MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 4585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018697	AAG	2	6	2331118	2331123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_018697	CTAT	2	8	2331186	2331193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_018697	TAA	2	6	2332261	2332266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_018697	A	6	6	2332277	2332282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018697	ATT	2	6	2332304	2332309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018697	T	6	6	2332308	2332313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_018697	A	6	6	2332314	2332319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_018697	TGT	2	6	2332324	2332329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018697	TAA	2	6	2332374	2332379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_018697	AAT	2	6	2332386	2332391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_018697	A	6	6	2332443	2332448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_018697	TAT	2	6	2332884	2332889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018697	T	7	7	2332924	2332930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018697	A	9	9	2332988	2332996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018697	AGG	2	6	2333004	2333009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018697	T	7	7	2334815	2334821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_018697	ATCT	2	8	2334843	2334850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_018697	TAA	2	6	2334875	2334880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_018697	AT	3	6	2335629	2335634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_018697	A	6	6	2335668	2335673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018697	TA	4	8	2335675	2335682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_018697	GA	3	6	2335706	2335711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_018697	A	7	7	2337401	2337407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_018697	T	8	8	2337433	2337440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018697	ATTAAA	2	12	2338256	2338267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_018697	ATC	2	6	2338280	2338285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_018697	ACA	2	6	2338290	2338295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018697	T	6	6	2338337	2338342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_018697	TTAT	2	8	2338447	2338454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_018697	CGAC	2	8	2338458	2338465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_018697	AT	3	6	2338485	2338490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_018697	CAA	2	6	2338516	2338521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_018697	T	6	6	2338525	2338530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_018697	T	7	7	2340619	2340625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_018697	A	8	8	2340693	2340700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018697	ATT	2	6	2340729	2340734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_018697	TTAAT	2	10	2342226	2342235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_018697	ATT	2	6	2342244	2342249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_018697	CTAC	2	8	2342255	2342262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_018697	TAT	2	6	2344267	2344272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_018697	T	7	7	2344296	2344302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018697	CA	3	6	2344314	2344319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_018697	T	6	6	2344331	2344336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_018697	ACA	2	6	2344346	2344351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_018697	TCA	2	6	2347977	2347982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_018697	ATTA	2	8	2347992	2347999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_018697	TAA	2	6	2348038	2348043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_018697	AT	3	6	2348049	2348054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_018697	TAA	2	6	2348084	2348089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_018697	TA	3	6	2348139	2348144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_018697	T	6	6	2348171	2348176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_018697	A	6	6	2350152	2350157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_018697	TTA	2	6	2350210	2350215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_018697	TATT	2	8	2350219	2350226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_018697	AC	3	6	2352128	2352133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_018697	CTAA	2	8	2352188	2352195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_018697	TCA	2	6	2352232	2352237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_018697	T	7	7	2352305	2352311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_018697	TTAC	2	8	2353156	2353163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_018697	ATA	2	6	2353185	2353190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_018697	T	6	6	2353851	2353856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_018697	TCA	2	6	2356830	2356835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_018697	ATT	2	6	2356844	2356849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018697	GATC	2	8	2356871	2356878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_018697	AC	3	6	2356880	2356885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_018697	TGT	2	6	2356921	2356926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_018697	ATT	2	6	2357620	2357625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_018697	ATGA	2	8	2357675	2357682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_018697	TTCA	2	8	2357736	2357743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_018697	ATC	2	6	2357776	2357781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_018697	A	6	6	2357818	2357823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_018697	CT	3	6	2357859	2357864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_018697	A	8	8	2357884	2357891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_018697	CAA	2	6	2357949	2357954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_018697	TAAA	2	8	2359219	2359226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_018697	ACTA	2	8	2359240	2359247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_018697	CTT	2	6	2362757	2362762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_018697	TG	3	6	2362809	2362814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_018697	T	7	7	2362832	2362838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_018697	ATGA	2	8	2362993	2363000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_018697	TAAT	2	8	2363002	2363009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_018697	TTTC	2	8	2363043	2363050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_018697	TAAA	2	8	2363100	2363107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018697	CCG	2	6	2363113	2363118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_018697	T	6	6	2363141	2363146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.