MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 2609

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020971	A	6	6	999352	999357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020971	T	7	7	999358	999364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020971	T	7	7	999367	999373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020971	T	6	6	999375	999380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020971	TC	3	6	999396	999401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_020971	TAA	2	6	999404	999409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020971	ATA	2	6	999412	999417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020971	CTTT	2	8	999452	999459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2509	NC_020971	GA	3	6	999477	999482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020971	TCT	2	6	999497	999502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_020971	TTC	2	6	999533	999538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_020971	GGAA	2	8	999554	999561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020971	GGA	2	6	999567	999572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020971	ATT	2	6	999582	999587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_020971	A	6	6	999856	999861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020971	AGA	2	6	1001970	1001975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020971	TAA	2	6	1003333	1003338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_020971	A	6	6	1005182	1005187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_020971	GAAG	2	8	1005197	1005204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020971	AG	3	6	1005217	1005222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020971	CGCC	2	8	1006636	1006643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2522	NC_020971	CGGGG	2	10	1006659	1006668	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_020971	CTG	2	6	1008407	1008412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_020971	AG	3	6	1008466	1008471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020971	CT	3	6	1008480	1008485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_020971	AGT	2	6	1008546	1008551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020971	TCA	2	6	1008563	1008568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_020971	GAG	2	6	1008636	1008641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020971	G	6	6	1008641	1008646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_020971	CAA	2	6	1008680	1008685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_020971	AG	3	6	1008768	1008773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020971	T	6	6	1008794	1008799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_020971	AAG	2	6	1008800	1008805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020971	TATTT	2	10	1008817	1008826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_020971	GTG	2	6	1008844	1008849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_020971	T	6	6	1008862	1008867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_020971	GAT	2	6	1008919	1008924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_020971	CTT	2	6	1008959	1008964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_020971	CTGT	2	8	1009032	1009039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_020971	TA	3	6	1009049	1009054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020971	ATT	2	6	1009079	1009084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020971	TTG	2	6	1012398	1012403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020971	TAA	2	6	1012415	1012420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020971	AGG	2	6	1018453	1018458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020971	GCA	2	6	1018507	1018512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_020971	AT	3	6	1018533	1018538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020971	AGG	2	6	1018543	1018548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020971	CAT	2	6	1018559	1018564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_020971	GTA	2	6	1018585	1018590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020971	GAA	2	6	1018598	1018603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020971	T	8	8	1018643	1018650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020971	AGA	2	6	1018702	1018707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020971	AGA	2	6	1018717	1018722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020971	GGT	2	6	1018791	1018796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020971	TCT	2	6	1018886	1018891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_020971	TATT	2	8	1018909	1018916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020971	T	6	6	1018937	1018942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020971	TTA	2	6	1020186	1020191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020971	T	6	6	1020222	1020227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020971	TAGAA	2	10	1020245	1020254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020971	TCC	2	6	1020266	1020271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_020971	AGG	2	6	1020305	1020310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020971	ATA	2	6	1020322	1020327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020971	GAAA	2	8	1020369	1020376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020971	GAT	2	6	1020377	1020382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020971	TTA	2	6	1024694	1024699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020971	AAT	2	6	1024708	1024713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020971	AAAC	2	8	1024753	1024760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_020971	TTA	2	6	1024776	1024781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020971	A	6	6	1024787	1024792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020971	CTG	2	6	1024801	1024806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_020971	TC	3	6	1024853	1024858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_020971	TTAA	2	8	1026149	1026156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020971	AAAG	2	8	1026163	1026170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020971	AT	3	6	1026172	1026177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020971	T	6	6	1026194	1026199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_020971	ATT	2	6	1032360	1032365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020971	AG	3	6	1032377	1032382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_020971	ATT	2	6	1032425	1032430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_020971	T	6	6	1032433	1032438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020971	TAAT	2	8	1032450	1032457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020971	TC	3	6	1032462	1032467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_020971	TG	3	6	1032474	1032479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_020971	TTC	2	6	1038655	1038660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_020971	GTT	2	6	1038672	1038677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020971	GAT	2	6	1038688	1038693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020971	A	6	6	1038715	1038720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020971	CT	3	6	1038728	1038733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_020971	AG	3	6	1038742	1038747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_020971	CAAA	2	8	1038767	1038774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_020971	CTTT	2	8	1038783	1038790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_020971	A	6	6	1038794	1038799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020971	AAG	2	6	1038878	1038883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_020971	TGT	2	6	1038887	1038892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_020971	TAA	3	9	1038931	1038939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_020971	A	6	6	1038938	1038943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020971	TTA	2	6	1038976	1038981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020971	A	7	7	1039604	1039610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020971	AG	4	8	1039622	1039629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020971	AGA	2	6	1042339	1042344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_020971	A	8	8	1042354	1042361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_020971	TAA	2	6	1042363	1042368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020971	A	6	6	1042483	1042488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020971	AAT	2	6	1042492	1042497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020971	TATT	2	8	1042514	1042521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020971	T	7	7	1042527	1042533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020971	TAAAAT	2	12	1042546	1042557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020971	TTTTA	2	10	1042562	1042571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_020971	GGTT	2	8	1042578	1042585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.