MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	AAAAGA	2	12	35	46	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018719	GGC	2	6	54	59	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018719	GC	3	6	72	77	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018719	GTGAT	2	10	86	95	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018719	ATC	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018719	CTG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018719	TTG	3	9	2907	2915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018719	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018719	AGA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018719	A	6	6	4695	4700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018719	CCTG	2	8	4739	4746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018719	GA	3	6	5202	5207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018719	CAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018719	AAG	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018719	TTA	3	9	5848	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018719	TCT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018719	ATA	4	12	5887	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018719	GCA	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018719	AG	4	8	6852	6859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018719	AT	4	8	6863	6870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018719	AAAC	2	8	6876	6883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018719	CG	3	6	7674	7679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018719	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018719	TCC	3	9	7721	7729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018719	AG	3	6	7745	7750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018719	AGG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018719	TAT	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018719	TAA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018719	GTTC	2	8	8522	8529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018719	AGCT	2	8	8869	8876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018719	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018719	TATTTT	2	12	9310	9321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018719	TGA	2	6	10185	10190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018719	CAT	2	6	10292	10297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018719	GGT	2	6	10314	10319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018719	TTA	2	6	10327	10332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018719	GCG	2	6	12493	12498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018719	AAT	2	6	12523	12528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018719	T	6	6	12788	12793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018719	AGAAT	2	10	12808	12817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018719	CAAC	2	8	12927	12934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018719	AGA	2	6	12980	12985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018719	GAGC	2	8	13014	13021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018719	AGC	2	6	13024	13029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018719	GAT	2	6	13048	13053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018719	CTG	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018719	AG	3	6	13113	13118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018719	ACAGA	2	10	13144	13153	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018719	GCG	2	6	13211	13216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018719	AGT	2	6	13233	13238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018719	T	6	6	13280	13285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018719	TCAAT	2	10	13293	13302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018719	T	6	6	13309	13314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018719	TTA	2	6	13378	13383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018719	ATTA	2	8	13403	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018719	A	6	6	13452	13457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018719	TGA	2	6	13466	13471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018719	CAT	2	6	13874	13879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018719	ATC	2	6	13880	13885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018719	TA	3	6	13909	13914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018719	AC	3	6	13917	13922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018719	TTC	2	6	13932	13937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018719	TGC	2	6	13938	13943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018719	A	6	6	13970	13975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018719	TGT	2	6	15554	15559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018719	GTAT	2	8	15560	15567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018719	CCA	2	6	15599	15604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018719	A	6	6	15823	15828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018719	GCT	2	6	15865	15870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018719	AAG	3	9	16679	16687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018719	T	6	6	16695	16700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018719	AGC	2	6	16717	16722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018719	ACA	2	6	16739	16744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018719	GTA	3	9	16777	16785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018719	AAG	2	6	16787	16792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018719	CTAG	2	8	17417	17424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018719	GTTA	2	8	17474	17481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018719	AGT	2	6	17496	17501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018719	GCT	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018719	GCCGC	2	10	19635	19644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_018719	ATT	2	6	19648	19653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018719	T	6	6	19652	19657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018719	ATG	3	9	19664	19672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018719	CTTT	2	8	19715	19722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018719	T	6	6	19726	19731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018719	CTA	2	6	19783	19788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018719	ATA	2	6	19835	19840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018719	CGC	2	6	22614	22619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018719	C	6	6	22619	22624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_018719	CTCTTT	2	12	22629	22640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018719	CAAG	2	8	22656	22663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018719	GAC	2	6	23724	23729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018719	CCA	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018719	CAG	2	6	23789	23794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018719	GCC	2	6	23810	23815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018719	GCAA	2	8	23817	23824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018719	CAA	2	6	23935	23940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018719	GC	3	6	24064	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018719	CTA	2	6	24107	24112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018719	GCTCT	2	10	25822	25831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018719	CCT	2	6	25850	25855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018719	ATT	2	6	25861	25866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018719	AT	3	6	25871	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018719	TAA	2	6	25885	25890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018719	TAA	3	9	25918	25926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018719	T	6	6	26328	26333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018719	ACGCG	2	10	26356	26365	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018719	AGC	2	6	26383	26388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018719	AAAG	2	8	26447	26454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018719	TGC	2	6	28847	28852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018719	A	6	6	28858	28863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018719	GTT	2	6	28881	28886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018719	CAC	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018719	TAT	2	6	28898	28903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018719	TAC	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018719	T	6	6	28933	28938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018719	T	6	6	28940	28945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018719	GT	3	6	29217	29222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018719	TG	3	6	29847	29852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018719	CAA	2	6	29910	29915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018719	GTC	2	6	29951	29956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018719	GTA	2	6	29987	29992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018719	TGA	3	9	30034	30042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018719	GA	3	6	30045	30050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018719	A	6	6	30050	30055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018719	GAAG	2	8	30118	30125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018719	CAG	2	6	30143	30148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018719	ACA	2	6	30188	30193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018719	GAA	2	6	31391	31396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018719	TA	3	6	31420	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018719	AAT	2	6	31447	31452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018719	CTC	2	6	31765	31770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018719	TC	4	8	31797	31804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018719	TGC	2	6	32037	32042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018719	GAT	2	6	32522	32527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018719	AGG	2	6	32621	32626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018719	ACG	2	6	32681	32686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018719	CGC	2	6	32687	32692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018719	ATA	2	6	32723	32728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018719	AG	4	8	32753	32760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018719	GCT	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018719	GTAT	2	8	33120	33127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018719	TTG	2	6	33130	33135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018719	TAA	2	6	33403	33408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018719	A	6	6	33416	33421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018719	TTTG	2	8	33459	33466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018719	TGTAT	2	10	33473	33482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018719	CTG	2	6	33499	33504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018719	CTTG	2	8	33539	33546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018719	CGT	2	6	33637	33642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_018719	TCC	2	6	33701	33706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_018719	ACT	2	6	33748	33753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_018719	AGA	2	6	35934	35939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018719	GCT	2	6	36383	36388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_018719	T	6	6	36413	36418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018719	TTG	2	6	36674	36679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018719	TG	3	6	36715	36720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018719	GAAAAA	2	12	36739	36750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018719	CA	3	6	37138	37143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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171	NC_018719	AAAT	2	8	37202	37209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018719	AAGA	2	8	37215	37222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018719	A	6	6	37226	37231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018719	ATTAT	2	10	37252	37261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018719	AGCA	2	8	37278	37285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
176	NC_018719	CCA	2	6	37300	37305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_018719	ATT	2	6	37409	37414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018719	ATA	2	6	38692	38697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018719	GCT	3	9	38777	38785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_018719	TA	4	8	38831	38838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018719	AT	5	10	38842	38851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018719	GAC	2	6	39500	39505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_018719	CACTG	2	10	39597	39606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_018719	TCG	2	6	39615	39620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_018719	ATT	2	6	39623	39628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018719	GCT	2	6	39705	39710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_018719	TAA	2	6	39734	39739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_018719	TAT	2	6	39918	39923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_018719	GGA	2	6	41185	41190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_018719	CAG	2	6	48120	48125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_018719	GGA	2	6	49533	49538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_018719	CTAT	2	8	49575	49582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
286	NC_018719	TCA	2	6	50712	50717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_018719	TAACA	2	10	50762	50771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_018719	TA	3	6	52001	52006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_018719	TTC	2	6	57078	57083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_018719	TTTG	2	8	84325	84332	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
432	NC_018719	TAC	2	6	84367	84372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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