MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 9053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020134	A	6	6	1154453	1154458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020134	CCT	2	6	1154678	1154683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_020134	ATT	2	6	1154686	1154691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020134	GAT	2	6	1154715	1154720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020134	AAAT	2	8	1154724	1154731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020134	GGAAC	2	10	1154750	1154759	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_020134	T	6	6	1154773	1154778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020134	A	7	7	1154822	1154828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020134	TAA	2	6	1154841	1154846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020134	TCC	2	6	1156508	1156513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_020134	TGAA	2	8	1156519	1156526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020134	AT	3	6	1156562	1156567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020134	GTT	2	6	1157339	1157344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020134	A	6	6	1157373	1157378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_020134	ATT	2	6	1157389	1157394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020134	TAA	2	6	1157396	1157401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020134	T	6	6	1159219	1159224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020134	TTC	2	6	1160348	1160353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_020134	AAG	2	6	1160382	1160387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020134	TAT	2	6	1160389	1160394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020134	CTT	2	6	1162247	1162252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_020134	T	6	6	1162305	1162310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020134	T	6	6	1162346	1162351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020134	AT	3	6	1162371	1162376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020134	TCTG	2	8	1162383	1162390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_020134	ATT	2	6	1162407	1162412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020134	T	9	9	1162411	1162419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020134	TGT	2	6	1162424	1162429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020134	A	6	6	1162518	1162523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020134	GAA	2	6	1162524	1162529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020134	GTA	2	6	1162568	1162573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020134	AT	3	6	1162577	1162582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020134	TA	4	8	1162612	1162619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020134	T	8	8	1164377	1164384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020134	AAAC	2	8	1164426	1164433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_020134	GCC	2	6	1164439	1164444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_020134	TAA	2	6	1164475	1164480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020134	GC	3	6	1164499	1164504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_020134	AG	3	6	1164550	1164555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_020134	GCTG	2	8	1164564	1164571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_020134	CTT	2	6	1164618	1164623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_020134	GCG	2	6	1164630	1164635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_020134	TTCC	2	8	1164672	1164679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_020134	GGT	2	6	1164759	1164764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_020134	CAA	2	6	1165904	1165909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_020134	AGG	2	6	1168316	1168321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020134	GAA	2	6	1169655	1169660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_020134	GCA	2	6	1169684	1169689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_020134	A	8	8	1169689	1169696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020134	AT	3	6	1169726	1169731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_020134	AAT	2	6	1169737	1169742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_020134	AGT	2	6	1169763	1169768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_020134	AG	3	6	1169787	1169792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020134	AGA	2	6	1170049	1170054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020134	GAA	2	6	1170069	1170074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020134	T	6	6	1170108	1170113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_020134	A	7	7	1170137	1170143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020134	TGT	2	6	1171831	1171836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_020134	AAG	2	6	1171927	1171932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_020134	TTA	2	6	1173065	1173070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_020134	ATA	2	6	1173082	1173087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_020134	ATA	2	6	1173106	1173111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_020134	ACA	2	6	1174161	1174166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_020134	CTT	2	6	1174180	1174185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_020134	ACT	2	6	1174187	1174192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_020134	GATA	2	8	1174229	1174236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020134	CCT	2	6	1175378	1175383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_020134	TTGGA	2	10	1175390	1175399	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_020134	A	6	6	1175574	1175579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_020134	AG	3	6	1175738	1175743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_020134	T	7	7	1175783	1175789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_020134	ACAAA	2	10	1175831	1175840	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_020134	A	6	6	1175890	1175895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020134	TGA	2	6	1175898	1175903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_020134	A	6	6	1175952	1175957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_020134	GTAT	2	8	1176040	1176047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_020134	TTA	2	6	1176148	1176153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020134	AAG	2	6	1176186	1176191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_020134	A	7	7	1176201	1176207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_020134	A	6	6	1176235	1176240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_020134	ATTA	2	8	1176309	1176316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020134	AAT	2	6	1176327	1176332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020134	A	6	6	1176348	1176353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020134	TGT	2	6	1176681	1176686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020134	GTT	2	6	1176689	1176694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020134	TAA	2	6	1177212	1177217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020134	AGT	2	6	1178383	1178388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_020134	T	6	6	1178727	1178732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_020134	TAA	2	6	1182399	1182404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_020134	TTG	2	6	1187370	1187375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_020134	GGTGA	2	10	1187392	1187401	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_020134	A	6	6	1188756	1188761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020134	A	6	6	1188798	1188803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_020134	A	6	6	1188822	1188827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_020134	AGG	2	6	1188877	1188882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_020134	T	6	6	1188883	1188888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_020134	AGC	2	6	1189731	1189736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_020134	T	8	8	1189746	1189753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_020134	A	7	7	1190348	1190354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_020134	A	6	6	1190361	1190366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_020134	TAAA	2	8	1190367	1190374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_020134	TTTAT	2	10	1190407	1190416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_020134	TTG	2	6	1190454	1190459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_020134	TAA	2	6	1190461	1190466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_020134	TTA	2	6	1190472	1190477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_020134	GTG	2	6	1190478	1190483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_020134	ATG	2	6	1190518	1190523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020134	AAT	2	6	1190534	1190539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_020134	CCG	2	6	1192122	1192127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_020134	TA	3	6	1192174	1192179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_020134	CAA	2	6	1192650	1192655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_020134	AGG	2	6	1192665	1192670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_020134	T	6	6	1195548	1195553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_020134	TAA	2	6	1195736	1195741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_020134	AG	3	6	1195747	1195752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020134	ACA	2	6	1196775	1196780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_020134	T	6	6	1196883	1196888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_020134	TTAAA	2	10	1196906	1196915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020134	TAC	2	6	1196921	1196926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_020134	TTTA	2	8	1197526	1197533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020134	AGG	2	6	1197540	1197545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_020134	TTC	2	6	1197577	1197582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_020134	A	7	7	1197584	1197590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_020134	GGTAA	2	10	1197611	1197620	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_020134	T	9	9	1198147	1198155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_020134	T	6	6	1198166	1198171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_020134	TTA	2	6	1198177	1198182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_020134	TGTC	2	8	1198282	1198289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_020134	TAT	3	9	1198299	1198307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_020134	A	6	6	1198311	1198316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_020134	TA	3	6	1200553	1200558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_020134	T	6	6	1200604	1200609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_020134	AGGA	2	8	1202362	1202369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_020134	T	6	6	1203439	1203444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_020134	A	6	6	1203491	1203496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3906	NC_020134	AGGAC	2	10	1318549	1318558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3907	NC_020134	TAT	2	6	1318566	1318571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3908	NC_020134	GAAC	2	8	1318600	1318607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3909	NC_020134	TAA	2	6	1318616	1318621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3912	NC_020134	AGTA	2	8	1318664	1318671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3913	NC_020134	AG	3	6	1318691	1318696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3914	NC_020134	AAG	2	6	1318715	1318720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3920	NC_020134	CATA	2	8	1319045	1319052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3922	NC_020134	ATTT	2	8	1320365	1320372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3924	NC_020134	T	6	6	1320426	1320431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3927	NC_020134	A	6	6	1320543	1320548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3928	NC_020134	A	6	6	1320703	1320708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3929	NC_020134	T	6	6	1325442	1325447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3933	NC_020134	GGT	2	6	1328177	1328182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3934	NC_020134	TA	4	8	1328184	1328191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3935	NC_020134	ATG	2	6	1328240	1328245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3937	NC_020134	AT	3	6	1328275	1328280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3938	NC_020134	GGT	2	6	1328291	1328296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3940	NC_020134	A	6	6	1329196	1329201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3944	NC_020134	AT	3	6	1331561	1331566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3945	NC_020134	AT	3	6	1331571	1331576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3946	NC_020134	TAAAA	2	10	1331614	1331623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3950	NC_020134	ATTTT	2	10	1333575	1333584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3962	NC_020134	TGAG	2	8	1335094	1335101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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