MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/LST high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020975	A	6	6	400666	400671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020975	A	7	7	400689	400695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020975	AAGCG	2	10	400745	400754	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_020975	A	6	6	401418	401423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020975	TCT	2	6	401434	401439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020975	TTC	2	6	401458	401463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_020975	GAA	2	6	401498	401503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020975	TCAT	2	8	401510	401517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_020975	AGA	2	6	401579	401584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020975	GTT	2	6	403585	403590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020975	CCT	2	6	403591	403596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_020975	CAAA	2	8	403646	403653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_020975	A	6	6	403668	403673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020975	GAG	2	6	403708	403713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020975	A	6	6	403741	403746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020975	T	6	6	403783	403788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020975	T	6	6	403794	403799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020975	TAA	2	6	406045	406050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020975	A	6	6	406049	406054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020975	AAC	2	6	406063	406068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020975	TAA	2	6	406095	406100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020975	TAA	2	6	406130	406135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020975	TATCT	2	10	406273	406282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_020975	TTA	2	6	406297	406302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020975	T	6	6	406319	406324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020975	GGA	2	6	406343	406348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_020975	TAA	2	6	408903	408908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_020975	A	7	7	421289	421295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020975	T	6	6	421298	421303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_020975	GTT	2	6	421335	421340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_020975	GTAA	2	8	423257	423264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1065	NC_020975	CTG	2	6	423366	423371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1073	NC_020975	A	6	6	426097	426102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020975	T	6	6	426113	426118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020975	CT	3	6	427110	427115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1083	NC_020975	A	7	7	427509	427515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020975	GA	3	6	429151	429156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_020975	A	7	7	433190	433196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020975	CTCTT	2	10	433201	433210	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_020975	GAAGA	2	10	433211	433220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020975	ATG	2	6	433230	433235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_020975	AATTT	2	10	433511	433520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1103	NC_020975	GTA	2	6	437243	437248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_020975	TCT	2	6	437344	437349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020975	AAAT	2	8	437369	437376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020975	AGC	2	6	437397	437402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020975	CT	3	6	437420	437425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_020975	TTC	2	6	437452	437457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_020975	AC	3	6	437458	437463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_020975	ACA	2	6	439551	439556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020975	CA	3	6	439927	439932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_020975	TAAC	2	8	439935	439942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1118	NC_020975	T	6	6	440040	440045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020975	CT	3	6	441331	441336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_020975	CCA	2	6	441382	441387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1125	NC_020975	TTA	2	6	444835	444840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_020975	CTTC	2	8	444954	444961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_020975	T	8	8	450591	450598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020975	A	6	6	450599	450604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020975	CT	3	6	450613	450618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_020975	TCTT	2	8	450619	450626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_020975	TAAT	2	8	450632	450639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020975	CAT	2	6	450713	450718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020975	CTA	2	6	450734	450739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_020975	ATT	2	6	452921	452926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020975	T	6	6	452938	452943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020975	CTT	2	6	452998	453003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_020975	T	6	6	453055	453060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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