MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 16797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018664	AAT	2	6	2600452	2600457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_018664	ATTT	2	8	2600511	2600518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_018664	A	10	10	2600525	2600534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_018664	A	6	6	2600542	2600547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_018664	AGA	2	6	2600549	2600554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_018664	ATTA	2	8	2600588	2600595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_018664	TCC	2	6	2600834	2600839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14008	NC_018664	ATT	2	6	2600840	2600845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_018664	TATTAA	2	12	2600850	2600861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_018664	TA	3	6	2600878	2600883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_018664	CTT	2	6	2600909	2600914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_018664	GTAAA	2	10	2600946	2600955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_018664	CTC	2	6	2601191	2601196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14014	NC_018664	ACA	2	6	2601228	2601233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_018664	TATT	2	8	2601281	2601288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_018664	ATTT	2	8	2601289	2601296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_018664	TAA	2	6	2601316	2601321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_018664	TAA	2	6	2601331	2601336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_018664	TCC	2	6	2601350	2601355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_018664	ATCA	2	8	2601380	2601387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14021	NC_018664	ATA	2	6	2601438	2601443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_018664	TTTC	2	8	2601454	2601461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_018664	CCT	2	6	2601691	2601696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_018664	TAT	2	6	2602167	2602172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_018664	TCC	2	6	2602208	2602213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14026	NC_018664	ATA	2	6	2602343	2602348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_018664	AT	3	6	2602435	2602440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_018664	AACTA	2	10	2602477	2602486	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14029	NC_018664	TA	3	6	2602527	2602532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_018664	ACT	2	6	2602547	2602552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_018664	TGT	2	6	2603242	2603247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_018664	TCT	2	6	2603266	2603271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_018664	TAC	2	6	2603283	2603288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_018664	TAAT	2	8	2603304	2603311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_018664	AT	3	6	2603317	2603322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_018664	ATA	2	6	2603335	2603340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_018664	CCT	2	6	2603350	2603355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_018664	ATCT	2	8	2603359	2603366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14039	NC_018664	TA	3	6	2603387	2603392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_018664	CTT	2	6	2603393	2603398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_018664	TAC	2	6	2603431	2603436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_018664	TAA	2	6	2603444	2603449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_018664	TA	4	8	2603452	2603459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_018664	TAA	2	6	2603481	2603486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_018664	AATG	2	8	2603497	2603504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_018664	TTC	2	6	2603928	2603933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_018664	ATATA	2	10	2603940	2603949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_018664	AAAC	2	8	2603972	2603979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14049	NC_018664	ATA	2	6	2603994	2603999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_018664	TAAA	2	8	2604073	2604080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_018664	TGAT	2	8	2604082	2604089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_018664	CCT	2	6	2604106	2604111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14053	NC_018664	TA	3	6	2604185	2604190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_018664	TAT	2	6	2604208	2604213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_018664	GAA	2	6	2604242	2604247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_018664	TA	4	8	2604253	2604260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_018664	ACT	2	6	2604289	2604294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_018664	TAA	2	6	2604308	2604313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_018664	AGT	2	6	2604330	2604335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_018664	TAG	2	6	2604350	2604355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_018664	AT	4	8	2604387	2604394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_018664	TAA	2	6	2604427	2604432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_018664	AT	3	6	2604435	2604440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_018664	AGG	2	6	2604442	2604447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_018664	CCT	2	6	2604469	2604474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14066	NC_018664	CTA	2	6	2604616	2604621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_018664	AGAA	2	8	2604624	2604631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_018664	T	6	6	2604645	2604650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_018664	GTT	2	6	2604660	2604665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_018664	TATG	2	8	2604676	2604683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_018664	TAA	2	6	2604695	2604700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_018664	TTTA	2	8	2604713	2604720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_018664	TAA	2	6	2604741	2604746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_018664	ATAA	2	8	2604761	2604768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_018664	TCC	2	6	2604778	2604783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_018664	TAAA	2	8	2604866	2604873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_018664	ACT	2	6	2604892	2604897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_018664	ATT	2	6	2604905	2604910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_018664	ATA	2	6	2604972	2604977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_018664	AAC	2	6	2604988	2604993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_018664	TAA	3	9	2605026	2605034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_018664	CCT	2	6	2605037	2605042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14083	NC_018664	CTCAAT	2	12	2605121	2605132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_018664	ATC	2	6	2605164	2605169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_018664	GCTG	2	8	2605180	2605187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14086	NC_018664	TCT	2	6	2605189	2605194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_018664	ATA	2	6	2605206	2605211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_018664	GAA	2	6	2605212	2605217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_018664	AT	3	6	2605229	2605234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_018664	TA	3	6	2605315	2605320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_018664	A	6	6	2605332	2605337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_018664	TTA	2	6	2605720	2605725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_018664	ACT	2	6	2605736	2605741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_018664	TGT	2	6	2605801	2605806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_018664	ATA	2	6	2605815	2605820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_018664	CAT	3	9	2605839	2605847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_018664	ATTA	2	8	2605864	2605871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_018664	TCC	2	6	2606757	2606762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14099	NC_018664	TTTTAA	2	12	2606763	2606774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_018664	A	7	7	2606779	2606785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_018664	AT	3	6	2606839	2606844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_018664	T	6	6	2606862	2606867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_018664	TA	3	6	2607173	2607178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_018664	GA	3	6	2607221	2607226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_018664	TTA	2	6	2607227	2607232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_018664	GAA	2	6	2607271	2607276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_018664	TA	4	8	2607297	2607304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_018664	AAATAT	2	12	2607335	2607346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_018664	TAC	3	9	2607862	2607870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14110	NC_018664	AT	4	8	2607916	2607923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_018664	TAAT	2	8	2607938	2607945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_018664	TA	4	8	2607953	2607960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_018664	A	6	6	2608000	2608005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_018664	ATT	2	6	2608045	2608050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_018664	TCC	2	6	2608053	2608058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_018664	CAT	2	6	2608067	2608072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_018664	AT	3	6	2608153	2608158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_018664	CTTA	2	8	2608193	2608200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14119	NC_018664	CAT	2	6	2608231	2608236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_018664	ATT	2	6	2608250	2608255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_018664	AT	3	6	2608279	2608284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_018664	AAT	2	6	2608301	2608306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_018664	ATTC	2	8	2608325	2608332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_018664	ATT	2	6	2608697	2608702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_018664	CCT	2	6	2608703	2608708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_018664	ATC	2	6	2608726	2608731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_018664	T	6	6	2608737	2608742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_018664	TAT	2	6	2608767	2608772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_018664	TTTC	2	8	2608799	2608806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14131	NC_018664	TTTA	2	8	2608820	2608827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14265	NC_018664	GAT	2	6	2661370	2661375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14266	NC_018664	T	6	6	2661418	2661423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14267	NC_018664	ATT	2	6	2661426	2661431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14381	NC_018664	TGCA	2	8	2690685	2690692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14384	NC_018664	TA	3	6	2690731	2690736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14385	NC_018664	TAA	2	6	2690786	2690791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14387	NC_018664	AATT	2	8	2690929	2690936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14388	NC_018664	TA	3	6	2691616	2691621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14389	NC_018664	TTCT	2	8	2691625	2691632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14390	NC_018664	ATC	3	9	2691652	2691660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14393	NC_018664	ATC	2	6	2691766	2691771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14396	NC_018664	TAC	2	6	2691840	2691845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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