MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 5216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AATC	2	8	13	20	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018656	AC	3	6	46	51	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018656	AATC	2	8	79	86	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018656	TTG	2	6	117	122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018656	AAT	2	6	140	145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018656	TCAA	2	8	172	179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018656	GTATCT	2	12	198	209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018656	TCC	2	6	290	295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018656	CT	3	6	327	332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018656	GTA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018656	CTA	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018656	TCA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018656	ATG	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018656	ATA	2	6	535	540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018656	AAAC	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018656	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018656	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018656	ACC	2	6	687	692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018656	AAT	2	6	734	739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018656	ATT	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018656	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018656	GGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018656	CTTT	2	8	868	875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018656	AGA	2	6	905	910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018656	AAT	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	TGA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018656	ATG	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	TTG	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018656	TTG	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018656	GAT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018656	CTG	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018656	GAT	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018656	TGG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018656	AGC	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018656	TGG	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018656	ACT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018656	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_018656	CAAT	2	8	1516	1523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018656	CCA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018656	CTA	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018656	ATC	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018656	AGA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018656	ACAA	2	8	1767	1774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018656	TCA	2	6	1785	1790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018656	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018656	ACA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018656	ATG	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018656	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018656	CAT	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018656	TGA	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018656	ACA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018656	AGCCA	2	10	2224	2233	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018656	GAAGTT	2	12	2247	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018656	CAT	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018656	TAAT	2	8	2353	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018656	AGT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018656	TGT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018656	ATT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018656	GTA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018656	TGA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018656	GTG	2	6	2731	2736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018656	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018656	AAT	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018656	TGA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018656	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018656	AGA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018656	AAAAT	2	10	2916	2925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018656	TAAT	2	8	2960	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018656	T	6	6	2978	2983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018656	TCAC	2	8	4459	4466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018656	AAAT	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018656	ACA	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018656	A	6	6	5368	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018656	TAA	2	6	11008	11013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018656	ACTAA	2	10	12056	12065	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018656	AGA	2	6	12074	12079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018656	AAT	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018656	TTA	2	6	12383	12388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018656	AAT	2	6	12448	12453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018656	T	8	8	12480	12487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018656	AGT	2	6	14567	14572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018656	AAT	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018656	TAA	2	6	15075	15080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018656	T	6	6	15087	15092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018656	TCT	2	6	18195	18200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018656	TAAA	2	8	18825	18832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018656	A	6	6	18830	18835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018656	TAA	2	6	22648	22653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018656	ATT	2	6	23800	23805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018656	TTAAAA	2	12	23815	23826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018656	T	6	6	26196	26201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018656	TAA	2	6	26212	26217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018656	AACT	2	8	27057	27064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018656	A	6	6	27074	27079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018656	AAT	2	6	27088	27093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018656	AAAG	2	8	27100	27107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018656	ATA	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018656	T	6	6	27165	27170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018656	A	6	6	27178	27183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018656	A	6	6	27188	27193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018656	A	7	7	27197	27203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018656	TTACA	2	10	27214	27223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018656	AGA	2	6	27254	27259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018656	A	6	6	27331	27336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018656	TCC	2	6	27349	27354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018656	TAC	2	6	27367	27372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018656	TGA	2	6	27448	27453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018656	ATT	2	6	27463	27468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018656	ATC	2	6	27531	27536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018656	TC	3	6	27535	27540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018656	TGT	2	6	27592	27597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018656	ATG	2	6	27648	27653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018656	AAATA	2	10	27657	27666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018656	A	6	6	27696	27701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018656	TTC	2	6	27741	27746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018656	AAAAG	2	10	27793	27802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018656	CAT	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018656	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018656	AAG	2	6	27843	27848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018656	AGA	2	6	27853	27858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018656	GT	3	6	27899	27904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018656	TGA	3	9	28060	28068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018656	AAG	2	6	28101	28106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018656	GAA	2	6	28115	28120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018656	A	6	6	28122	28127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018656	ATG	2	6	28131	28136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018656	CAT	2	6	28157	28162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018656	TAA	2	6	28263	28268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018656	T	6	6	28304	28309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018656	A	6	6	28334	28339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018656	TTCA	2	8	28345	28352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018656	A	8	8	28420	28427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018656	TGA	2	6	28522	28527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018656	AGG	2	6	28561	28566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018656	GTA	2	6	28644	28649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018656	ATT	2	6	28685	28690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018656	AAATT	2	10	28694	28703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018656	TGA	2	6	28717	28722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018656	ATA	2	6	28725	28730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018656	ATTC	2	8	28769	28776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018656	CT	3	6	28817	28822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018656	GAT	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018656	GT	3	6	29015	29020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018656	A	7	7	29024	29030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018656	GTT	2	6	29037	29042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018656	AT	3	6	29055	29060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018656	GAAA	2	8	29061	29068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018656	AAT	2	6	29168	29173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018656	TTG	2	6	62224	62229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_018656	CTG	2	6	137185	137190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_018656	A	6	6	154529	154534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_018656	TGAG	2	8	157177	157184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_018656	TCA	2	6	157197	157202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_018656	A	6	6	157205	157210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_018656	TCT	2	6	157254	157259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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