MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020971	CGT	2	6	428713	428718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1004	NC_020971	A	6	6	428833	428838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020971	T	7	7	428841	428847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020971	CT	3	6	429933	429938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_020971	A	6	6	429943	429948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020971	T	6	6	429959	429964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020971	CT	3	6	430956	430961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_020971	AACT	2	8	431003	431010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_020971	GAT	2	6	431035	431040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020971	A	8	8	431083	431090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020971	A	7	7	431288	431294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020971	AG	3	6	431303	431308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020971	TAAAA	2	10	431335	431344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020971	CAAA	2	8	431351	431358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_020971	A	7	7	431356	431362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020971	GA	3	6	432998	433003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020971	CTT	2	6	433005	433010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_020971	ACTC	2	8	436043	436050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_020971	A	8	8	436096	436103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020971	TCT	2	6	436967	436972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020971	AC	3	6	436997	437002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_020971	AGAAA	2	10	437010	437019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020971	A	7	7	437038	437044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020971	CTCTT	2	10	437049	437058	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1027	NC_020971	GAAGA	2	10	437059	437068	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020971	ATG	2	6	437078	437083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020971	ATG	2	6	437086	437091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_020971	AATTT	2	10	437367	437376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1044	NC_020971	AGC	2	6	441253	441258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1064	NC_020971	T	8	8	454443	454450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020971	A	6	6	454451	454456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020971	CT	3	6	454465	454470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1075	NC_020971	CT	3	6	456918	456923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1104	NC_020971	A	6	6	467165	467170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020971	ATA	2	6	467174	467179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020971	AT	3	6	467213	467218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_020971	TA	3	6	468630	468635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_020971	TAT	2	6	468706	468711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020971	GA	3	6	468728	468733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_020971	TAC	2	6	470120	470125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_020971	GTT	2	6	470131	470136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_020971	T	9	9	480501	480509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020971	CAT	2	6	480532	480537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1125	NC_020971	A	6	6	486004	486009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020971	CAAAA	2	10	486022	486031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_020971	A	8	8	486028	486035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020971	AC	3	6	486037	486042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_020971	GA	4	8	486082	486089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020971	CA	3	6	486119	486124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_020971	TC	3	6	486160	486165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_020971	ACT	3	9	486177	486185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1134	NC_020971	AGAA	2	8	486223	486230	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020971	T	6	6	486240	486245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020971	T	6	6	486263	486268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020971	A	6	6	486292	486297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020971	A	6	6	486350	486355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020971	CAA	2	6	486433	486438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_020971	GTT	2	6	486453	486458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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