MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 2622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020939	AGA	2	6	414222	414227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020939	TTA	2	6	414261	414266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020939	TGA	2	6	414272	414277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020939	CCA	2	6	418223	418228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_020939	GCA	2	6	418277	418282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020939	GTATA	2	10	418283	418292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020939	AGCAA	2	10	418319	418328	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_020939	ATTT	2	8	418354	418361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020939	AGAA	2	8	418364	418371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020939	A	7	7	420127	420133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020939	CAA	2	6	420146	420151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_020939	ATTA	2	8	420153	420160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020939	AAC	2	6	420162	420167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_020939	AAAAT	2	10	420168	420177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020939	A	7	7	420190	420196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020939	A	6	6	420235	420240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020939	T	8	8	425719	425726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020939	TGC	2	6	425730	425735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1021	NC_020939	A	7	7	426574	426580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020939	T	6	6	426583	426588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020939	GTT	2	6	426620	426625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020939	AGG	2	6	428070	428075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020939	AGG	2	6	428672	428677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020939	CGT	2	6	430150	430155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1051	NC_020939	A	7	7	438474	438480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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