MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021009	AAAG	2	8	242543	242550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021009	CAG	2	6	242563	242568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021009	ATT	2	6	242616	242621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021009	AGC	2	6	242642	242647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021009	CGC	2	6	242651	242656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_021009	ATT	2	6	242679	242684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021009	GCT	2	6	243698	243703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021009	TAC	2	6	244267	244272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021009	ATC	2	6	244303	244308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021009	AC	3	6	244383	244388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_021009	CT	3	6	244683	244688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021009	TGA	2	6	244733	244738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021009	CAG	2	6	244761	244766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021009	ATT	3	9	244794	244802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021009	GTT	2	6	244878	244883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021009	GAA	2	6	244970	244975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021009	ATTGA	2	10	244980	244989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021009	GCA	2	6	245033	245038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021009	CTT	2	6	245089	245094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021009	TGA	2	6	245096	245101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021009	AT	3	6	245138	245143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021009	TGA	2	6	245159	245164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021009	CTT	2	6	245217	245222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021009	GGA	2	6	245264	245269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021009	TAT	2	6	247061	247066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021009	TTA	2	6	247086	247091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021009	A	6	6	247091	247096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021009	GA	3	6	247129	247134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021009	ACT	2	6	247186	247191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021009	AGG	2	6	247226	247231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021009	AAC	2	6	247248	247253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021009	GAA	2	6	247298	247303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021009	TGA	2	6	247319	247324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021009	A	7	7	247344	247350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021009	TGG	2	6	247354	247359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021009	A	6	6	247549	247554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021009	AGC	2	6	247590	247595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021009	AATA	2	8	247611	247618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021009	ATA	2	6	247643	247648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021009	GAA	2	6	247713	247718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021009	TGA	2	6	247734	247739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021009	TGG	2	6	247768	247773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021009	N	1302	1302	247835	249136	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021009	TAA	2	6	249667	249672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021009	TCC	2	6	250581	250586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021009	CCG	2	6	250650	250655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_021009	GGC	2	6	250684	250689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021009	T	7	7	250690	250696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021009	A	6	6	250704	250709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021009	T	6	6	250710	250715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021009	T	6	6	250723	250728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021009	TGA	2	6	250860	250865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021009	N	788	788	250940	251727	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021009	ATT	2	6	251777	251782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021009	TCA	2	6	251792	251797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021009	T	7	7	251806	251812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021009	GAAAT	2	10	251835	251844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021009	GAAG	2	8	251848	251855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021009	TAC	3	9	256162	256170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021009	AGG	2	6	256194	256199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021009	TGG	2	6	256390	256395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021009	N	733	733	256457	257189	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021009	CCG	2	6	257510	257515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_021009	GGC	2	6	257544	257549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021009	T	7	7	257550	257556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021009	A	6	6	257564	257569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021009	T	6	6	257570	257575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021009	TGAA	2	8	257639	257646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021009	GTT	2	6	257651	257656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021009	AAAG	2	8	257686	257693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021009	CAT	3	9	257741	257749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021009	ATG	2	6	257768	257773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021009	ATG	2	6	257783	257788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021009	AGA	2	6	257805	257810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021009	GAT	2	6	257842	257847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021009	ATG	3	9	257852	257860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021009	ATT	2	6	257867	257872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021009	GAAA	2	8	257891	257898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021009	AGT	2	6	257910	257915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021009	GTTCA	2	10	257924	257933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_021009	A	6	6	257964	257969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021009	A	7	7	258042	258048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021009	A	10	10	259789	259798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021009	TA	3	6	259818	259823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021009	TAA	2	6	259833	259838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021009	ACT	2	6	259839	259844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021009	TGA	2	6	261899	261904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021009	TGG	2	6	261905	261910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021009	ATTT	2	8	261915	261922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021009	GAA	2	6	261978	261983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021009	A	7	7	261982	261988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021009	N	836	836	262014	262849	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021009	TAA	2	6	263586	263591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021009	GAAAA	2	10	264009	264018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021009	ATG	2	6	264024	264029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021009	ATA	2	6	264030	264035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021009	T	6	6	264038	264043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021009	CAG	2	6	264071	264076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021009	GCT	2	6	264115	264120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021009	ATGG	2	8	264165	264172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021009	ATT	2	6	265287	265292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021009	A	6	6	265319	265324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021009	TAG	2	6	265325	265330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021009	TTTC	2	8	265379	265386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_021009	ATTG	2	8	265394	265401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021009	GTA	2	6	265407	265412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021009	TA	3	6	265425	265430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021009	TGG	2	6	265451	265456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021009	A	6	6	265770	265775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021009	CCTA	2	8	265792	265799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_021009	AGA	2	6	265823	265828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021009	GGA	2	6	265853	265858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021009	A	6	6	265943	265948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021009	AAT	2	6	265951	265956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021009	A	6	6	265960	265965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021009	GAATA	2	10	265970	265979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021009	ATA	2	6	266002	266007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021009	AT	3	6	266020	266025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021009	AAAAAT	2	12	266031	266042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021009	GAT	2	6	266065	266070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021009	ATT	2	6	267273	267278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021009	GT	3	6	267286	267291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021009	T	6	6	267291	267296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021009	GAAA	2	8	267309	267316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021009	AG	3	6	267335	267340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021009	AT	3	6	268047	268052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021009	AAG	2	6	268056	268061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021009	AGT	2	6	268067	268072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021009	ATT	2	6	268097	268102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021009	TATAAA	2	12	268149	268160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021009	TGC	2	6	268181	268186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021009	GAA	2	6	268191	268196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021009	TAAGGA	2	12	268229	268240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021009	ATT	2	6	268268	268273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021009	CTT	2	6	268374	268379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021009	T	6	6	268385	268390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_021009	AGG	2	6	283534	283539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_021009	TGT	2	6	286237	286242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_021009	TGT	2	6	286264	286269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1396	NC_021009	AAAT	2	8	300595	300602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1397	NC_021009	A	7	7	300643	300649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1398	NC_021009	TGCT	2	8	300685	300692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1402	NC_021009	ATC	2	6	300772	300777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_021009	TTG	2	6	300849	300854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_021009	TAC	2	6	300861	300866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_021009	GTT	2	6	300894	300899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_021009	TA	4	8	300919	300926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_021009	TAA	2	6	302010	302015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_021009	AGG	2	6	305511	305516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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