	598674	598679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021899	TAG	2	6	599277	599282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021899	AGA	2	6	599292	599297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021899	GGA	2	6	599315	599320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021899	T	6	6	601258	601263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021899	TTC	2	6	601286	601291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_021899	CCT	2	6	601305	601310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021899	CTAC	2	8	601347	601354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_021899	TAGGGG	2	12	601416	601427	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021899	TA	3	6	601586	601591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021899	CCA	2	6	601640	601645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_021899	TTA	2	6	601673	601678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021899	TC	3	6	601688	601693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021899	TCT	2	6	601780	601785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021899	CTT	2	6	601796	601801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021899	CAA	2	6	601804	601809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021899	TTGC	2	8	601891	601898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_021899	CCT	2	6	601921	601926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_021899	CT	3	6	602279	602284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_021899	A	6	6	602781	602786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021899	TTC	2	6	603532	603537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021899	T	6	6	603568	603573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021899	A	10	10	603621	603630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021899	T	7	7	606740	606746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021899	ACT	2	6	606792	606797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021899	TC	3	6	606815	606820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_021899	TAT	2	6	606821	606826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021899	AC	3	6	606839	606844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_021899	ATCC	2	8	606859	606866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_021899	CT	3	6	606896	606901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_021899	TCT	2	6	606921	606926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_021899	AAG	2	6	606948	606953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021899	GAC	2	6	606958	606963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021899	TAC	2	6	606966	606971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021899	ATG	2	6	606983	606988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021899	A	6	6	607018	607023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021899	AC	3	6	607091	607096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_021899	CTC	2	6	612232	612237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_021899	TGT	2	6	612283	612288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021899	A	6	6	612329	612334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021899	CT	3	6	612343	612348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_021899	AG	3	6	612385	612390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021899	A	6	6	612398	612403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021899	GGAA	2	8	612413	612420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021899	A	7	7	612425	612431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021899	TATT	2	8	613325	613332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021899	TAA	2	6	613334	613339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021899	AAAT	2	8	613357	613364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021899	T	7	7	613364	613370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021899	TCTTTT	2	12	613411	613422	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1588	NC_021899	T	6	6	613419	613424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021899	ATG	2	6	613425	613430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021899	TTA	2	6	613439	613444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021899	CTT	2	6	614436	614441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021899	T	6	6	615941	615946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021899	CAG	2	6	615984	615989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021899	CT	3	6	617309	617314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_021899	CAT	2	6	617864	617869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_021899	CT	3	6	617950	617955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_021899	CCG	2	6	618010	618015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_021899	GAAA	2	8	618045	618052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021899	AAC	2	6	618171	618176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021899	GAA	2	6	618190	618195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021899	AGA	2	6	618222	618227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021899	CGA	2	6	618256	618261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021899	CTT	2	6	618320	618325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_021899	AC	4	8	618357	618364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_021899	ATC	2	6	618412	618417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021899	AGG	2	6	618548	618553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021899	A	6	6	618613	618618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021899	TC	3	6	618626	618631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_021899	CCG	2	6	618672	618677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_021899	A	7	7	618686	618692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021899	CTTCT	2	10	618694	618703	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1612	NC_021899	CTC	2	6	618712	618717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1614	NC_021899	AGA	2	6	618816	618821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021899	AAG	2	6	618872	618877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021899	T	6	6	618912	618917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021899	TCG	2	6	618919	618924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1620	NC_021899	GAT	2	6	619059	619064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021899	T	6	6	619092	619097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021899	TAAG	2	8	620377	620384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021899	A	6	6	620413	620418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021899	AGA	2	6	620426	620431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021899	GATT	2	8	620500	620507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021899	TTC	2	6	624134	624139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021899	T	6	6	624159	624164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021899	CCT	2	6	624165	624170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_021899	T	6	6	624784	624789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021899	CT	3	6	624869	624874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_021899	TTTCC	2	10	624875	624884	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1632	NC_021899	CTTC	2	8	624910	624917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_021899	ATC	2	6	624923	624928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021899	A	6	6	627342	627347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021899	GTGA	2	8	627384	627391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021899	TCT	2	6	629237	629242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_021899	AT	3	6	629261	629266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021899	A	9	9	629269	629277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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