MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 2622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020939	TGC	2	6	188664	188669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020939	AGT	2	6	188732	188737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020939	AGT	2	6	188755	188760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020939	TTG	2	6	188763	188768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020939	TAT	2	6	188843	188848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020939	T	6	6	188862	188867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020939	GCA	2	6	188915	188920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020939	CTT	2	6	188930	188935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020939	GGAC	2	8	188957	188964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_020939	AAG	2	6	189067	189072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020939	TTG	2	6	189089	189094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020939	CAT	2	6	189099	189104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020939	AT	3	6	194363	194368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020939	TGT	2	6	194377	194382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020939	ATGC	2	8	194737	194744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_020939	GTT	2	6	194745	194750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020939	GCA	2	6	194798	194803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020939	CTTT	2	8	194878	194885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_020939	AAG	2	6	194925	194930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020939	T	6	6	194975	194980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020939	ATT	2	6	194988	194993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020939	T	6	6	195004	195009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020939	TATGAA	2	12	196979	196990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020939	AGA	2	6	197035	197040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020939	AAC	2	6	197042	197047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020939	ATA	2	6	197062	197067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020939	T	7	7	197087	197093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020939	TGA	2	6	197197	197202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020939	CTC	2	6	197970	197975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_020939	CTA	2	6	198292	198297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020939	ATTT	2	8	198325	198332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020939	A	7	7	198811	198817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020939	AG	3	6	198833	198838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020939	AAT	2	6	198843	198848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020939	T	8	8	198863	198870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020939	T	6	6	198909	198914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020939	TAC	2	6	198953	198958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020939	ATT	2	6	198962	198967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020939	A	8	8	201757	201764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020939	CTT	2	6	201796	201801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020939	A	7	7	201806	201812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020939	TC	3	6	201823	201828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_020939	CTT	2	6	201832	201837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020939	ACGA	2	8	204442	204449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_020939	CTAAG	2	10	204608	204617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
546	NC_020939	AGA	2	6	204696	204701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020939	T	6	6	204716	204721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020939	A	7	7	204733	204739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020939	T	6	6	205506	205511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020939	CAT	2	6	205535	205540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_020939	CT	3	6	205581	205586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_020939	AAT	2	6	205628	205633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020939	TAG	2	6	205664	205669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020939	AAT	2	6	205677	205682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020939	AAG	2	6	205775	205780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020939	CTT	2	6	205786	205791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020939	GA	4	8	208640	208647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020939	T	7	7	208670	208676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020939	CT	4	8	208688	208695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_020939	A	6	6	208697	208702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020939	CCTT	2	8	217862	217869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_020939	GAA	2	6	217884	217889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020939	TTG	2	6	217901	217906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020939	A	6	6	217913	217918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020939	TAC	2	6	218590	218595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020939	CTT	2	6	218653	218658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_020939	CTC	2	6	218678	218683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_020939	T	7	7	218692	218698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020939	CTA	2	6	218730	218735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020939	A	7	7	219926	219932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020939	TAA	2	6	219933	219938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020939	AG	4	8	219958	219965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020939	A	6	6	219983	219988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020939	GAA	2	6	219993	219998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020939	TA	3	6	221512	221517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020939	GTC	2	6	221531	221536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_020939	CTAT	2	8	221586	221593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_020939	T	6	6	221602	221607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020939	ATT	2	6	221704	221709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020939	TCT	2	6	221729	221734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020939	TCC	2	6	221781	221786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020939	ATG	2	6	221804	221809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020939	GCAA	2	8	221829	221836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_020939	TTTTAC	2	12	222988	222999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
585	NC_020939	A	7	7	223051	223057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020939	TAA	2	6	223105	223110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020939	ATTTC	2	10	223132	223141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_020939	CT	3	6	223153	223158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_020939	AATT	2	8	223165	223172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020939	CTTG	2	8	223514	223521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_020939	T	6	6	223569	223574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020939	TC	3	6	226154	226159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_020939	AG	3	6	226185	226190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020939	CAATA	2	10	226255	226264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
595	NC_020939	TAA	2	6	227228	227233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020939	AAAC	2	8	227244	227251	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_020939	T	8	8	229719	229726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020939	TCCT	2	8	229869	229876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_020939	AGA	2	6	229921	229926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020939	ATT	2	6	229958	229963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020939	AAC	2	6	236360	236365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020939	AGA	2	6	236387	236392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020939	GAG	2	6	236404	236409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020939	GCT	2	6	236456	236461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020939	ACC	2	6	236465	236470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_020939	A	6	6	236496	236501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020939	ACT	2	6	236560	236565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_020939	TGT	2	6	240365	240370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020939	TC	3	6	240385	240390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_020939	AG	3	6	240411	240416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020939	CAT	2	6	240480	240485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020939	T	8	8	240487	240494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020939	A	6	6	243582	243587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020939	CA	3	6	245337	245342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_020939	TCT	2	6	245422	245427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020939	AAAT	2	8	245486	245493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020939	AAGA	2	8	245505	245512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020939	GT	3	6	245554	245559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020939	T	6	6	245565	245570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020939	TTTC	2	8	248106	248113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_020939	TAAA	2	8	248940	248947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020939	ATA	2	6	248962	248967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020939	TTA	2	6	248983	248988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020939	AGG	2	6	249044	249049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020939	T	6	6	249940	249945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020939	TACAA	2	10	249969	249978	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
627	NC_020939	ATA	2	6	250001	250006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020939	GA	3	6	252422	252427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020939	GCG	2	6	252462	252467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020939	ACT	2	6	252482	252487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020939	TG	3	6	252532	252537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020939	AATA	2	8	252599	252606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020939	T	6	6	252621	252626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020939	T	7	7	252640	252646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020939	A	6	6	252648	252653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020939	ACA	2	6	252748	252753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_020939	CTT	2	6	252755	252760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020939	AAG	2	6	252786	252791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020939	GCA	2	6	252805	252810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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