MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020964	GGAA	2	8	617277	617284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020964	A	7	7	617289	617295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020964	TATT	2	8	618189	618196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020964	TAA	2	6	618198	618203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020964	AAAT	2	8	618221	618228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020964	T	7	7	618228	618234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020964	TCTTTT	2	12	618275	618286	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_020964	T	6	6	618283	618288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020964	ATG	2	6	618289	618294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020964	TTA	2	6	618303	618308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020964	CTT	2	6	619300	619305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_020964	T	6	6	620805	620810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020964	CAG	2	6	620848	620853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020964	CT	3	6	622173	622178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_020964	T	7	7	622201	622207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020964	T	6	6	622212	622217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020964	GTT	2	6	622231	622236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020964	T	6	6	622247	622252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020964	TTCT	2	8	622262	622269	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_020964	TCT	2	6	623873	623878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_020964	GAT	2	6	623924	623929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020964	T	6	6	623957	623962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020964	TAAG	2	8	625242	625249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020964	A	6	6	625278	625283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020964	AGA	2	6	625291	625296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_020964	A	8	8	637150	637157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020964	T	6	6	637168	637173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1553	NC_020964	A	6	6	646298	646303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1555	NC_020964	A	8	8	646349	646356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_020964	A	7	7	646386	646392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_020964	TCT	2	6	666125	666130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1610	NC_020964	A	6	6	670927	670932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020964	CT	3	6	670933	670938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1617	NC_020964	TC	4	8	674178	674185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1621	NC_020964	AAGA	2	8	674313	674320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020964	CA	3	6	674350	674355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_020964	AC	3	6	674368	674373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_020964	GAAT	2	8	674385	674392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_020964	CAT	2	6	674511	674516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1631	NC_020964	AATC	2	8	675396	675403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_020964	TCAA	2	8	675408	675415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_020964	GAAG	2	8	675423	675430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_020964	GTT	2	6	677595	677600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020964	AC	3	6	677620	677625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2000	NC_020964	A	7	7	854673	854679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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