MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018719	GGC	2	6	243540	243545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_018719	CAAGCA	2	12	244559	244570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_018719	CAGA	2	8	244583	244590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_018719	TGG	2	6	245886	245891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018719	CAA	2	6	245921	245926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_018719	GCT	2	6	245938	245943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_018719	AAG	2	6	245984	245989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018719	CA	3	6	246051	246056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_018719	C	6	6	246729	246734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1010	NC_018719	ACT	2	6	249271	249276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_018719	TAC	2	6	249282	249287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_018719	AGC	2	6	249303	249308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018719	GAA	2	6	249310	249315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018719	AAT	2	6	249455	249460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018719	AGCGCC	2	12	250590	250601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_018719	TGT	2	6	250920	250925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018719	CAAG	2	8	250926	250933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_018719	A	6	6	250968	250973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018719	CAT	2	6	250976	250981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_018719	CGGTAA	2	12	251034	251045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1021	NC_018719	GGC	2	6	251071	251076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_018719	CAG	2	6	251173	251178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018719	ACG	2	6	251182	251187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018719	CAC	2	6	251193	251198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_018719	CAC	2	6	251223	251228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_018719	CAC	2	6	251253	251258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_018719	CAC	2	6	251283	251288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_018719	CAC	2	6	251313	251318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_018719	ACA	2	6	251338	251343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_018719	CAA	2	6	251543	251548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018719	TTG	2	6	252360	252365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018719	GGC	2	6	252388	252393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_018719	AACA	2	8	252422	252429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_018719	TAT	2	6	252436	252441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018719	T	6	6	252470	252475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018719	AGG	2	6	252514	252519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018719	A	6	6	252553	252558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018719	AAG	2	6	252661	252666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018719	AGG	2	6	252682	252687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018719	CAT	2	6	254529	254534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_018719	T	6	6	256043	256048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018719	A	7	7	256286	256292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018719	T	7	7	256335	256341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018719	TACT	2	8	256464	256471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_018719	GAA	2	6	256531	256536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018719	TACAT	2	10	256577	256586	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_018719	GCA	2	6	256604	256609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_018719	GCT	2	6	256702	256707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_018719	ATT	2	6	258115	258120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018719	GT	3	6	258445	258450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018719	CAG	2	6	261335	261340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_018719	CTA	2	6	262144	262149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_018719	A	6	6	262242	262247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018719	GGA	2	6	262255	262260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018719	TAC	2	6	262309	262314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_018719	ATC	2	6	262352	262357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_018719	AAT	2	6	262390	262395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018719	AGT	2	6	262399	262404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018719	GCT	2	6	262412	262417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_018719	GAA	2	6	262474	262479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018719	GAT	2	6	262522	262527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018719	GGCT	2	8	262537	262544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_018719	GGC	2	6	262603	262608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_018719	C	6	6	264458	264463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_018719	TAA	2	6	264641	264646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018719	AG	3	6	264726	264731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018719	ACT	2	6	267000	267005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_018719	TAC	2	6	267011	267016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_018719	AGC	2	6	267032	267037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_018719	GAA	2	6	267039	267044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018719	AAT	2	6	267184	267189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018719	AGCGCC	2	12	268319	268330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_018719	TGT	2	6	268649	268654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018719	CAAG	2	8	268655	268662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_018719	A	6	6	268697	268702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_018719	CAT	2	6	268705	268710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_018719	CGGTAA	2	12	268763	268774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1078	NC_018719	GGC	2	6	268800	268805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_018719	CAG	2	6	268902	268907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_018719	ACG	2	6	268911	268916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_018719	CAC	2	6	268922	268927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_018719	CAC	2	6	268952	268957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_018719	CAC	2	6	268982	268987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_018719	CAC	2	6	269012	269017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_018719	CAC	2	6	269042	269047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_018719	ACA	2	6	269067	269072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_018719	CAA	2	6	269272	269277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_018719	T	7	7	272837	272843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018719	TGA	2	6	272849	272854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018719	GGC	3	9	272860	272868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_018719	T	6	6	273904	273909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018719	TAT	2	6	276667	276672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018719	ATC	2	6	276711	276716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018719	TTG	2	6	276718	276723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018719	TTA	2	6	276769	276774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018719	TTC	2	6	277882	277887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018719	CT	3	6	281118	281123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_018719	AGCT	2	8	281137	281144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_018719	CAA	2	6	281156	281161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_018719	AAAC	2	8	281232	281239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_018719	ACTG	2	8	281363	281370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_018719	CT	3	6	281513	281518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_018719	GTT	2	6	281533	281538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018719	CAA	2	6	281621	281626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_018719	CTT	2	6	281852	281857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_018719	GTG	2	6	281924	281929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018719	TAC	2	6	281971	281976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018719	TGAG	2	8	282148	282155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018719	TGA	2	6	282374	282379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018719	A	6	6	282442	282447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018719	AGC	3	9	282449	282457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_018719	TAT	2	6	282462	282467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018719	ACG	2	6	282531	282536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018719	GACA	2	8	282584	282591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_018719	AAG	2	6	282958	282963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018719	CAC	2	6	283148	283153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_018719	AAC	2	6	283187	283192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_018719	ATA	2	6	283216	283221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018719	AAC	2	6	283408	283413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_018719	CAA	2	6	283508	283513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_018719	GTC	2	6	283590	283595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_018719	ATGT	2	8	283743	283750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018719	AGA	2	6	283895	283900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018719	TAT	2	6	284109	284114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018719	ATT	2	6	284154	284159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018719	T	7	7	284169	284175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018719	CT	3	6	288052	288057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_018719	CTT	2	6	288060	288065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_018719	TAT	3	9	288074	288082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018719	TCCTCT	2	12	288123	288134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_018719	AAT	2	6	288300	288305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018719	CTAT	2	8	288354	288361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_018719	GAAA	2	8	288381	288388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018719	AT	3	6	294277	294282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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