MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 2677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021899	TCA	2	6	364546	364551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021899	TAA	2	6	364552	364557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021899	A	6	6	364560	364565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021899	AAAAC	2	10	364611	364620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_021899	TAAA	2	8	364626	364633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021899	CTT	2	6	364694	364699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021899	A	6	6	365489	365494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021899	AAG	2	6	365502	365507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021899	AAAT	2	8	365545	365552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021899	CCTT	2	8	365567	365574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_021899	ATCT	2	8	365600	365607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_021899	CTT	2	6	370468	370473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021899	AGA	2	6	370490	370495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021899	TAAA	2	8	377379	377386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021899	A	6	6	377450	377455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021899	CT	4	8	377460	377467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_021899	TCA	2	6	377553	377558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021899	T	6	6	379270	379275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021899	TTC	2	6	381328	381333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021899	ATG	2	6	381354	381359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021899	A	7	7	381377	381383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021899	ATA	2	6	381388	381393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021899	CTT	2	6	381405	381410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021899	AGA	2	6	381424	381429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021899	T	8	8	381439	381446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021899	CAT	2	6	381928	381933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021899	A	8	8	383745	383752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021899	TTG	2	6	383782	383787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021899	CTT	2	6	385871	385876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021899	T	6	6	387079	387084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021899	TAA	2	6	387293	387298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021899	CG	3	6	387299	387304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_021899	TTTA	2	8	387347	387354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021899	CTT	2	6	387384	387389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021899	GTT	2	6	387434	387439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021899	GATT	2	8	388106	388113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021899	AATT	2	8	388155	388162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021899	A	7	7	388193	388199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021899	ATAA	2	8	388215	388222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021899	TGC	2	6	388247	388252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021899	TTG	2	6	388298	388303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021899	GTA	2	6	388311	388316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021899	AAG	3	9	388324	388332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021899	CA	3	6	388349	388354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021899	TC	3	6	390896	390901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_021899	CAA	2	6	390909	390914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021899	AGG	2	6	390951	390956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_021899	CTT	2	6	391377	391382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021899	CT	3	6	391386	391391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_021899	GCAA	2	8	391594	391601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_021899	GA	3	6	391640	391645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021899	AAC	2	6	392601	392606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_021899	CTT	2	6	392614	392619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021899	CAG	2	6	392632	392637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021899	CTT	2	6	393607	393612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021899	AAG	2	6	393620	393625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021899	AAT	2	6	395257	395262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021899	A	8	8	399655	399662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021899	T	8	8	399690	399697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021899	CTA	2	6	399715	399720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021899	TCC	2	6	400040	400045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_021899	A	6	6	400047	400052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021899	A	7	7	400070	400076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021899	AAGCG	2	10	400126	400135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_021899	A	6	6	400799	400804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021899	TCT	2	6	400815	400820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021899	TTC	2	6	400839	400844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_021899	GAA	2	6	400879	400884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021899	TCAT	2	8	400891	400898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_021899	AGA	2	6	400960	400965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021899	GTT	2	6	402966	402971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021899	CCT	2	6	402972	402977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_021899	CAAA	2	8	403027	403034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021899	A	6	6	403049	403054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021899	GAG	2	6	403089	403094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_021899	T	6	6	403175	403180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021899	A	6	6	405344	405349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021899	A	8	8	405351	405358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021899	TTTTAA	2	12	405371	405382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021899	TAA	2	6	405426	405431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021899	A	6	6	405430	405435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021899	AAC	2	6	405444	405449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021899	TAA	2	6	405476	405481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021899	TAA	2	6	405511	405516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_021899	TTA	2	6	408262	408267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021899	TAA	2	6	408284	408289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021899	AGA	2	6	408312	408317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021899	TTA	2	6	408351	408356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021899	TGA	2	6	408362	408367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021899	CCA	2	6	412313	412318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_021899	GCA	2	6	412367	412372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021899	GTATA	2	10	412373	412382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021899	AGCAA	2	10	412409	412418	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_021899	ATTT	2	8	412444	412451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021899	AGAA	2	8	412454	412461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021899	A	6	6	414217	414222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021899	CAA	2	6	414236	414241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021899	ATTA	2	8	414243	414250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021899	AAC	2	6	414252	414257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021899	AAAAT	2	10	414258	414267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021899	A	7	7	414280	414286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021899	A	6	6	414325	414330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021899	T	8	8	419815	419822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021899	TGC	2	6	419826	419831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021899	TTC	2	6	419832	419837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021899	GAA	2	6	420651	420656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021899	A	7	7	420670	420676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021899	T	6	6	420679	420684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021899	TTA	2	6	420707	420712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021899	GTT	2	6	420716	420721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021899	ACTG	2	8	420742	420749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_021899	CTTT	2	8	420761	420768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_021899	ACC	2	6	420773	420778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021899	CAA	2	6	422157	422162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021899	A	6	6	422161	422166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021899	GAT	2	6	422563	422568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021899	A	7	7	422601	422607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021899	GTAA	2	8	422638	422645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021899	ACATCA	2	12	422675	422686	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021899	GAAA	2	8	422687	422694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021899	CTG	2	6	422747	422752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021899	AGG	2	6	422768	422773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021899	CGT	2	6	424248	424253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021899	TTCT	2	8	424306	424313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_021899	CTCTT	2	10	424327	424336	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1130	NC_021899	A	6	6	424368	424373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021899	T	7	7	424376	424382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021899	CT	3	6	425468	425473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_021899	A	6	6	425478	425483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021899	GAG	2	6	425486	425491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021899	T	6	6	425494	425499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021899	CT	3	6	426491	426496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_021899	AACT	2	8	426538	426545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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