MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_018719	AAT	2	6	2803481	2803486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_018719	TA	3	6	2803496	2803501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_018719	AGG	2	6	2803526	2803531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_018719	TGA	2	6	2803590	2803595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_018719	CATC	2	8	2803629	2803636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_018719	GCA	2	6	2803669	2803674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_018719	AT	3	6	2803683	2803688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_018719	TGT	2	6	2803714	2803719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_018719	ATT	2	6	2803730	2803735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_018719	CAG	2	6	2803744	2803749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_018719	CCAC	2	8	2803818	2803825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12012	NC_018719	TGT	2	6	2804727	2804732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_018719	TTG	2	6	2804765	2804770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_018719	CAA	2	6	2804798	2804803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_018719	ATGT	2	8	2804846	2804853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_018719	AGAT	2	8	2806406	2806413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_018719	TCCT	2	8	2806447	2806454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12018	NC_018719	GCC	2	6	2806458	2806463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_018719	T	6	6	2806533	2806538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_018719	CA	3	6	2806540	2806545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12021	NC_018719	GACAT	2	10	2806562	2806571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12022	NC_018719	GCC	2	6	2806630	2806635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12023	NC_018719	GCT	2	6	2806657	2806662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_018719	GTA	3	9	2806663	2806671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_018719	ATC	3	9	2807042	2807050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_018719	GCA	2	6	2807101	2807106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_018719	GCGT	2	8	2808282	2808289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12028	NC_018719	TCC	2	6	2808297	2808302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12029	NC_018719	CTG	2	6	2808308	2808313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12030	NC_018719	GCA	2	6	2808317	2808322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12031	NC_018719	CACG	2	8	2808377	2808384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12032	NC_018719	GTC	2	6	2808399	2808404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12033	NC_018719	TA	3	6	2810474	2810479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_018719	TA	3	6	2810493	2810498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_018719	ATA	2	6	2810504	2810509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_018719	CAG	2	6	2810618	2810623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_018719	AGC	2	6	2810635	2810640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12038	NC_018719	ACC	2	6	2811459	2811464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12039	NC_018719	ACC	2	6	2811500	2811505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12040	NC_018719	ATC	2	6	2811541	2811546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_018719	CA	3	6	2811594	2811599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12042	NC_018719	AGT	2	6	2811624	2811629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_018719	GTT	3	9	2811642	2811650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_018719	T	6	6	2813194	2813199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_018719	GA	3	6	2813248	2813253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_018719	A	6	6	2814722	2814727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_018719	ATGTA	2	10	2814963	2814972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_018719	CCA	2	6	2815041	2815046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12049	NC_018719	CT	4	8	2815088	2815095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12050	NC_018719	TGC	2	6	2815480	2815485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_018719	ACC	2	6	2818541	2818546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_018719	CCT	3	9	2818565	2818573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12053	NC_018719	GCCT	2	8	2818606	2818613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12054	NC_018719	TGC	3	9	2818621	2818629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_018719	CAA	3	9	2819626	2819634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_018719	TTC	2	6	2819765	2819770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12057	NC_018719	TAA	2	6	2821361	2821366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_018719	GAA	2	6	2821374	2821379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_018719	AAAAAG	2	12	2821393	2821404	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_018719	GT	4	8	2821405	2821412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_018719	AGA	2	6	2821797	2821802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_018719	TGA	2	6	2821804	2821809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_018719	GCG	2	6	2821845	2821850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12064	NC_018719	CCA	2	6	2821859	2821864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12065	NC_018719	T	6	6	2821877	2821882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12066	NC_018719	TTC	2	6	2821971	2821976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12067	NC_018719	AGA	2	6	2822010	2822015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_018719	TA	3	6	2822022	2822027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_018719	GCA	2	6	2823421	2823426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12070	NC_018719	GCG	2	6	2823438	2823443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_018719	CCG	2	6	2823444	2823449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12072	NC_018719	CAG	2	6	2823472	2823477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12073	NC_018719	GTC	2	6	2823503	2823508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12074	NC_018719	AG	3	6	2823524	2823529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_018719	A	6	6	2823566	2823571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_018719	ATA	2	6	2823594	2823599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_018719	CCG	2	6	2823673	2823678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12078	NC_018719	AT	3	6	2823728	2823733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_018719	ACA	2	6	2823756	2823761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12080	NC_018719	AGCT	2	8	2823777	2823784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12081	NC_018719	ATTT	2	8	2824627	2824634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_018719	CA	4	8	2824659	2824666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12083	NC_018719	A	6	6	2825002	2825007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_018719	GC	3	6	2825028	2825033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12085	NC_018719	AT	4	8	2825077	2825084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12086	NC_018719	GTCA	2	8	2831884	2831891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12087	NC_018719	TGT	2	6	2832338	2832343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12088	NC_018719	TGC	2	6	2832364	2832369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12089	NC_018719	GA	3	6	2833517	2833522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_018719	T	6	6	2833561	2833566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_018719	AAC	2	6	2833627	2833632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12092	NC_018719	TGT	2	6	2833707	2833712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.