MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 2605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	TA	3	6	2543	2548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020285	TTA	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020285	A	6	6	2570	2575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020285	T	6	6	8335	8340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020285	GTAA	2	8	8352	8359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020285	TAT	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020285	TAT	2	6	8393	8398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020285	TAAA	2	8	8413	8420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020285	TA	3	6	8441	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020285	GTA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020285	TA	3	6	8465	8470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020285	TGG	2	6	8497	8502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020285	TTAT	2	8	8503	8510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020285	TAG	2	6	10400	10405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020285	ATA	2	6	10500	10505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020285	T	6	6	10524	10529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020285	TAATG	2	10	12242	12251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020285	TTTTA	2	10	12262	12271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020285	AAT	2	6	12283	12288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020285	GTA	2	6	12304	12309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020285	TAT	2	6	14021	14026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020285	CTA	2	6	14054	14059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020285	AGA	2	6	14090	14095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020285	TA	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020285	TAAT	2	8	14137	14144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020285	AT	3	6	14191	14196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020285	AT	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020285	TTG	2	6	14217	14222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020285	TAT	2	6	14235	14240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020285	TAA	2	6	16348	16353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020285	A	6	6	16352	16357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020285	ATA	2	6	16439	16444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020285	ATT	2	6	16460	16465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020285	GAT	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020285	ACT	2	6	16512	16517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020285	ATG	2	6	16524	16529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020285	GCT	2	6	16589	16594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020285	AAAC	2	8	16624	16631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020285	TAA	2	6	16643	16648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020285	A	6	6	16657	16662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020285	AAATT	2	10	17739	17748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020285	GTA	2	6	17752	17757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020285	AT	3	6	17776	17781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020285	T	7	7	18571	18577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020285	ATC	2	6	18610	18615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020285	TTAA	2	8	21339	21346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020285	ATT	2	6	21353	21358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020285	TTA	2	6	22044	22049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020285	TAT	2	6	25064	25069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020285	TTC	2	6	25073	25078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020285	AAC	2	6	25086	25091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020285	TATG	2	8	25096	25103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020285	A	7	7	27098	27104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020285	TA	3	6	27122	27127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020285	TATTTT	2	12	27131	27142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020285	T	6	6	29423	29428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020285	TAAC	2	8	32313	32320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020285	TA	3	6	32351	32356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020285	ATTA	2	8	32400	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020285	AAT	2	6	32428	32433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020285	AT	3	6	32480	32485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020285	A	7	7	32495	32501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020285	T	6	6	32562	32567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020285	TG	3	6	33477	33482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020285	TAA	2	6	33505	33510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020285	T	6	6	36940	36945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020285	TAT	2	6	36966	36971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020285	AAT	2	6	37019	37024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020285	T	6	6	38433	38438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020285	AT	3	6	38445	38450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020285	TGA	2	6	38451	38456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020285	TTCA	2	8	38459	38466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020285	AGT	2	6	38481	38486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020285	TG	3	6	38506	38511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020285	ATT	2	6	38530	38535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020285	ATT	2	6	38542	38547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020285	TAT	2	6	38552	38557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020285	TAAT	2	8	38591	38598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020285	TAA	2	6	38623	38628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020285	A	6	6	38633	38638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020285	TTA	2	6	38686	38691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020285	ATG	2	6	38694	38699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020285	ATT	2	6	38711	38716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020285	TTTA	2	8	38738	38745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020285	T	6	6	38766	38771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020285	TAT	2	6	38848	38853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020285	ATT	2	6	38856	38861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020285	ATT	2	6	42533	42538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020285	T	6	6	44666	44671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020285	TAA	2	6	44682	44687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020285	A	6	6	44686	44691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020285	TAA	2	6	44702	44707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020285	TTGA	2	8	44720	44727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020285	TTA	2	6	44736	44741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020285	ATT	2	6	44748	44753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020285	TAA	2	6	44765	44770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020285	CCA	2	6	44796	44801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020285	T	7	7	44822	44828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020285	A	6	6	44884	44889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020285	TTAG	2	8	45591	45598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020285	TAT	2	6	46334	46339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020285	TGT	2	6	46381	46386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020285	TGAG	2	8	46421	46428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020285	AAT	2	6	46429	46434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020285	TAT	2	6	46438	46443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020285	CT	3	6	46461	46466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020285	AGA	2	6	46558	46563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020285	AT	4	8	46603	46610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020285	A	10	10	46620	46629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020285	A	6	6	46664	46669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020285	TCA	2	6	46700	46705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020285	GTT	2	6	46746	46751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020285	CTT	2	6	46813	46818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020285	TCA	2	6	46831	46836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020285	ATT	2	6	46901	46906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020285	GAT	2	6	46960	46965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020285	GATA	2	8	46968	46975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020285	T	6	6	47009	47014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020285	ATA	2	6	47025	47030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020285	GA	3	6	47034	47039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020285	GATA	3	12	47116	47127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020285	TTA	2	6	47145	47150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020285	CAT	2	6	47165	47170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020285	GGATA	2	10	47173	47182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020285	TTA	2	6	47189	47194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020285	TA	3	6	47210	47215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020285	T	6	6	47216	47221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020285	GTA	2	6	47267	47272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020285	TTA	2	6	47300	47305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020285	TAC	2	6	47328	47333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020285	TTC	2	6	47361	47366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020285	ATTT	2	8	47423	47430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020285	TGAT	2	8	47452	47459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020285	AGC	2	6	47474	47479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020285	AT	4	8	47516	47523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020285	AT	3	6	49134	49139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020285	ATTA	2	8	49146	49153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020285	TGTA	2	8	49168	49175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020285	AT	3	6	49198	49203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020285	TAT	2	6	49219	49224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020285	TAAA	2	8	49249	49256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020285	GAT	2	6	49263	49268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020285	T	6	6	49359	49364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020285	TAACT	2	10	49379	49388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020285	T	6	6	49443	49448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020285	TTG	2	6	49471	49476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020285	TTA	2	6	49483	49488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020285	T	9	9	49517	49525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020285	CAT	2	6	49575	49580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_020285	T	6	6	50921	50926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_020285	TTA	2	6	169451	169456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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