MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020053	AACA	2	8	288375	288382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_020053	GAT	2	6	288547	288552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020053	AGT	2	6	289129	289134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020053	AGT	2	6	289169	289174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020053	TAA	2	6	290255	290260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020053	A	6	6	290259	290264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020053	AAC	2	6	290463	290468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_020053	TGAA	2	8	292479	292486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020053	A	6	6	292493	292498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020053	TCGA	2	8	293098	293105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_020053	CTA	2	6	293615	293620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_020053	T	6	6	294096	294101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020053	AGC	2	6	294124	294129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_020053	TTGC	2	8	294181	294188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_020053	AGCA	2	8	294200	294207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_020053	TAA	2	6	294671	294676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020053	ATG	2	6	294682	294687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020053	GCA	2	6	294704	294709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_020053	AAG	2	6	294774	294779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020053	CCATT	2	10	294847	294856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_020053	AAT	2	6	295203	295208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020053	GCA	2	6	295226	295231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020053	AAGT	2	8	295340	295347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020053	T	6	6	296527	296532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020053	AAG	2	6	296537	296542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020053	CT	3	6	296543	296548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_020053	T	6	6	296558	296563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020053	TC	3	6	296585	296590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_020053	AAC	2	6	296968	296973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020053	ATAAA	2	10	297064	297073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020053	GATT	2	8	297105	297112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020053	TAAA	2	8	297443	297450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020053	CAA	2	6	297471	297476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020053	TCT	2	6	297483	297488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_020053	ACA	2	6	297528	297533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020053	CGAT	2	8	297772	297779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_020053	AGA	2	6	297868	297873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020053	CAGC	2	8	297938	297945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_020053	ATCGA	2	10	301419	301428	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_020053	TTG	2	6	304939	304944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020053	ATC	2	6	304990	304995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020053	TGC	2	6	305018	305023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020053	AACT	2	8	305065	305072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_020053	T	6	6	305083	305088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020053	CAAA	2	8	305097	305104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_020053	AAT	2	6	305538	305543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020053	TGAT	2	8	310128	310135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020053	CGAATA	2	12	310259	310270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1049	NC_020053	ATA	2	6	310293	310298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020053	GTTG	2	8	310311	310318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020053	CACCTC	2	12	310324	310335	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_020053	TCA	2	6	310380	310385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_020053	TCC	2	6	310439	310444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_020053	CAG	2	6	310506	310511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_020053	TCGTA	2	10	310512	310521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_020053	CGTC	2	8	310527	310534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_020053	GCT	2	6	310590	310595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020053	CTGC	2	8	310617	310624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_020053	TCGA	2	8	310720	310727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_020053	GTT	2	6	310734	310739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020053	TGC	2	6	310808	310813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_020053	CCCG	2	8	310823	310830	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1063	NC_020053	GCG	2	6	310838	310843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020053	TCA	2	6	310850	310855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020053	TTG	2	6	310882	310887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020053	AGC	2	6	310928	310933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_020053	TAG	2	6	310995	311000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020053	CAT	2	6	311100	311105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_020053	GATCGA	2	12	311112	311123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_020053	CGG	2	6	311191	311196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_020053	TAAA	2	8	311232	311239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020053	GAATTT	2	12	311292	311303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020053	CCAG	2	8	311321	311328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_020053	CAC	2	6	311338	311343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_020053	A	6	6	311374	311379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020053	CAA	2	6	311383	311388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020053	TAG	2	6	311545	311550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020053	GAAAA	2	10	311609	311618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020053	GATC	3	12	311621	311632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_020053	A	7	7	311634	311640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020053	GTT	2	6	311776	311781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020053	GGCAA	2	10	311792	311801	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_020053	CGAA	2	8	311836	311843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_020053	CGT	2	6	311849	311854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_020053	A	7	7	311861	311867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020053	GCA	3	9	311903	311911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020053	GATT	2	8	311941	311948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020053	GTA	2	6	312006	312011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020053	TTC	2	6	313106	313111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_020053	GAC	2	6	313122	313127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_020053	CG	3	6	313156	313161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_020053	GATCGA	2	12	313237	313248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1093	NC_020053	TTG	2	6	313268	313273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020053	GCA	2	6	313302	313307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020053	ATC	2	6	313318	313323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_020053	ACC	2	6	313334	313339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_020053	GCG	2	6	313391	313396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020053	TCC	2	6	313403	313408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_020053	ATCG	2	8	313429	313436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_020053	TCG	2	6	313440	313445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020053	GTTC	2	8	313449	313456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_020053	ATCG	2	8	313467	313474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_020053	TAA	2	6	313499	313504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020053	CTT	2	6	313519	313524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020053	GCC	2	6	313544	313549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_020053	TCA	3	9	313631	313639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_020053	ATT	2	6	313677	313682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020053	ATT	2	6	313721	313726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020053	TCGA	2	8	313750	313757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_020053	AAT	2	6	313766	313771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020053	TAA	2	6	313779	313784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020053	TTA	2	6	313786	313791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020053	GAG	2	6	313800	313805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020053	AT	5	10	313874	313883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020053	ATT	2	6	314796	314801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020053	TATT	3	12	314798	314809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020053	ATC	2	6	314837	314842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_020053	ATG	2	6	314846	314851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020053	TGT	2	6	314900	314905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020053	AAT	2	6	314949	314954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020053	TCT	2	6	315017	315022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_020053	GGT	2	6	315243	315248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020053	CTG	2	6	315273	315278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020053	TCGC	2	8	315336	315343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_020053	CTCGA	2	10	315401	315410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1126	NC_020053	CAG	2	6	315441	315446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_020053	GCA	2	6	315461	315466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_020053	TCT	2	6	315487	315492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020053	CTG	2	6	315543	315548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_020053	CTT	2	6	315569	315574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020053	CAC	2	6	315606	315611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_020053	TCG	2	6	315623	315628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020053	TCG	3	9	315688	315696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020053	CTG	2	6	315711	315716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_020053	GTT	2	6	315798	315803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020053	TGAC	2	8	315817	315824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_020053	AAC	2	6	315841	315846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_020053	GCA	2	6	315869	315874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_020053	T	6	6	316448	316453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020053	CAA	2	6	316476	316481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_020053	CCG	2	6	316565	316570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1146	NC_020053	CAT	2	6	316628	316633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1148	NC_020053	CTCG	2	8	318824	318831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_020053	CGAT	2	8	318902	318909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1150	NC_020053	TTAT	2	8	319011	319018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_020053	GTT	2	6	319140	319145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_020053	CCA	2	6	319373	319378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1179	NC_020053	TCGA	2	8	331375	331382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1180	NC_020053	ACA	2	6	331420	331425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_020053	CAA	2	6	366292	366297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_020053	TCGC	3	12	366942	366953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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