MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 9053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020134	TCT	2	6	163470	163475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020134	TTA	2	6	163483	163488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020134	GA	3	6	163495	163500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020134	TTA	2	6	164720	164725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020134	A	6	6	165700	165705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020134	GAAG	2	8	167611	167618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020134	ATT	2	6	167650	167655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020134	T	7	7	167690	167696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020134	CAATA	2	10	167728	167737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
510	NC_020134	T	6	6	167746	167751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020134	CAG	2	6	167824	167829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_020134	TCA	2	6	167879	167884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020134	GCA	2	6	167940	167945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020134	TTA	2	6	167952	167957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020134	CGG	2	6	167983	167988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_020134	GAT	2	6	168047	168052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020134	GAT	2	6	168158	168163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020134	GAAA	2	8	168177	168184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020134	GAAA	2	8	168236	168243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020134	ATT	3	9	168257	168265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020134	TTA	2	6	168291	168296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020134	TCCT	2	8	168342	168349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_020134	AG	3	6	168425	168430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020134	TGT	2	6	168433	168438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020134	GAA	2	6	168449	168454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020134	GCAG	2	8	168525	168532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_020134	CTT	2	6	168537	168542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020134	ATG	2	6	168591	168596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020134	TA	3	6	168597	168602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020134	GGA	2	6	168676	168681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020134	GAT	2	6	168906	168911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020134	AAG	2	6	168930	168935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020134	GTT	2	6	168999	169004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020134	A	6	6	169006	169011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020134	GAA	2	6	169018	169023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020134	T	6	6	169063	169068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020134	CAGG	2	8	169102	169109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_020134	GA	3	6	169127	169132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020134	GAA	2	6	169267	169272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020134	CTT	2	6	169273	169278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020134	TGAA	2	8	169280	169287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020134	CAA	2	6	169301	169306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020134	AT	4	8	169318	169325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020134	AG	4	8	169361	169368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020134	TA	3	6	169391	169396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020134	T	7	7	169494	169500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020134	T	7	7	169516	169522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020134	T	6	6	171964	171969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020134	TAT	2	6	174725	174730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020134	A	6	6	175099	175104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020134	A	7	7	175108	175114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020134	CCGTT	2	10	175122	175131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
553	NC_020134	ACA	2	6	176268	176273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020134	CT	3	6	178603	178608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_020134	T	8	8	178608	178615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020134	ATA	2	6	178628	178633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020134	GAA	2	6	178647	178652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020134	AAAT	2	8	178692	178699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020134	AAG	2	6	178749	178754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020134	CGC	2	6	180107	180112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_020134	AT	3	6	181129	181134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020134	T	6	6	184538	184543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020134	ACC	2	6	184561	184566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_020134	T	6	6	185002	185007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020134	TA	3	6	185020	185025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020134	A	6	6	185034	185039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020134	TAT	2	6	185053	185058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020134	GTAAA	2	10	185059	185068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020134	A	6	6	185066	185071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020134	CTT	2	6	185098	185103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020134	CCT	2	6	188858	188863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_020134	TTA	2	6	188927	188932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020134	GAA	2	6	188934	188939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020134	ACC	2	6	188976	188981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_020134	T	6	6	188998	189003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020134	TA	3	6	189091	189096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020134	ATT	2	6	189097	189102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020134	TTTCT	2	10	189129	189138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_020134	A	8	8	189169	189176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020134	AT	4	8	189207	189214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020134	TAC	2	6	190454	190459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020134	GTA	2	6	190676	190681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020134	AAAT	2	8	190682	190689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020134	CAG	2	6	190721	190726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_020134	TGTA	2	8	190816	190823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020134	CGTG	2	8	190916	190923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_020134	TTG	2	6	190943	190948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020134	T	6	6	190954	190959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020134	AAT	2	6	190990	190995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020134	TAAAA	2	10	191102	191111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020134	TTTTG	2	10	191142	191151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020134	ATGGAA	2	12	191167	191178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020134	AGG	2	6	191246	191251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020134	ATT	2	6	191978	191983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020134	CAG	2	6	191991	191996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_020134	T	7	7	192024	192030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020134	TTG	2	6	192052	192057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020134	T	6	6	192093	192098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020134	CGG	2	6	192429	192434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020134	ATTTA	2	10	192618	192627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020134	AAT	2	6	192629	192634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020134	AAC	2	6	192665	192670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020134	AT	3	6	192703	192708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020134	GAA	2	6	193519	193524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020134	ATT	2	6	194426	194431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020134	TAA	2	6	194447	194452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020134	ATTA	2	8	196294	196301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020134	CAG	2	6	196304	196309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020134	TTGA	2	8	196944	196951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020134	T	7	7	196952	196958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020134	TCG	2	6	196965	196970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020134	TAAA	2	8	197160	197167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020134	TAA	2	6	197173	197178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020134	ATTTA	2	10	197225	197234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020134	A	6	6	197268	197273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020134	TTAA	2	8	198093	198100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020134	T	6	6	198128	198133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020134	TAT	2	6	198214	198219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020134	ATA	2	6	198246	198251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020134	GA	3	6	198283	198288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020134	GCT	2	6	201591	201596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020134	A	6	6	201635	201640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020134	AGGTA	2	10	201652	201661	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020134	AT	3	6	203781	203786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020134	AAT	2	6	203806	203811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020134	A	6	6	203815	203820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020134	ACC	3	9	203832	203840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_020134	C	6	6	203865	203870	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
629	NC_020134	CAA	2	6	204303	204308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020134	CGGA	2	8	204334	204341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_020134	CTG	2	6	204349	204354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020134	AT	4	8	204380	204387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020134	ATTTT	2	10	204429	204438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020134	T	6	6	204435	204440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020134	ATA	2	6	204493	204498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020134	A	6	6	204533	204538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020134	T	6	6	204563	204568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020134	TAAA	2	8	204579	204586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020134	GTATA	2	10	204588	204597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020134	T	6	6	204663	204668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020134	TAC	2	6	204690	204695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_020134	GA	3	6	204700	204705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020134	TCG	2	6	204740	204745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_020134	GGT	2	6	204746	204751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_020134	CCTA	2	8	204758	204765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_020134	AT	3	6	204778	204783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_020134	CAC	2	6	205031	205036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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655	NC_020134	TAA	2	6	205209	205214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_020134	AAAAT	2	10	205315	205324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_020134	T	6	6	219332	219337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
782	NC_020134	CTTA	2	8	219363	219370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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971	NC_020134	A	7	7	308751	308757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
972	NC_020134	GA	3	6	308758	308763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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