MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 25468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	T	6	6	1904	1909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019697	GA	3	6	1947	1952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019697	GC	3	6	1972	1977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019697	AGA	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019697	GTTT	2	8	2068	2075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019697	AAGAG	2	10	2097	2106	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019697	CTG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019697	CCTT	2	8	2137	2144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019697	TCGA	2	8	2161	2168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019697	AG	3	6	2188	2193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019697	GTT	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019697	CGGTT	2	10	4223	4232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019697	AACT	2	8	4335	4342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019697	AACCG	2	10	4357	4366	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019697	CGGTGG	2	12	4690	4701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019697	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019697	GCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019697	TAGA	2	8	7097	7104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019697	GAA	2	6	9454	9459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019697	AAT	2	6	9462	9467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019697	TAA	2	6	10339	10344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019697	GT	3	6	10349	10354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019697	GA	3	6	10384	10389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019697	ATCG	2	8	10413	10420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019697	TAA	3	9	10537	10545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019697	AGT	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019697	AGT	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019697	AAT	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019697	TAA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019697	CGC	2	6	11518	11523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019697	CGC	2	6	11600	11605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019697	GAGC	2	8	11626	11633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019697	CAT	2	6	11681	11686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019697	GCC	3	9	11733	11741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019697	CGC	2	6	11790	11795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019697	CGC	2	6	11865	11870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019697	T	6	6	13058	13063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019697	AAG	2	6	13068	13073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019697	CT	3	6	13074	13079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019697	T	6	6	13089	13094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019697	TC	3	6	13116	13121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019697	GCA	2	6	13189	13194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019697	GAA	2	6	13241	13246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019697	CGAT	2	8	13269	13276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019697	TGAT	2	8	13470	13477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019697	GAT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019697	CG	3	6	13516	13521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019697	AGA	2	6	13534	13539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019697	ACT	2	6	13543	13548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019697	TCG	2	6	13559	13564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019697	GTTC	2	8	13630	13637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019697	ATT	2	6	13672	13677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019697	GTT	2	6	13700	13705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019697	GCG	2	6	13808	13813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019697	ACA	2	6	13819	13824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019697	CTG	2	6	13873	13878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019697	CTAG	2	8	13902	13909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019697	TCGA	2	8	13968	13975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019697	GATC	2	8	13999	14006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019697	GTTA	2	8	17815	17822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019697	TAA	2	6	17873	17878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019697	AG	3	6	17944	17949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019697	CT	3	6	18002	18007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019697	TATG	2	8	18051	18058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019697	GTCA	2	8	18109	18116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019697	TCT	2	6	20442	20447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019697	A	6	6	23695	23700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019697	CCTA	2	8	24154	24161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019697	GCCA	2	8	24170	24177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019697	TTA	2	6	25450	25455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019697	CGAT	2	8	25457	25464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019697	TAG	2	6	25497	25502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019697	CCTC	2	8	25506	25513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_019697	A	6	6	25515	25520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019697	AGG	2	6	25530	25535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019697	T	7	7	25539	25545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019697	GATC	2	8	25557	25564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019697	ATCG	2	8	25659	25666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019697	GATA	2	8	25667	25674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019697	ATT	2	6	28044	28049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019697	GTAT	2	8	28132	28139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019697	TAA	2	6	28140	28145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019697	AGT	2	6	29813	29818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019697	AGCG	2	8	31659	31666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019697	GTG	2	6	31738	31743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019697	ATA	2	6	31824	31829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019697	CTAT	2	8	31836	31843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019697	AAGAC	2	10	31848	31857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019697	GATC	2	8	32813	32820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019697	TCGA	2	8	32839	32846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019697	TAA	2	6	32900	32905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019697	ACC	2	6	32936	32941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019697	CAG	2	6	32955	32960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019697	TG	3	6	35223	35228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019697	CGAT	2	8	35246	35253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019697	TGG	2	6	35276	35281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019697	TTGT	2	8	35297	35304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019697	CGAT	2	8	35324	35331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019697	GTT	2	6	35349	35354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019697	TG	3	6	35355	35360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019697	C	6	6	35396	35401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_019697	CGC	2	6	35416	35421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019697	GTAGC	2	10	35457	35466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019697	GC	3	6	35465	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019697	GATC	2	8	35570	35577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019697	GA	3	6	35578	35583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019697	CAACC	2	10	35612	35621	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_019697	CTC	2	6	35643	35648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019697	GCG	2	6	35652	35657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019697	A	7	7	35709	35715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019697	GTGGG	2	10	35765	35774	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019697	TTC	2	6	36729	36734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019697	CTC	2	6	36742	36747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019697	ACCC	2	8	36772	36779	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_019697	CGA	2	6	36827	36832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019697	GC	3	6	36833	36838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019697	AGGG	2	8	36847	36854	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019697	CAGA	2	8	36876	36883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019697	TCT	2	6	36894	36899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019697	CT	3	6	36898	36903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019697	TGG	2	6	36911	36916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019697	ACCC	2	8	36969	36976	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_019697	ATT	2	6	38770	38775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019697	A	7	7	38822	38828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019697	ATCG	2	8	38831	38838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019697	CTA	2	6	38847	38852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019697	GAGAG	2	10	38873	38882	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019697	TCA	2	6	38929	38934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019697	CCA	2	6	38969	38974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019697	AAGT	2	8	39011	39018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019697	GCG	2	6	39076	39081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019697	G	6	6	39096	39101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019697	AGA	2	6	39143	39148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019697	TCGA	2	8	39190	39197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019697	ACCC	2	8	39225	39232	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_019697	AGG	2	6	39254	39259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019697	TAA	3	9	39591	39599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019697	A	6	6	41506	41511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019697	CAG	2	6	41535	41540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019697	ATT	2	6	41549	41554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019697	TTGC	2	8	41555	41562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019697	ACAT	2	8	41576	41583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019697	AT	3	6	41582	41587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019697	TAG	2	6	41606	41611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019697	A	6	6	41626	41631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019697	TCC	2	6	41632	41637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019697	AG	3	6	41654	41659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019697	TAC	2	6	41675	41680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019697	TA	3	6	42763	42768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019697	CGAT	2	8	42897	42904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019697	CGATC	2	10	42916	42925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_019697	TAA	2	6	43087	43092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_019697	CAC	2	6	43134	43139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_019697	TTGA	2	8	43563	43570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019697	ATCG	2	8	43572	43579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_019697	TA	3	6	43599	43604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_019697	ATCG	2	8	46092	46099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_019697	AAT	2	6	47927	47932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_019697	AGTA	2	8	51438	51445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019697	ATA	2	6	51459	51464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019697	TG	3	6	51489	51494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_019697	AATCC	2	10	88290	88299	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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