MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 7047

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020549	A	6	6	1265886	1265891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_020549	AT	3	6	1265899	1265904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020549	GCGA	2	8	1266315	1266322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7004	NC_020549	TCT	2	6	1266345	1266350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_020549	ATGG	2	8	1266406	1266413	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_020549	AT	3	6	1266424	1266429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020549	AGTA	2	8	1266436	1266443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_020549	TCAT	2	8	1266455	1266462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_020549	CAGT	2	8	1266495	1266502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_020549	TTG	2	6	1266539	1266544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_020549	AAT	2	6	1266594	1266599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_020549	TA	3	6	1266615	1266620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_020549	GAT	2	6	1266635	1266640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_020549	AAG	2	6	1266664	1266669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_020549	A	6	6	1266723	1266728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_020549	TAC	2	6	1266737	1266742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_020549	A	6	6	1266746	1266751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_020549	T	8	8	1266807	1266814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_020549	AGTG	2	8	1266822	1266829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_020549	TCG	2	6	1266863	1266868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_020549	AT	3	6	1266891	1266896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_020549	ATA	2	6	1266933	1266938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_020549	A	6	6	1266984	1266989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_020549	AGAAA	2	10	1267009	1267018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_020549	AGT	2	6	1267158	1267163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_020549	TCT	2	6	1267189	1267194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_020549	T	6	6	1267238	1267243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_020549	A	6	6	1267251	1267256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_020549	AGAT	2	8	1267260	1267267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_020549	TCC	2	6	1267310	1267315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_020549	ATG	2	6	1267341	1267346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_020549	TTA	2	6	1267361	1267366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_020549	ATC	2	6	1267490	1267495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_020549	AATA	2	8	1267506	1267513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_020549	GAA	2	6	1267536	1267541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_020549	TCTTT	2	10	1267566	1267575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7037	NC_020549	GAA	2	6	1267577	1267582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_020549	AAT	2	6	1267621	1267626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_020549	AGA	2	6	1267642	1267647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_020549	TGC	2	6	1267669	1267674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_020549	AAT	2	6	1267766	1267771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_020549	CTT	2	6	1267839	1267844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_020549	AAAGA	2	10	1268065	1268074	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020549	AAT	2	6	1268109	1268114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020549	TAT	2	6	1268166	1268171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_020549	CA	3	6	1268187	1268192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_020549	ATC	2	6	1268198	1268203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous123456789101112131415Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.