MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 9053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020134	CT	3	6	1736718	1736723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_020134	ATT	2	6	1736726	1736731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020134	ATA	2	6	1736805	1736810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_020134	GGA	2	6	1737008	1737013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020134	ATT	2	6	1737015	1737020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020134	TTA	2	6	1737032	1737037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020134	TCA	2	6	1737504	1737509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_020134	AAT	2	6	1737572	1737577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020134	ATAA	2	8	1739036	1739043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020134	TTC	2	6	1739173	1739178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_020134	ATATT	2	10	1739189	1739198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020134	CTG	3	9	1739264	1739272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_020134	GAA	2	6	1744188	1744193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020134	ATA	2	6	1744203	1744208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020134	A	6	6	1744220	1744225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020134	AAC	2	6	1746658	1746663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_020134	CAC	2	6	1747799	1747804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_020134	TGTATA	2	12	1747821	1747832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_020134	A	8	8	1747863	1747870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020134	TAATT	2	10	1747914	1747923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020134	AAGA	2	8	1747929	1747936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020134	ATTT	2	8	1747950	1747957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020134	AAAAT	2	10	1748067	1748076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020134	ATA	2	6	1748090	1748095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020134	A	6	6	1749620	1749625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020134	T	6	6	1749649	1749654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_020134	TA	3	6	1751364	1751369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_020134	T	7	7	1751472	1751478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_020134	ATT	2	6	1751479	1751484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020134	T	7	7	1751492	1751498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020134	CATT	2	8	1751519	1751526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_020134	TAA	2	6	1751530	1751535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020134	ATA	2	6	1751572	1751577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_020134	AGG	2	6	1751590	1751595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020134	TAA	2	6	1752870	1752875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020134	ATA	2	6	1754910	1754915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020134	C	7	7	1754931	1754937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5038	NC_020134	CAT	2	6	1754948	1754953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_020134	CCT	2	6	1756536	1756541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_020134	ATC	2	6	1757442	1757447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_020134	A	6	6	1758499	1758504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020134	A	6	6	1758519	1758524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020134	T	7	7	1758541	1758547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020134	TAT	2	6	1758552	1758557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020134	AT	3	6	1758556	1758561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020134	AAAT	2	8	1761435	1761442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020134	A	7	7	1763560	1763566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020134	TAT	2	6	1763573	1763578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020134	TATTTT	2	12	1763618	1763629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020134	ATC	2	6	1763711	1763716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_020134	TATAAA	2	12	1763834	1763845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020134	AT	3	6	1763854	1763859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_020134	AT	3	6	1763863	1763868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020134	CA	3	6	1763905	1763910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_020134	GCT	2	6	1763928	1763933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_020134	TG	4	8	1763939	1763946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020134	T	6	6	1763953	1763958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020134	GTA	2	6	1763964	1763969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020134	TAA	2	6	1763976	1763981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020134	TAT	2	6	1763987	1763992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020134	AGG	2	6	1764008	1764013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020134	T	6	6	1764014	1764019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020134	TAA	2	6	1765427	1765432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020134	TA	3	6	1766309	1766314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020134	TAT	2	6	1766384	1766389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020134	CAAT	2	8	1766402	1766409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_020134	GAAA	2	8	1766416	1766423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020134	TCC	2	6	1767658	1767663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_020134	TAT	3	9	1767709	1767717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_020134	ACC	2	6	1767718	1767723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_020134	AAC	2	6	1768865	1768870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_020134	AAT	2	6	1768895	1768900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020134	A	6	6	1768931	1768936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020134	AAT	2	6	1769027	1769032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020134	ATAA	2	8	1769042	1769049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_020134	AT	3	6	1769050	1769055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_020134	TTTTC	2	10	1769056	1769065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_020134	CAG	2	6	1769128	1769133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_020134	CAAA	2	8	1769152	1769159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_020134	CTT	2	6	1769163	1769168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_020134	TAA	2	6	1769179	1769184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020134	ATAC	2	8	1769211	1769218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_020134	TTC	2	6	1769256	1769261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_020134	A	6	6	1769314	1769319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020134	ACG	2	6	1769330	1769335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_020134	TTG	2	6	1769337	1769342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020134	TCC	2	6	1769367	1769372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_020134	AAATA	2	10	1769395	1769404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_020134	A	6	6	1769404	1769409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_020134	TCT	2	6	1769428	1769433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_020134	ATCA	2	8	1769701	1769708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_020134	A	7	7	1771915	1771921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020134	C	6	6	1771922	1771927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5096	NC_020134	G	6	6	1771956	1771961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020134	TCC	2	6	1774927	1774932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_020134	ATAA	2	8	1774935	1774942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020134	CAA	2	6	1774978	1774983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_020134	CGG	2	6	1774995	1775000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_020134	AAT	2	6	1775010	1775015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_020134	AT	3	6	1775870	1775875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_020134	ATT	2	6	1775896	1775901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020134	TA	3	6	1775915	1775920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020134	A	6	6	1775920	1775925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020134	ATTTT	2	10	1777391	1777400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020134	A	6	6	1777467	1777472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020134	ATTT	2	8	1777480	1777487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020134	T	6	6	1777499	1777504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020134	TAAT	2	8	1777530	1777537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020134	T	6	6	1777551	1777556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020134	TACT	2	8	1777561	1777568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_020134	CTTA	2	8	1777635	1777642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_020134	TAT	2	6	1777671	1777676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020134	A	6	6	1777678	1777683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_020134	TAG	2	6	1777935	1777940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5118	NC_020134	TGA	2	6	1781159	1781164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020134	AT	3	6	1782982	1782987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020134	TCC	2	6	1784340	1784345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_020134	TTA	2	6	1784346	1784351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020134	TAA	2	6	1784383	1784388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_020134	T	6	6	1784390	1784395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020134	TG	3	6	1784412	1784417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020134	TACCC	2	10	1784504	1784513	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5126	NC_020134	TGGA	2	8	1784753	1784760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_020134	A	6	6	1784878	1784883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_020134	TAC	2	6	1784947	1784952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_020134	CCA	2	6	1784999	1785004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_020134	CTT	2	6	1785062	1785067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_020134	CG	3	6	1785305	1785310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_020134	ATT	2	6	1785331	1785336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_020134	T	6	6	1785382	1785387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_020134	CTT	2	6	1785390	1785395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_020134	C	8	8	1785434	1785441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5136	NC_020134	A	6	6	1785460	1785465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_020134	TAT	2	6	1785501	1785506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_020134	TAAT	2	8	1785515	1785522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_020134	T	6	6	1785644	1785649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5154	NC_020134	AAGC	2	8	1787682	1787689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5251	NC_020134	CTT	2	6	1828315	1828320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_020134	TTCA	2	8	1828364	1828371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_020134	AT	3	6	1828375	1828380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_020134	CCTT	2	8	1829705	1829712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5256	NC_020134	A	6	6	1829726	1829731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_020134	CCCA	2	8	1831914	1831921	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5258	NC_020134	CTTT	2	8	1831926	1831933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5259	NC_020134	CAA	2	6	1831944	1831949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_020134	ATATT	2	10	1831959	1831968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_020134	T	6	6	1831974	1831979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_020134	CGG	2	6	1832041	1832046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_020134	TTAA	2	8	1832050	1832057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_020134	T	8	8	1832095	1832102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_020134	CAA	2	6	1832112	1832117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_020134	AT	3	6	1832141	1832146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_020134	ACC	2	6	1833346	1833351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5268	NC_020134	CTG	2	6	1833390	1833395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5270	NC_020134	GAAA	2	8	1833476	1833483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_020134	ACAAA	2	10	1833497	1833506	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5272	NC_020134	TAA	2	6	1835062	1835067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5274	NC_020134	TAA	2	6	1836295	1836300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5276	NC_020134	ATT	3	9	1836391	1836399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5280	NC_020134	TTTA	2	8	1839068	1839075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_020134	TAAAA	2	10	1848908	1848917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5387	NC_020134	T	6	6	1862601	1862606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_020134	AT	3	6	1862691	1862696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_020134	CAA	2	6	1862721	1862726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5391	NC_020134	A	6	6	1862872	1862877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_020134	A	7	7	1862894	1862900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_020134	ACAA	2	8	1862902	1862909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5394	NC_020134	TGA	2	6	1862913	1862918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5396	NC_020134	AAGT	2	8	1863029	1863036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_020134	T	6	6	1863142	1863147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_020134	GGT	2	6	1863161	1863166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_020134	TGTT	2	8	1863188	1863195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_020134	ACG	2	6	1863212	1863217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5401	NC_020134	A	6	6	1863303	1863308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_020134	A	7	7	1863335	1863341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_020134	AAAT	2	8	1863370	1863377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_020134	A	6	6	1865072	1865077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5411	NC_020134	GGGT	2	8	1865370	1865377	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5451	NC_020134	T	6	6	1878130	1878135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5465	NC_020134	A	7	7	1883190	1883196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_020134	TTTTTA	2	12	1891149	1891160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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