MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021009	T	6	6	2191265	2191270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_021009	CAA	2	6	2191339	2191344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_021009	AATAT	2	10	2191345	2191354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_021009	TTG	2	6	2191385	2191390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_021009	CCT	2	6	2191436	2191441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_021009	TCAA	2	8	2191509	2191516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_021009	A	6	6	2191527	2191532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_021009	A	6	6	2191553	2191558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_021009	TAC	2	6	2191577	2191582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_021009	TA	3	6	2192322	2192327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_021009	TCA	2	6	2192353	2192358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_021009	AC	3	6	2192415	2192420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_021009	CAC	2	6	2192441	2192446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_021009	AAG	2	6	2192450	2192455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_021009	A	6	6	2195990	2195995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021009	TGTT	3	12	2195996	2196007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021009	ATG	2	6	2196026	2196031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_021009	T	6	6	2196032	2196037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_021009	T	8	8	2196042	2196049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_021009	TGA	2	6	2196094	2196099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_021009	T	6	6	2196130	2196135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_021009	N	861	861	2196255	2197115	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_021009	ATAA	2	8	2197148	2197155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021009	ATG	2	6	2197499	2197504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021009	AATG	2	8	2197525	2197532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_021009	T	9	9	2197535	2197543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_021009	ATTTT	2	10	2197578	2197587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_021009	A	6	6	2197609	2197614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_021009	A	8	8	2197700	2197707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11031	NC_021009	AAT	2	6	2198395	2198400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021009	CTTT	2	8	2198437	2198444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11033	NC_021009	A	9	9	2198459	2198467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_021009	CTC	2	6	2198468	2198473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_021009	TTTA	2	8	2198498	2198505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11037	NC_021009	TTTCT	2	10	2203696	2203705	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11038	NC_021009	T	6	6	2203748	2203753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021009	A	9	9	2203826	2203834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_021009	CATA	2	8	2203911	2203918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11043	NC_021009	CATAG	2	10	2203960	2203969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11047	NC_021009	TTTCT	2	10	2204259	2204268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11048	NC_021009	AAT	2	6	2204301	2204306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11051	NC_021009	GGA	2	6	2204606	2204611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_021009	CCTG	2	8	2204625	2204632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_021009	TC	3	6	2204635	2204640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_021009	T	6	6	2205811	2205816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021009	T	8	8	2205830	2205837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021009	CT	3	6	2206243	2206248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11057	NC_021009	TTC	2	6	2206296	2206301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11061	NC_021009	TTA	2	6	2207369	2207374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021009	TCC	2	6	2207399	2207404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_021009	ACA	2	6	2207409	2207414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_021009	GATT	2	8	2207445	2207452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11069	NC_021009	TTC	2	6	2208363	2208368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021009	CAGG	2	8	2208377	2208384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11071	NC_021009	CTTCT	2	10	2208461	2208470	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11072	NC_021009	GA	3	6	2208519	2208524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11077	NC_021009	A	6	6	2209141	2209146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11083	NC_021009	ATT	2	6	2209500	2209505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_021009	TCG	2	6	2210420	2210425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_021009	T	7	7	2210428	2210434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021009	AAGA	2	8	2210435	2210442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_021009	TAA	2	6	2210476	2210481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021009	CTTCA	2	10	2210482	2210491	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11100	NC_021009	TC	3	6	2210500	2210505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11101	NC_021009	CAT	2	6	2210515	2210520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11109	NC_021009	CTC	2	6	2210752	2210757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11114	NC_021009	TGC	2	6	2210857	2210862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11117	NC_021009	ATT	2	6	2210941	2210946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_021009	TCTTT	2	10	2211042	2211051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11121	NC_021009	CTCC	2	8	2211097	2211104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11122	NC_021009	TAT	2	6	2211119	2211124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_021009	T	9	9	2211183	2211191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021009	AAT	2	6	2211209	2211214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_021009	ATA	2	6	2211233	2211238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_021009	TTC	2	6	2211239	2211244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_021009	AAGG	2	8	2211386	2211393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_021009	GATA	2	8	2211766	2211773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_021009	GGA	2	6	2211802	2211807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_021009	ACC	2	6	2212328	2212333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11131	NC_021009	GGT	2	6	2212357	2212362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_021009	A	6	6	2212376	2212381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_021009	ATT	2	6	2212401	2212406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_021009	TTC	2	6	2212436	2212441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11135	NC_021009	CTT	2	6	2212444	2212449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11136	NC_021009	TTTC	2	8	2212453	2212460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11137	NC_021009	AGAA	2	8	2212470	2212477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11138	NC_021009	AAG	2	6	2212485	2212490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11139	NC_021009	TAT	2	6	2212518	2212523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_021009	AGA	2	6	2212548	2212553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11141	NC_021009	ACT	2	6	2212574	2212579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11142	NC_021009	T	6	6	2213251	2213256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11143	NC_021009	TG	3	6	2213272	2213277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_021009	AGAAGC	2	12	2213317	2213328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11145	NC_021009	ACT	2	6	2213331	2213336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11146	NC_021009	TCA	2	6	2214053	2214058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11147	NC_021009	CGGG	2	8	2214095	2214102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11148	NC_021009	CCTG	2	8	2214121	2214128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11149	NC_021009	TC	3	6	2214131	2214136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11150	NC_021009	GTT	2	6	2214159	2214164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11151	NC_021009	ATG	2	6	2214187	2214192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11152	NC_021009	N	453	453	2214197	2214649	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11153	NC_021009	TCA	2	6	2214669	2214674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11154	NC_021009	CTTT	2	8	2214683	2214690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11155	NC_021009	A	6	6	2214697	2214702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11156	NC_021009	ATT	2	6	2215197	2215202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11157	NC_021009	TCC	2	6	2215203	2215208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11158	NC_021009	TCT	2	6	2215211	2215216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11159	NC_021009	AATA	2	8	2215796	2215803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11160	NC_021009	TATT	2	8	2215810	2215817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11161	NC_021009	TCC	2	6	2217236	2217241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11162	NC_021009	TTGT	2	8	2217249	2217256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11163	NC_021009	ACA	2	6	2217282	2217287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11164	NC_021009	CGG	2	6	2217317	2217322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11165	NC_021009	TCA	2	6	2217354	2217359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11166	NC_021009	CATA	2	8	2217421	2217428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11167	NC_021009	CTTC	2	8	2217526	2217533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11168	NC_021009	CCTCTT	2	12	2217629	2217640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11169	NC_021009	ACAG	2	8	2217661	2217668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11172	NC_021009	CCT	2	6	2219027	2219032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11175	NC_021009	TCT	2	6	2219762	2219767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11176	NC_021009	CT	3	6	2219766	2219771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11177	NC_021009	T	8	8	2219782	2219789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11178	NC_021009	CTC	2	6	2219792	2219797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11185	NC_021009	T	8	8	2220404	2220411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11186	NC_021009	A	9	9	2220412	2220420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11191	NC_021009	TCT	2	6	2221036	2221041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11244	NC_021009	AC	3	6	2226114	2226119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11245	NC_021009	GAC	2	6	2226157	2226162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11246	NC_021009	A	6	6	2226172	2226177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11247	NC_021009	GTC	2	6	2226185	2226190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11249	NC_021009	GGATT	2	10	2230272	2230281	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11250	NC_021009	TCT	2	6	2230796	2230801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11252	NC_021009	ATA	2	6	2232696	2232701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_021009	T	7	7	2232706	2232712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_021009	AGC	2	6	2232722	2232727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_021009	A	7	7	2232730	2232736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_021009	A	6	6	2232739	2232744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11257	NC_021009	TCGA	2	8	2232749	2232756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11258	NC_021009	AGG	2	6	2232816	2232821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11259	NC_021009	AGA	2	6	2233383	2233388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11260	NC_021009	T	8	8	2233410	2233417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11261	NC_021009	A	6	6	2233419	2233424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_021009	ACA	2	6	2233617	2233622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11263	NC_021009	TTAA	2	8	2233641	2233648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11264	NC_021009	GTT	2	6	2233657	2233662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11266	NC_021009	CTT	2	6	2233745	2233750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11272	NC_021009	A	7	7	2233964	2233970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11273	NC_021009	TTTTTC	2	12	2234024	2234035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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11282	NC_021009	N	754	754	2235750	2236503	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11288	NC_021009	T	6	6	2236637	2236642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11306	NC_021009	T	7	7	2237697	2237703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11415	NC_021009	T	6	6	2248314	2248319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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