MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 21208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019695	ACA	2	6	1301359	1301364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_019695	AGA	2	6	1301419	1301424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019695	AAAG	2	8	1301455	1301462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019695	CAA	2	6	1301480	1301485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_019695	T	6	6	1301845	1301850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019695	GTA	2	6	1301880	1301885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019695	GCT	2	6	1302469	1302474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_019695	TC	3	6	1302481	1302486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_019695	AGC	2	6	1302496	1302501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_019695	AGC	2	6	1302514	1302519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_019695	GGA	2	6	1302541	1302546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019695	ACTG	2	8	1303402	1303409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_019695	AGC	2	6	1303426	1303431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_019695	ACC	2	6	1303438	1303443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_019695	TCGA	2	8	1303457	1303464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_019695	TAC	2	6	1303481	1303486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_019695	CAA	2	6	1303527	1303532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_019695	TAAT	2	8	1304303	1304310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019695	CA	3	6	1304316	1304321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_019695	ATG	2	6	1304788	1304793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_019695	TATT	2	8	1304843	1304850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_019695	CT	3	6	1304868	1304873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_019695	CTCA	2	8	1304977	1304984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_019695	GAC	2	6	1305067	1305072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_019695	CTT	2	6	1305095	1305100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_019695	TGT	2	6	1305163	1305168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019695	TTG	3	9	1305184	1305192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_019695	CAT	2	6	1305244	1305249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_019695	CCA	2	6	1305251	1305256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_019695	CGC	2	6	1305280	1305285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_019695	CCA	2	6	1305314	1305319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_019695	TCC	2	6	1305325	1305330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_019695	TGA	2	6	1305462	1305467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019695	CAC	2	6	1305492	1305497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_019695	GAC	2	6	1305567	1305572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_019695	TTTGA	2	10	1305591	1305600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019695	AGC	2	6	1305649	1305654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_019695	AGC	2	6	1305739	1305744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_019695	TGT	2	6	1305752	1305757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019695	CAC	2	6	1305822	1305827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_019695	TAA	2	6	1305869	1305874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019695	TAC	2	6	1305933	1305938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_019695	TTC	2	6	1306086	1306091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_019695	ACC	2	6	1306126	1306131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_019695	GGTGT	2	10	1306180	1306189	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019695	ACC	2	6	1306273	1306278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_019695	GCA	2	6	1306349	1306354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_019695	GCT	2	6	1306391	1306396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_019695	ACA	3	9	1306466	1306474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_019695	TAC	2	6	1306540	1306545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_019695	AATG	2	8	1306561	1306568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019695	AGC	2	6	1306576	1306581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_019695	ACC	2	6	1306617	1306622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_019695	GAA	2	6	1306678	1306683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019695	TGC	2	6	1306687	1306692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_019695	CCA	2	6	1306784	1306789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_019695	GTA	2	6	1306790	1306795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019695	CTA	2	6	1306893	1306898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019695	CTT	2	6	1306900	1306905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_019695	CAA	2	6	1306947	1306952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_019695	GTT	2	6	1307100	1307105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019695	GCT	2	6	1307138	1307143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_019695	CT	3	6	1307142	1307147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_019695	GGAT	2	8	1307283	1307290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019695	AGC	2	6	1307394	1307399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_019695	AGC	2	6	1307408	1307413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_019695	TTG	2	6	1307418	1307423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019695	A	6	6	1307450	1307455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019695	A	6	6	1307491	1307496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019695	AGC	3	9	1308959	1308967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_019695	CAG	2	6	1308991	1308996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_019695	CTA	2	6	1309014	1309019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_019695	ACC	2	6	1309082	1309087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_019695	ACC	2	6	1309097	1309102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_019695	ATCG	2	8	1309157	1309164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_019695	CTC	2	6	1309196	1309201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_019695	TGGT	2	8	1309255	1309262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019695	TGC	2	6	1311728	1311733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_019695	TGC	2	6	1311748	1311753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_019695	AT	3	6	1311754	1311759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019695	AT	3	6	1311793	1311798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019695	AT	3	6	1311809	1311814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019695	AC	3	6	1311819	1311824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_019695	AGC	2	6	1311829	1311834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_019695	CTA	2	6	1311858	1311863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_019695	AGGA	2	8	1311877	1311884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_019695	GTT	2	6	1311909	1311914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019695	AT	3	6	1311930	1311935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019695	ATT	2	6	1311938	1311943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019695	GTTG	2	8	1311975	1311982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019695	TTG	2	6	1312040	1312045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019695	TTC	2	6	1312151	1312156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_019695	ACTG	2	8	1312191	1312198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_019695	TAG	2	6	1312307	1312312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019695	CGAT	2	8	1312335	1312342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_019695	CCT	2	6	1312376	1312381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_019695	AGG	2	6	1312397	1312402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019695	TGA	2	6	1312708	1312713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019695	ACA	2	6	1312716	1312721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_019695	TAC	2	6	1312726	1312731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_019695	TTC	2	6	1312771	1312776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_019695	GACC	2	8	1313508	1313515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_019695	AT	4	8	1313560	1313567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019695	AAGAG	2	10	1313629	1313638	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019695	GGTC	3	12	1313722	1313733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_019695	AG	3	6	1313743	1313748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019695	GA	3	6	1313757	1313762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019695	CAG	2	6	1313767	1313772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_019695	C	6	6	1313774	1313779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4110	NC_019695	ACCT	2	8	1313793	1313800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_019695	AGGG	2	8	1316083	1316090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_019695	AGC	2	6	1316096	1316101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_019695	CT	3	6	1316106	1316111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_019695	AAC	2	6	1316722	1316727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_019695	GTA	2	6	1316733	1316738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019695	AGAT	2	8	1316751	1316758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_019695	TTA	2	6	1316823	1316828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_019695	GAA	2	6	1319027	1319032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019695	CT	4	8	1319125	1319132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_019695	AATA	2	8	1321341	1321348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019695	GTA	2	6	1321354	1321359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_019695	ACT	2	6	1321385	1321390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_019695	GAA	2	6	1321422	1321427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019695	ATCAA	2	10	1321485	1321494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_019695	A	6	6	1321579	1321584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019695	ATG	2	6	1321663	1321668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019695	ACT	2	6	1321681	1321686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_019695	ACGC	2	8	1323580	1323587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_019695	AG	3	6	1324366	1324371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019695	CCA	2	6	1324426	1324431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_019695	GCCC	2	8	1325580	1325587	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4256	NC_019695	TTAG	2	8	1369942	1369949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_019695	A	6	6	1370045	1370050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_019695	TAAG	2	8	1370092	1370099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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