MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1504	NC_020967	AG	3	6	617047	617052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020967	A	6	6	617060	617065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020967	GGAA	2	8	617075	617082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020967	A	7	7	617087	617093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020967	TATT	2	8	617987	617994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020967	TAA	2	6	617996	618001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020967	AAAT	2	8	618019	618026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020967	T	7	7	618026	618032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020967	TCTTTT	2	12	618073	618084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1513	NC_020967	T	6	6	618081	618086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020967	ATG	2	6	618087	618092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020967	TTA	2	6	618101	618106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020967	CTT	2	6	619098	619103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_020967	T	6	6	620603	620608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020967	CAG	2	6	620646	620651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_020967	CT	3	6	621971	621976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_020967	T	7	7	621999	622005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020967	T	6	6	622010	622015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020967	GTT	2	6	622029	622034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020967	T	6	6	622045	622050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1526	NC_020967	GAT	2	6	623722	623727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1610	NC_020967	TCT	2	6	665923	665928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1616	NC_020967	CT	3	6	670731	670736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1621	NC_020967	A	6	6	673969	673974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020967	TC	4	8	673976	673983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_020967	GAA	2	6	673988	673993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_020967	AC	3	6	674166	674171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_020967	GAAT	2	8	674183	674190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020967	CAT	2	6	674192	674197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1632	NC_020967	CCT	2	6	674252	674257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1634	NC_020967	CAT	2	6	674309	674314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_020967	GAAG	2	8	675221	675228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020967	ACA	2	6	677350	677355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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