MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 2653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020931	ACT	2	6	975759	975764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_020931	GTG	2	6	975771	975776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020931	GAA	2	6	975863	975868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020931	CTC	2	6	975873	975878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_020931	TAA	2	6	975964	975969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020931	TGT	2	6	975980	975985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020931	AAT	2	6	976118	976123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020931	T	7	7	976154	976160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2512	NC_020931	TGG	2	6	976294	976299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020931	GGA	2	6	976418	976423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020931	TCA	2	6	976479	976484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020931	AG	3	6	976485	976490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_020931	ATG	2	6	976588	976593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020931	T	6	6	976601	976606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2519	NC_020931	T	8	8	979096	979103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2522	NC_020931	T	8	8	981443	981450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2525	NC_020931	ATTT	2	8	981536	981543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2533	NC_020931	ATA	2	6	986911	986916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2553	NC_020931	A	6	6	995645	995650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020931	T	7	7	995651	995657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020931	T	6	6	995666	995671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2564	NC_020931	GGA	2	6	995858	995863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020931	ATT	2	6	995873	995878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020931	A	6	6	996147	996152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020931	TAA	2	6	999626	999631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2603	NC_020931	AGA	2	6	1015008	1015013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020931	GGT	2	6	1015082	1015087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020931	TCT	2	6	1015177	1015182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_020931	GT	3	6	1015197	1015202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020931	T	6	6	1015228	1015233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2610	NC_020931	AGG	2	6	1016595	1016600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020931	ATA	2	6	1016612	1016617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_020931	GAAA	2	8	1016659	1016666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020931	GAT	2	6	1016667	1016672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020931	TTA	2	6	1020986	1020991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020931	AAT	2	6	1021001	1021006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_020931	TTAA	2	8	1022420	1022427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_020931	AAAG	2	8	1022434	1022441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_020931	ATT	2	6	1022443	1022448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2631	NC_020931	A	6	6	1034959	1034964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_020931	CT	3	6	1034972	1034977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_020931	AG	3	6	1034986	1034991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_020931	CAAA	2	8	1035011	1035018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_020931	T	8	8	1035028	1035035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_020931	A	6	6	1035039	1035044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_020931	AAG	2	6	1035123	1035128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_020931	TGT	2	6	1035132	1035137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_020931	TAA	3	9	1035176	1035184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_020931	A	6	6	1035183	1035188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_020931	TTA	2	6	1035221	1035226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_020931	A	7	7	1035879	1035885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_020931	AGA	2	6	1038614	1038619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_020931	A	8	8	1038629	1038636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_020931	TAA	2	6	1038638	1038643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_020931	A	6	6	1038758	1038763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_020931	AAT	2	6	1038767	1038772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_020931	TATT	2	8	1038789	1038796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_020931	T	7	7	1038802	1038808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_020931	AATTTT	2	12	1038809	1038820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_020931	TAAAAT	2	12	1038821	1038832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_020931	TTTTA	2	10	1038837	1038846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_020931	GGTT	2	8	1038853	1038860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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