MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018655	GATT	2	8	1175169	1175176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018655	TGA	2	6	1175235	1175240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018655	A	7	7	1175259	1175265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018655	ATT	2	6	1175359	1175364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_018655	TGT	2	6	1175388	1175393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_018655	ATA	2	6	1175429	1175434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018655	TAG	2	6	1175439	1175444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018655	ATT	2	6	1175606	1175611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018655	AGA	2	6	1175626	1175631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018655	TGA	2	6	1175730	1175735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018655	ACA	2	6	1175750	1175755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_018655	AGAA	2	8	1175767	1175774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018655	A	7	7	1175773	1175779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018655	TAG	2	6	1175784	1175789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018655	ATT	2	6	1175935	1175940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018655	AGA	2	6	1177742	1177747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018655	GTAT	2	8	1177766	1177773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018655	A	6	6	1177781	1177786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018655	ATG	2	6	1177788	1177793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018655	GCTACA	2	12	1178499	1178510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_018655	TCC	2	6	1178516	1178521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_018655	TCAAA	2	10	1178600	1178609	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_018655	CAT	2	6	1178612	1178617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_018655	TTG	2	6	1178650	1178655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018655	ATT	2	6	1179513	1179518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018655	ATAAA	2	10	1180039	1180048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4028	NC_018655	GAAA	2	8	1180053	1180060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018655	AAT	2	6	1180101	1180106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018655	T	6	6	1180120	1180125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018655	A	6	6	1180130	1180135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018655	TTGTT	2	10	1180207	1180216	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018655	T	6	6	1180234	1180239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018655	TCTT	2	8	1180275	1180282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_018655	AAT	2	6	1180287	1180292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_018655	ACA	2	6	1180314	1180319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_018655	CACAT	2	10	1180336	1180345	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4038	NC_018655	TGG	2	6	1180360	1180365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018655	GCAT	2	8	1180377	1180384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_018655	AAT	2	6	1180449	1180454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018655	AAT	2	6	1180939	1180944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018655	T	6	6	1181022	1181027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018655	TATTT	2	10	1181173	1181182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018655	CTA	2	6	1182803	1182808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_018655	ATT	2	6	1182810	1182815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018655	CCA	2	6	1182832	1182837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_018655	TAAA	2	8	1182861	1182868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018655	A	6	6	1182866	1182871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018655	TCA	2	6	1182926	1182931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_018655	ATT	2	6	1182939	1182944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018655	T	6	6	1182943	1182948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_018655	AATG	2	8	1182987	1182994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018655	T	6	6	1183073	1183078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018655	AGG	2	6	1183119	1183124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4056	NC_018655	ATG	2	6	1183163	1183168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4058	NC_018655	GAT	3	9	1183183	1183191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018655	TGA	3	9	1183194	1183202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018655	AT	3	6	1184709	1184714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018655	TTA	2	6	1184716	1184721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018655	AGA	2	6	1184997	1185002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018655	TGA	2	6	1185116	1185121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_018655	T	7	7	1185159	1185165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018655	A	6	6	1185615	1185620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018655	TCT	2	6	1185667	1185672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_018655	TTC	2	6	1185684	1185689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_018655	A	6	6	1185751	1185756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018655	TGG	2	6	1185782	1185787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018655	ATGC	2	8	1185809	1185816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4073	NC_018655	GA	3	6	1185870	1185875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018655	GAG	2	6	1185900	1185905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_018655	CA	3	6	1185915	1185920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_018655	GCA	2	6	1185924	1185929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_018655	TTG	2	6	1185999	1186004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_018655	GA	3	6	1186086	1186091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_018655	A	6	6	1186152	1186157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018655	ATCA	2	8	1186160	1186167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_018655	TAC	2	6	1186174	1186179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4084	NC_018655	A	6	6	1186345	1186350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018655	ATT	2	6	1186374	1186379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018655	AAAATT	2	12	1186392	1186403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_018655	A	7	7	1187002	1187008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018655	TA	3	6	1187019	1187024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018655	CAT	2	6	1187034	1187039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_018655	CAAT	2	8	1187083	1187090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_018655	CTTTA	2	10	1187133	1187142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4094	NC_018655	A	6	6	1187183	1187188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018655	TGA	2	6	1187200	1187205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_018655	GCTTTG	2	12	1187346	1187357	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4098	NC_018655	T	7	7	1187377	1187383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018655	TTCT	2	8	1187385	1187392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_018655	GTT	2	6	1187438	1187443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018655	ACT	2	6	1187553	1187558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_018655	ATT	2	6	1188311	1188316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018655	AT	3	6	1188324	1188329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018655	TGA	2	6	1188333	1188338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018655	TGT	2	6	1188383	1188388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018655	GTA	2	6	1188395	1188400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018655	TTAAT	2	10	1188422	1188431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018655	TTA	2	6	1188433	1188438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018655	TCA	2	6	1188444	1188449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_018655	TGG	2	6	1188518	1188523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018655	TAGG	2	8	1188543	1188550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018655	GAA	2	6	1188607	1188612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018655	AGA	2	6	1188647	1188652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018655	TTG	2	6	1188702	1188707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018655	A	6	6	1188739	1188744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018655	A	7	7	1188794	1188800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018655	TAAT	2	8	1188808	1188815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018655	ACT	2	6	1188825	1188830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_018655	AAT	2	6	1188841	1188846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018655	TGT	2	6	1188853	1188858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018655	TACA	2	8	1188963	1188970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_018655	A	6	6	1189852	1189857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018655	ATTA	2	8	1189859	1189866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018655	TTC	2	6	1189890	1189895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_018655	TGA	2	6	1189968	1189973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_018655	ATT	2	6	1190085	1190090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018655	CAA	2	6	1190131	1190136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_018655	AACC	2	8	1190180	1190187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4132	NC_018655	A	6	6	1190344	1190349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_018655	TCC	2	6	1192532	1192537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4142	NC_018655	GAAT	2	8	1195113	1195120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_018655	A	6	6	1208005	1208010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_018655	TGT	2	6	1234598	1234603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_018655	A	7	7	1234661	1234667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_018655	TAA	2	6	1234686	1234691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_018655	A	6	6	1234729	1234734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_018655	ATC	2	6	1234887	1234892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_018655	AGA	2	6	1235070	1235075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_018655	ATTCT	2	10	1235219	1235228	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4302	NC_018655	A	7	7	1246524	1246530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4394	NC_018655	GAAT	2	8	1256623	1256630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_018655	TTGT	2	8	1256767	1256774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_018655	GT	3	6	1256782	1256787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_018655	TAG	2	6	1256793	1256798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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