MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 15695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019566	TAC	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019566	TGT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019566	ACT	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019566	TTA	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019566	ACA	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019566	TAA	2	6	155	160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019566	TGTA	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019566	A	7	7	177	183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019566	TGAAT	2	10	195	204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019566	TAAT	2	8	242	249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019566	ATT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019566	AGAT	2	8	286	293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019566	TAAT	2	8	330	337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019566	TTG	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019566	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019566	TTA	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019566	TAA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019566	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019566	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019566	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019566	TTAA	2	8	3808	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019566	ATT	2	6	3819	3824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019566	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019566	TCT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019566	ATG	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019566	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019566	TTTA	2	8	3931	3938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019566	GTAA	2	8	3958	3965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019566	TAG	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019566	AAT	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019566	TCT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019566	GTAT	2	8	4050	4057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019566	T	10	10	4083	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019566	TAA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019566	T	6	6	4115	4120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019566	AAG	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019566	TAA	2	6	4160	4165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019566	CTTG	2	8	4174	4181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019566	TAAT	2	8	4183	4190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019566	TAATT	2	10	4205	4214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019566	TAG	2	6	4215	4220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019566	T	6	6	4221	4226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019566	A	8	8	4243	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019566	GTA	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019566	GTA	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019566	ATT	4	12	4287	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019566	GTT	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019566	ATTAA	2	10	4313	4322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019566	TAA	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019566	TCT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019566	AGA	2	6	4383	4388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019566	A	6	6	4394	4399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019566	AAT	2	6	4410	4415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019566	ATTA	2	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019566	ATT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019566	AAT	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019566	ATT	2	6	4573	4578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019566	TTA	2	6	4594	4599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019566	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019566	A	7	7	4631	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019566	ATT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019566	GTTTTA	2	12	4651	4662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019566	AAT	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019566	AT	3	6	4694	4699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019566	ATT	2	6	4761	4766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019566	AT	3	6	4768	4773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019566	TAT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019566	T	7	7	4858	4864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019566	ATAAA	3	15	4876	4890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019566	TTA	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019566	AATTT	2	10	4916	4925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019566	T	7	7	4975	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019566	ATT	3	9	6415	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019566	T	8	8	6422	6429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019566	TATT	2	8	6459	6466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019566	AAAT	2	8	6470	6477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019566	T	6	6	9460	9465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019566	CT	3	6	9486	9491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019566	TTA	2	6	11384	11389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019566	T	8	8	11404	11411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019566	A	6	6	11428	11433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019566	TATT	2	8	11464	11471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019566	AAAT	2	8	11472	11479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019566	T	9	9	11483	11491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019566	T	6	6	11532	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019566	GTTA	2	8	11554	11561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019566	AAGC	2	8	11601	11608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019566	T	6	6	11692	11697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019566	TAAT	2	8	11732	11739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019566	TAAA	2	8	11752	11759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019566	T	6	6	11761	11766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019566	TTA	2	6	12859	12864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019566	TAA	2	6	12865	12870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019566	GTTT	2	8	12882	12889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019566	CAA	2	6	12891	12896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019566	TAACTT	2	12	12918	12929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019566	A	6	6	12935	12940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019566	T	7	7	12950	12956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019566	A	6	6	12985	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019566	GAA	2	6	12994	12999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019566	AAT	2	6	13021	13026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019566	TGAA	2	8	13329	13336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019566	AAT	2	6	13342	13347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019566	TAG	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019566	ATA	2	6	13368	13373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019566	TTA	2	6	13387	13392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019566	ATTT	2	8	13918	13925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019566	T	7	7	13953	13959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019566	TGT	2	6	13983	13988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019566	AT	3	6	13989	13994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019566	TGAT	2	8	14054	14061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019566	ATT	2	6	14095	14100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019566	TGATAA	2	12	14259	14270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019566	AAT	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019566	AATC	2	8	14292	14299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019566	TAA	2	6	14317	14322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019566	ATTT	2	8	14341	14348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019566	AGA	2	6	14397	14402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019566	AT	3	6	14428	14433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019566	TAA	3	9	14443	14451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019566	GTTA	2	8	14514	14521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019566	TA	3	6	14520	14525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019566	TTAT	2	8	14529	14536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019566	TAA	2	6	14559	14564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019566	TTTAAT	2	12	14566	14577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019566	T	6	6	14583	14588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019566	AT	3	6	14655	14660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019566	GCT	2	6	15867	15872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019566	TAT	2	6	15908	15913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019566	TGT	2	6	15951	15956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019566	TAACT	2	10	15965	15974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019566	AGTA	2	8	15975	15982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019566	TAT	2	6	16005	16010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019566	TAA	2	6	16024	16029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019566	ATA	2	6	16034	16039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019566	ATTT	2	8	16054	16061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019566	TATAT	2	10	16091	16100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019566	T	6	6	16100	16105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019566	ATT	2	6	16134	16139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019566	T	7	7	16138	16144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019566	TAG	2	6	16147	16152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019566	ATC	2	6	16156	16161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019566	CA	3	6	16178	16183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019566	TCT	2	6	16196	16201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019566	CTTTA	2	10	16270	16279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019566	GCTT	2	8	16292	16299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019566	GTT	2	6	16384	16389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019566	AAT	2	6	16421	16426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019566	AAC	2	6	16443	16448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019566	GATA	2	8	16466	16473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019566	AAT	2	6	16485	16490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019566	T	7	7	16513	16519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019566	A	6	6	16539	16544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019566	GCT	2	6	16568	16573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019566	TAT	2	6	16584	16589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019566	ATTTT	2	10	16654	16663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019566	TCA	2	6	16697	16702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019566	ATA	2	6	16748	16753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019566	TAA	2	6	16755	16760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019566	TTAA	2	8	16800	16807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_019566	TTTA	2	8	16841	16848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019566	TTAA	2	8	16875	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019566	TTA	2	6	16952	16957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019566	ATC	2	6	17008	17013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_019566	TTA	2	6	18588	18593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019566	CTA	2	6	18737	18742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_019566	TTA	2	6	18826	18831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019566	TAA	2	6	18836	18841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019566	TAT	2	6	18854	18859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_019566	TAA	2	6	18866	18871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019566	TGT	2	6	18962	18967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_019566	TGTT	2	8	19121	19128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019566	T	8	8	19127	19134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_019566	TTA	2	6	19414	19419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_019566	CTTTT	2	10	19432	19441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_019566	T	7	7	19438	19444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_019566	TTG	2	6	19446	19451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_019566	ATT	2	6	25128	25133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_019566	T	6	6	25137	25142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_019566	TAA	2	6	26372	26377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_019566	ATT	2	6	26505	26510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_019566	AAT	2	6	26527	26532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_019566	ATA	2	6	26540	26545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_019566	ATT	2	6	26548	26553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_019566	TTTA	2	8	40248	40255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_019566	ATTAC	2	10	40349	40358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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