MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 6517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TATT	2	8	32	39	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019791	TTA	2	6	1859	1864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019791	TAA	2	6	1873	1878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019791	T	6	6	3045	3050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019791	TAAAA	2	10	3072	3081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019791	TAT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019791	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019791	A	7	7	3125	3131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019791	T	6	6	3132	3137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019791	A	7	7	3138	3144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019791	AGT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019791	TCT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019791	AT	3	6	4816	4821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019791	GAG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019791	CTAAAT	2	12	4841	4852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019791	ATC	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019791	ACA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019791	AAT	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019791	ATT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019791	AAAT	2	8	8625	8632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019791	TTA	2	6	10349	10354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019791	TCT	2	6	11132	11137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019791	ATA	2	6	11199	11204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019791	TAA	2	6	12535	12540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019791	TAA	2	6	12555	12560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019791	TTTC	2	8	12571	12578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019791	ATA	2	6	12606	12611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019791	AT	3	6	12617	12622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019791	AAT	2	6	12624	12629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019791	AATA	2	8	12639	12646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019791	TTA	2	6	13768	13773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019791	TA	4	8	13772	13779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019791	TAA	2	6	13815	13820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019791	TAT	2	6	13821	13826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019791	A	6	6	13832	13837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019791	TAAT	2	8	13857	13864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019791	AT	3	6	13868	13873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019791	T	6	6	13889	13894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019791	TTA	2	6	13914	13919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019791	AGA	2	6	13920	13925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019791	TTTA	2	8	15194	15201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019791	TAT	2	6	15226	15231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019791	TAAA	2	8	15290	15297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019791	A	8	8	15365	15372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019791	TAA	2	6	15389	15394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019791	TAA	2	6	15404	15409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019791	TA	3	6	15420	15425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019791	AATT	2	8	15454	15461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019791	TTC	2	6	15501	15506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019791	ATG	2	6	15565	15570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019791	TCT	2	6	15612	15617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019791	ACA	2	6	15661	15666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019791	TCAT	2	8	15688	15695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019791	A	7	7	15715	15721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019791	TGA	2	6	15724	15729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019791	ATT	2	6	15733	15738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019791	ATT	2	6	15775	15780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019791	TAA	2	6	15800	15805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019791	TAT	2	6	16121	16126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019791	TTG	2	6	16132	16137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019791	TAA	2	6	16146	16151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019791	TAA	2	6	16168	16173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019791	AACAA	2	10	17502	17511	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019791	TAT	2	6	17516	17521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019791	AT	3	6	17571	17576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019791	TAA	2	6	17579	17584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019791	AAGA	2	8	17592	17599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019791	AAT	2	6	17609	17614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019791	TAA	2	6	18316	18321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019791	T	6	6	18325	18330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019791	ATT	2	6	18358	18363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019791	TAT	2	6	18370	18375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019791	T	6	6	18394	18399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019791	ATT	2	6	18419	18424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019791	TTA	2	6	19931	19936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019791	ATA	2	6	19954	19959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019791	AGAC	2	8	19970	19977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019791	AAT	2	6	19992	19997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019791	A	6	6	20030	20035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019791	ATAA	2	8	20054	20061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019791	AT	3	6	20104	20109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019791	TA	3	6	20126	20131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019791	CTT	2	6	20149	20154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019791	ATT	2	6	20156	20161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019791	TATTT	2	10	20168	20177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019791	TGTT	2	8	20181	20188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019791	CTT	2	6	20189	20194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019791	ATT	2	6	20196	20201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019791	ATA	2	6	20213	20218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019791	AT	3	6	20223	20228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019791	T	7	7	20235	20241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019791	A	6	6	20243	20248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019791	T	6	6	20249	20254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019791	A	7	7	20303	20309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019791	TTA	2	6	20310	20315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019791	TAA	2	6	20320	20325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019791	TCAA	2	8	20329	20336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019791	GTA	2	6	20348	20353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019791	TAG	2	6	20361	20366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019791	T	6	6	20370	20375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019791	AATT	2	8	20401	20408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019791	ATTT	2	8	20478	20485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019791	TGG	2	6	20516	20521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019791	GAA	2	6	20532	20537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019791	T	6	6	20539	20544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019791	TTA	2	6	20580	20585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019791	AATT	2	8	20616	20623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019791	T	7	7	20833	20839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019791	GGA	2	6	20908	20913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019791	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019791	AT	4	8	20965	20972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019791	AC	3	6	21089	21094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019791	ATT	2	6	21121	21126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019791	TGT	2	6	21128	21133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019791	AGA	3	9	21141	21149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019791	TGC	2	6	21228	21233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019791	GTT	2	6	21325	21330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019791	CAAT	2	8	21352	21359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019791	ATTTT	2	10	21391	21400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019791	T	6	6	21397	21402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019791	TTA	2	6	21419	21424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019791	TAAA	2	8	21446	21453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019791	TA	3	6	21495	21500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019791	ATTT	2	8	21504	21511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019791	TA	3	6	21515	21520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019791	T	6	6	21540	21545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019791	TCT	2	6	21547	21552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019791	TTCCT	2	10	21598	21607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_019791	TTC	2	6	21663	21668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019791	GCT	2	6	21673	21678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019791	TAT	2	6	21686	21691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019791	GGA	2	6	21811	21816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019791	AAT	2	6	21822	21827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019791	ATA	2	6	21875	21880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019791	ATA	2	6	21884	21889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019791	TGG	2	6	21907	21912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019791	ATTGG	2	10	21923	21932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019791	AAC	2	6	21948	21953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019791	AGT	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019791	AT	3	6	22074	22079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019791	TAA	3	9	22110	22118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019791	ATCC	2	8	22145	22152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019791	TATT	2	8	22179	22186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019791	TAA	2	6	22305	22310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019791	TTA	2	6	22317	22322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019791	ACA	2	6	22378	22383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019791	AAT	2	6	22420	22425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019791	CTT	2	6	22448	22453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019791	TA	3	6	22495	22500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019791	ATT	2	6	22556	22561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019791	TGT	3	9	22638	22646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_019791	AT	3	6	22762	22767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019791	TAA	2	6	22768	22773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_019791	TAT	2	6	31125	31130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_019791	ATA	2	6	57423	57428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_019791	AAAAAT	2	12	57429	57440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_019791	AAGAA	2	10	57595	57604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_019791	ATG	2	6	57616	57621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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