MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 11277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	AT	3	6	1563	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019778	AT	3	6	1578	1583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019778	ATTG	2	8	1588	1595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019778	GAA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019778	CT	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019778	AGT	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019778	TGT	2	6	1709	1714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019778	TGA	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019778	GTC	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019778	AAGAT	2	10	1798	1807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019778	AGATG	2	10	2331	2340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019778	TGAG	2	8	2397	2404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019778	TGCTT	2	10	2429	2438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019778	GTG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019778	AAT	3	9	2523	2531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019778	AT	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019778	TAT	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019778	T	7	7	2559	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019778	GTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019778	TTG	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019778	ATA	2	6	4319	4324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019778	TGA	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019778	TAA	2	6	4375	4380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019778	ATC	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019778	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019778	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019778	T	8	8	4541	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019778	CT	3	6	4556	4561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019778	GAA	2	6	4574	4579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019778	ATTT	2	8	5664	5671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019778	A	6	6	5678	5683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019778	ATT	3	9	5699	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019778	T	7	7	7421	7427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019778	TCG	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019778	ACT	2	6	7570	7575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019778	GC	3	6	8348	8353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019778	TA	3	6	8429	8434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019778	TGAT	2	8	8435	8442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019778	TATC	2	8	8466	8473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019778	TCT	2	6	8481	8486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019778	GAAA	2	8	8492	8499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019778	A	7	7	8572	8578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019778	GGA	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019778	T	7	7	9723	9729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019778	AT	3	6	9734	9739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019778	CCTA	2	8	9764	9771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019778	TAT	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019778	GGTTT	2	10	9848	9857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019778	TTTC	2	8	9879	9886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019778	GA	3	6	9924	9929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019778	ATTG	2	8	9940	9947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019778	AAT	2	6	10265	10270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019778	CAT	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019778	TTG	2	6	10317	10322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019778	TCA	2	6	10351	10356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019778	ATT	2	6	10387	10392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019778	TC	3	6	10430	10435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019778	CCA	2	6	10440	10445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019778	AT	3	6	10494	10499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019778	ATG	2	6	10628	10633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019778	GAT	2	6	10684	10689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019778	ATT	2	6	10736	10741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019778	AAT	2	6	10797	10802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019778	TGG	2	6	10859	10864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019778	ATG	2	6	11009	11014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019778	AGTTAC	2	12	11051	11062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019778	GAT	2	6	11086	11091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019778	GAG	2	6	11104	11109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019778	AGG	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019778	GAT	2	6	11226	11231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019778	GAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019778	GATG	2	8	11277	11284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019778	GAT	2	6	11293	11298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019778	GTA	2	6	11381	11386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019778	AATA	2	8	11407	11414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019778	ATAA	2	8	11452	11459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019778	CAA	2	6	11477	11482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019778	TAC	2	6	11544	11549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019778	GAA	2	6	11668	11673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019778	GAA	2	6	11805	11810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019778	AT	3	6	11817	11822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019778	T	6	6	12441	12446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019778	ATA	2	6	12507	12512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019778	TGT	2	6	12554	12559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019778	ATT	2	6	12588	12593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019778	T	7	7	12596	12602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019778	TAA	2	6	12627	12632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019778	ATT	2	6	12676	12681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019778	GGT	2	6	12686	12691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019778	A	7	7	12702	12708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019778	TAA	2	6	12747	12752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019778	ATA	2	6	13837	13842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019778	ATT	2	6	13848	13853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019778	ATT	3	9	15583	15591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019778	AAT	3	9	15666	15674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019778	TA	4	8	15716	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019778	AAC	2	6	16895	16900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019778	CAAT	2	8	20064	20071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019778	A	7	7	20085	20091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019778	TAA	2	6	20403	20408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019778	CTA	2	6	20447	20452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019778	TAT	2	6	20535	20540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019778	AT	3	6	20567	20572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019778	TAA	2	6	20582	20587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019778	T	7	7	20635	20641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019778	CT	3	6	20642	20647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019778	AT	3	6	20654	20659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019778	T	8	8	20663	20670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019778	TAG	2	6	20673	20678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019778	T	8	8	20726	20733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019778	ATA	2	6	20800	20805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019778	T	7	7	20836	20842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019778	ATAA	2	8	20853	20860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019778	A	6	6	20859	20864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019778	A	8	8	20910	20917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019778	ACT	2	6	21004	21009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019778	AAT	2	6	21013	21018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019778	CAA	2	6	21056	21061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019778	TAA	2	6	21073	21078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019778	ACA	2	6	21123	21128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019778	AAG	2	6	21134	21139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019778	CTGT	2	8	21155	21162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019778	GAAA	2	8	21190	21197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019778	GTT	2	6	21233	21238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019778	ATT	2	6	21240	21245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019778	TA	3	6	21253	21258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019778	AC	3	6	21269	21274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019778	AAC	2	6	21289	21294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019778	A	6	6	21300	21305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019778	ACA	2	6	21363	21368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019778	GTTTT	2	10	21452	21461	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019778	A	6	6	21586	21591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019778	TTA	2	6	21600	21605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019778	TGA	2	6	21608	21613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019778	ATG	2	6	21641	21646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019778	TAA	2	6	21804	21809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019778	GGA	2	6	21928	21933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019778	TTA	2	6	22002	22007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019778	TG	3	6	22024	22029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019778	AAGT	2	8	22039	22046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019778	GTA	2	6	22086	22091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019778	TGG	2	6	25483	25488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019778	ACT	3	9	26714	26722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019778	ATTCT	2	10	26728	26737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019778	TG	3	6	26809	26814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019778	GTG	2	6	28459	28464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019778	ATA	2	6	28522	28527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019778	TC	3	6	28532	28537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019778	AAT	2	6	28597	28602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_019778	TAA	2	6	120996	121001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_019778	AT	3	6	123431	123436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_019778	A	8	8	126217	126224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_019778	A	6	6	126235	126240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_019778	GTT	2	6	126312	126317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_019778	A	8	8	129682	129689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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