MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 16797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018664	AAGTT	2	10	2490369	2490378	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_018664	ATT	2	6	2490448	2490453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_018664	CAT	2	6	2490525	2490530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_018664	TAATGT	2	12	2490531	2490542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_018664	TCTTTT	2	12	2490556	2490567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13506	NC_018664	ATTT	2	8	2490584	2490591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_018664	AAG	2	6	2490619	2490624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_018664	CTTTA	2	10	2490634	2490643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13509	NC_018664	TATAA	2	10	2490645	2490654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_018664	A	6	6	2490700	2490705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_018664	A	7	7	2490712	2490718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_018664	CTC	2	6	2491173	2491178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_018664	AT	3	6	2491187	2491192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_018664	ACTT	2	8	2491202	2491209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13515	NC_018664	TA	3	6	2491213	2491218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_018664	TAC	2	6	2491568	2491573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_018664	TTCC	2	8	2491613	2491620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13518	NC_018664	ATT	2	6	2491625	2491630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_018664	GTTTA	2	10	2492453	2492462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_018664	AT	3	6	2492463	2492468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_018664	A	7	7	2492827	2492833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_018664	T	6	6	2492851	2492856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_018664	CCT	2	6	2493144	2493149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13524	NC_018664	A	7	7	2493161	2493167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_018664	AAT	2	6	2493180	2493185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_018664	TAAA	2	8	2493196	2493203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_018664	CTT	2	6	2493207	2493212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_018664	AAT	2	6	2493215	2493220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_018664	T	7	7	2493222	2493228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_018664	TCC	2	6	2494711	2494716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_018664	T	6	6	2494722	2494727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_018664	AAT	2	6	2494741	2494746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_018664	C	7	7	2496373	2496379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13534	NC_018664	ATTT	2	8	2496393	2496400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_018664	TAT	2	6	2496407	2496412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_018664	TAC	2	6	2496417	2496422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_018664	A	10	10	2496425	2496434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_018664	CTA	2	6	2496440	2496445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_018664	TTA	2	6	2496447	2496452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_018664	TAT	2	6	2496474	2496479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_018664	CCT	2	6	2497041	2497046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_018664	TAT	2	6	2497061	2497066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_018664	T	6	6	2497072	2497077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_018664	ATT	2	6	2497079	2497084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_018664	TTA	2	6	2497152	2497157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_018664	A	7	7	2497162	2497168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_018664	T	6	6	2497191	2497196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_018664	AATT	2	8	2497197	2497204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_018664	CT	3	6	2497222	2497227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13550	NC_018664	GTTA	2	8	2498372	2498379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_018664	TAAA	2	8	2501953	2501960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_018664	AAC	2	6	2501963	2501968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_018664	CTC	2	6	2502581	2502586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13554	NC_018664	TCC	2	6	2503552	2503557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13555	NC_018664	TGC	2	6	2503558	2503563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_018664	TTA	2	6	2503564	2503569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_018664	A	7	7	2504979	2504985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_018664	ATC	2	6	2505000	2505005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_018664	A	7	7	2505031	2505037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_018664	TATAT	2	10	2505051	2505060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_018664	ATA	2	6	2505079	2505084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_018664	A	6	6	2505091	2505096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_018664	A	6	6	2505104	2505109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_018664	ACC	2	6	2505399	2505404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13565	NC_018664	TCC	2	6	2506287	2506292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13566	NC_018664	ATTAT	2	10	2506312	2506321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_018664	TA	4	8	2506358	2506365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_018664	TTTAT	2	10	2506371	2506380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_018664	ATT	2	6	2506432	2506437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_018664	A	6	6	2506447	2506452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_018664	A	6	6	2507933	2507938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_018664	T	6	6	2507944	2507949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_018664	ATA	2	6	2507988	2507993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_018664	TA	3	6	2508024	2508029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_018664	A	7	7	2508051	2508057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_018664	T	6	6	2508122	2508127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_018664	TG	3	6	2508153	2508158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_018664	T	6	6	2508163	2508168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_018664	TA	3	6	2508221	2508226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_018664	GTTT	2	8	2508259	2508266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_018664	AAC	2	6	2511872	2511877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_018664	AT	3	6	2511885	2511890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_018664	AT	3	6	2511900	2511905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_018664	TATT	2	8	2511956	2511963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_018664	TACCTT	2	12	2512927	2512938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_018664	AACA	2	8	2513215	2513222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13587	NC_018664	GTAA	2	8	2513286	2513293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_018664	GAA	2	6	2513294	2513299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_018664	T	6	6	2513304	2513309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_018664	A	6	6	2513317	2513322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_018664	TTA	2	6	2513327	2513332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_018664	TAA	2	6	2513347	2513352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_018664	T	6	6	2513359	2513364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_018664	TTTAT	3	15	2514360	2514374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_018664	T	6	6	2514374	2514379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_018664	A	7	7	2514424	2514430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_018664	GAT	2	6	2514435	2514440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_018664	TCC	2	6	2518231	2518236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13599	NC_018664	CTA	3	9	2518273	2518281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_018664	GTT	2	6	2518285	2518290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_018664	CATAT	2	10	2518301	2518310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13602	NC_018664	TA	3	6	2518380	2518385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_018664	A	6	6	2518401	2518406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_018664	T	6	6	2518434	2518439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_018664	AT	3	6	2518471	2518476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_018664	TTTC	2	8	2519281	2519288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13607	NC_018664	ATT	2	6	2519372	2519377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_018664	TATAA	2	10	2519391	2519400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_018664	TAAAA	2	10	2519405	2519414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_018664	AAT	2	6	2519418	2519423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_018664	ACT	2	6	2519446	2519451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_018664	TA	3	6	2519482	2519487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_018664	GTA	2	6	2519491	2519496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_018664	AT	3	6	2519501	2519506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_018664	CTT	2	6	2519507	2519512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_018664	TTC	2	6	2519524	2519529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_018664	AT	3	6	2519548	2519553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_018664	AATTAA	2	12	2519578	2519589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_018664	AT	3	6	2519590	2519595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_018664	AAAG	2	8	2519602	2519609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_018664	A	6	6	2520067	2520072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_018664	TCA	2	6	2520073	2520078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_018664	AT	6	12	2520090	2520101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_018664	GAT	3	9	2520141	2520149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_018664	TTAAA	2	10	2520151	2520160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_018664	AGA	2	6	2520171	2520176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_018664	TAA	2	6	2520465	2520470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_018664	ATCAT	2	10	2522571	2522580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13629	NC_018664	ATT	2	6	2522582	2522587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13630	NC_018664	CTA	2	6	2522609	2522614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13631	NC_018664	TCC	2	6	2522676	2522681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13633	NC_018664	TA	4	8	2522776	2522783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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