MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 9366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	GGT	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020887	AT	3	6	41	46	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020887	TGC	2	6	50	55	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020887	AAG	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020887	T	6	6	117	122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020887	T	6	6	130	135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020887	T	6	6	196	201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020887	GGA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020887	T	8	8	1570	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020887	CAA	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020887	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020887	T	8	8	1616	1623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020887	AT	3	6	1635	1640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020887	A	6	6	1671	1676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020887	A	6	6	1727	1732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020887	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020887	TTA	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020887	AAT	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020887	ATT	3	9	4023	4031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020887	A	6	6	4321	4326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020887	GGA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020887	T	7	7	6304	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020887	GTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020887	GCT	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020887	ACAA	2	8	6391	6398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020887	TGATAT	2	12	6406	6417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020887	TCG	2	6	6434	6439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020887	ATT	2	6	6440	6445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020887	AGTA	2	8	6587	6594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020887	T	7	7	6610	6616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020887	T	6	6	6771	6776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020887	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020887	ATC	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020887	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020887	CTT	2	6	7080	7085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020887	ACT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020887	GATA	2	8	7129	7136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020887	CCT	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020887	TTGGA	2	10	8290	8299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020887	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020887	T	6	6	8391	8396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020887	ATT	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020887	ATT	2	6	8412	8417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020887	ATT	2	6	8433	8438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020887	AAT	2	6	8484	8489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020887	T	7	7	8546	8552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020887	A	6	6	8591	8596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020887	TAAT	2	8	8602	8609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020887	ACA	2	6	8644	8649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020887	TAATT	2	10	8663	8672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020887	T	6	6	8671	8676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020887	ATA	2	6	8705	8710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020887	ATTT	2	8	8744	8751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020887	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020887	CAT	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020887	ATTA	2	8	8895	8902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020887	TAA	2	6	8934	8939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020887	GTA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020887	ATT	3	9	8971	8979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020887	ATT	2	6	9015	9020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020887	AAT	2	6	9027	9032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020887	T	6	6	9043	9048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020887	ATT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020887	TTA	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020887	ATA	2	6	9102	9107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020887	GGT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020887	T	6	6	10889	10894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020887	GGTT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020887	ATT	2	6	11535	11540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020887	A	7	7	12900	12906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020887	T	6	6	12939	12944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020887	TGGA	2	8	13028	13035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020887	ACG	2	6	13153	13158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020887	TCG	2	6	13181	13186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020887	TCC	2	6	13217	13222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020887	AT	3	6	13273	13278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020887	ATTT	2	8	13298	13305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020887	CTG	2	6	13324	13329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020887	A	6	6	13445	13450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020887	TTAT	2	8	13451	13458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020887	GAA	2	6	13483	13488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020887	TAT	2	6	13594	13599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020887	T	6	6	13742	13747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020887	AT	3	6	13764	13769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020887	ATA	2	6	13807	13812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020887	TTGAA	2	10	13819	13828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020887	AAAAT	2	10	13838	13847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020887	A	6	6	13880	13885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020887	ATA	2	6	13900	13905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020887	TAA	2	6	13909	13914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020887	AATAG	2	10	13944	13953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020887	AGG	2	6	13972	13977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020887	TAT	2	6	17807	17812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020887	ATA	2	6	17839	17844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020887	AAG	2	6	17892	17897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020887	GTTTT	2	10	19575	19584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020887	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020887	A	6	6	19609	19614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020887	ATC	2	6	19652	19657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020887	T	7	7	19663	19669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020887	TTC	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020887	GAG	2	6	19695	19700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020887	GAA	2	6	21690	21695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020887	AGG	2	6	21704	21709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020887	T	6	6	21738	21743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020887	TAA	2	6	21811	21816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020887	AT	3	6	21870	21875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020887	CA	3	6	21919	21924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020887	T	6	6	23960	23965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020887	T	7	7	23974	23980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020887	TTA	2	6	23990	23995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020887	TTA	2	6	23999	24004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020887	AAG	2	6	24030	24035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020887	TATAT	2	10	25218	25227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020887	T	6	6	25227	25232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020887	T	6	6	25263	25268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020887	AT	3	6	25301	25306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020887	ATTA	2	8	25311	25318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020887	T	7	7	25337	25343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020887	TAT	3	9	25353	25361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020887	AT	4	8	25360	25367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020887	A	6	6	25376	25381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020887	CTG	2	6	25445	25450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020887	T	8	8	25539	25546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020887	TG	3	6	25554	25559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020887	T	7	7	25674	25680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020887	ATT	2	6	25696	25701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020887	TTA	2	6	25812	25817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020887	T	6	6	25876	25881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020887	GTG	2	6	25886	25891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020887	ATT	2	6	27828	27833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020887	T	7	7	28365	28371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020887	CGT	2	6	28385	28390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020887	ATT	2	6	28433	28438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020887	ATA	2	6	28463	28468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020887	AGG	2	6	28495	28500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020887	AT	3	6	29218	29223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020887	T	6	6	29223	29228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020887	T	6	6	30891	30896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020887	T	7	7	30951	30957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020887	TCAAAA	2	12	30985	30996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_020887	T	7	7	31003	31009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020887	AAAG	2	8	31042	31049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020887	TAAA	2	8	31057	31064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020887	ATTAC	2	10	31556	31565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020887	TA	3	6	31594	31599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020887	T	8	8	31760	31767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020887	TAAA	2	8	31771	31778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020887	T	6	6	31792	31797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020887	TTA	2	6	31852	31857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020887	AATATA	2	12	31897	31908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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