MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium cf. saccharolyticum K10

Total Repeats: 23314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021047	AGC	2	6	85	90	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021047	T	7	7	111	117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021047	A	6	6	226	231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021047	ATT	2	6	241	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021047	AAGT	2	8	247	254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021047	TTC	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021047	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021047	AGG	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021047	AATGAA	2	12	2455	2466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021047	AGC	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021047	GGA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021047	GAG	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021047	GA	3	6	2641	2646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021047	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021047	CAG	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021047	CAG	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021047	CAG	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021047	TATG	2	8	2792	2799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021047	AG	3	6	2972	2977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021047	CTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021047	GAA	2	6	3140	3145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021047	CT	3	6	3430	3435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021047	ATA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021047	GCA	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021047	TTTTC	2	10	3557	3566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021047	CCT	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021047	TAA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021047	AGC	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021047	GA	3	6	3683	3688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021047	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021047	GAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021047	AGG	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021047	GAG	2	6	4567	4572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021047	GTCCG	2	10	4618	4627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021047	CTTTA	2	10	4662	4671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021047	CGAT	2	8	4685	4692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021047	TC	3	6	4703	4708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021047	GACAG	2	10	4717	4726	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021047	TAA	2	6	4734	4739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021047	GAA	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021047	CGG	2	6	5853	5858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021047	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021047	CGG	2	6	5893	5898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021047	AAAG	2	8	5906	5913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021047	GT	3	6	5929	5934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021047	AGA	2	6	5943	5948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021047	GA	4	8	6077	6084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021047	ATAA	2	8	7481	7488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021047	AAG	2	6	7489	7494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021047	CTT	2	6	7528	7533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021047	AC	3	6	7594	7599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021047	A	6	6	9013	9018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021047	GGC	2	6	9033	9038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021047	AGGAG	2	10	9072	9081	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021047	AG	3	6	9080	9085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021047	AGG	2	6	9428	9433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021047	GGA	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021047	AGGAA	2	10	10600	10609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021047	AAG	2	6	10626	10631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021047	AATT	2	8	10685	10692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021047	AATTT	2	10	10696	10705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021047	T	6	6	11330	11335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021047	GCA	2	6	12927	12932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021047	AGC	2	6	12935	12940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021047	AGC	2	6	12970	12975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021047	A	6	6	12997	13002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021047	TGT	2	6	13025	13030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021047	AGA	2	6	13060	13065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021047	AGGC	2	8	13079	13086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021047	GGCAG	2	10	13112	13121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021047	GAT	2	6	14515	14520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021047	AGG	2	6	14558	14563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021047	ACAGA	2	10	16590	16599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021047	GCA	2	6	16801	16806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021047	GAAT	2	8	16831	16838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021047	GAAGG	2	10	17816	17825	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021047	GAA	2	6	17833	17838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021047	GAG	2	6	17854	17859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021047	A	7	7	17918	17924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021047	TAT	2	6	17943	17948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021047	A	6	6	17960	17965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021047	AAT	2	6	17974	17979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021047	GGA	2	6	18017	18022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021047	GCA	2	6	19699	19704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021047	GCG	2	6	19882	19887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021047	GAA	2	6	19893	19898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021047	CGC	2	6	19915	19920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021047	AGG	2	6	20771	20776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021047	AGGC	2	8	21371	21378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021047	GA	3	6	21406	21411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021047	GA	3	6	21413	21418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021047	AGG	2	6	23730	23735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021047	GA	3	6	24703	24708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021047	CTC	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021047	GGGA	2	8	24768	24775	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021047	GGGA	2	8	24778	24785	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021047	TTC	2	6	25167	25172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021047	TTTTG	2	10	25179	25188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021047	GAAA	2	8	25256	25263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021047	CTA	2	6	25309	25314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021047	AAG	2	6	25366	25371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021047	A	6	6	25381	25386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021047	A	6	6	25413	25418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021047	AGG	2	6	25420	25425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021047	A	6	6	25924	25929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021047	AAGAG	2	10	25935	25944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021047	CTC	2	6	25985	25990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021047	GAAA	2	8	26010	26017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021047	GATAT	2	10	26038	26047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021047	TGA	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021047	AAAG	2	8	28919	28926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021047	TCC	2	6	30225	30230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021047	T	7	7	30239	30245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021047	T	6	6	30260	30265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021047	CTGAC	2	10	30284	30293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_021047	TTCCT	2	10	32139	32148	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021047	ATT	2	6	32161	32166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021047	ATC	2	6	32235	32240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021047	GCG	2	6	32375	32380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021047	TC	3	6	32389	32394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021047	GGA	2	6	32411	32416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021047	GGA	2	6	32456	32461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021047	AAG	2	6	33645	33650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021047	GA	3	6	33657	33662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021047	T	7	7	33719	33725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021047	T	7	7	33738	33744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021047	AGC	2	6	33746	33751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021047	N	1013	1013	34822	35834	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021047	TTGT	2	8	35836	35843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021047	GA	3	6	36041	36046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021047	AGA	2	6	36067	36072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021047	AGG	2	6	36079	36084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021047	TGGG	2	8	36204	36211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021047	TTC	2	6	38164	38169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021047	ATT	2	6	38254	38259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021047	AAAT	2	8	38263	38270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021047	AT	3	6	38276	38281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021047	AAATA	2	10	38283	38292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021047	A	6	6	38333	38338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021047	ATA	2	6	38363	38368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021047	TCA	2	6	38380	38385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021047	A	6	6	38388	38393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021047	GGC	2	6	38457	38462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021047	GAAA	2	8	38522	38529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021047	ATAG	2	8	38570	38577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021047	G	6	6	38626	38631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021047	AGA	2	6	38683	38688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021047	A	7	7	38688	38694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021047	AGG	2	6	38699	38704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021047	GA	4	8	39764	39771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021047	AGA	2	6	41882	41887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021047	GCT	2	6	41922	41927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021047	GCT	2	6	43191	43196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021047	GAA	2	6	43227	43232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021047	AGA	2	6	43239	43244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021047	CAG	2	6	43267	43272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021047	ATTT	2	8	43275	43282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021047	TTA	2	6	43283	43288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021047	CGG	2	6	43345	43350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021047	N	844	844	43375	44218	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021047	AGAA	2	8	44239	44246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021047	TTA	2	6	44268	44273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021047	AATC	2	8	44293	44300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_021047	TCAA	2	8	44399	44406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_021047	GA	4	8	44465	44472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021047	ACT	2	6	44508	44513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_021047	AG	3	6	44601	44606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021047	GCG	2	6	44696	44701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021047	AAT	2	6	44731	44736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021047	ATCC	2	8	44754	44761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_021047	GTA	2	6	44806	44811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021047	GTG	2	6	44828	44833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021047	GAAG	2	8	44905	44912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021047	ACG	2	6	44927	44932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021047	GAG	2	6	44961	44966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021047	AG	4	8	45016	45023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021047	GAA	2	6	45070	45075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021047	ATC	2	6	45134	45139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_021047	AGA	2	6	45158	45163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_021047	T	6	6	45959	45964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021047	GAA	2	6	45971	45976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021047	AGA	2	6	49317	49322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021047	AGG	2	6	49335	49340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021047	TAA	2	6	49383	49388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021047	GAA	2	6	49447	49452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_021047	GGC	2	6	49459	49464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_021047	AG	3	6	49625	49630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021047	AGG	2	6	49671	49676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021047	AGA	2	6	49704	49709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021047	TCA	2	6	49731	49736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_021047	GGC	2	6	49813	49818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_021047	CTG	2	6	49900	49905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_021047	GCAGA	2	10	58842	58851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
284	NC_021047	T	6	6	58872	58877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_021047	TTAT	2	8	59026	59033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021047	GCT	2	6	59082	59087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_021047	TCT	2	6	59114	59119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_021047	TTCAG	2	10	59198	59207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_021047	T	6	6	59296	59301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021047	TCT	2	6	59307	59312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_021047	TA	3	6	59869	59874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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