MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC plasmid pcpWC

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018639	TGT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018639	T	6	6	188	193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018639	TC	3	6	219	224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018639	GTT	2	6	240	245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018639	AGTA	2	8	268	275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018639	TAT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018639	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018639	ACT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018639	A	7	7	445	451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018639	CTT	2	6	459	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018639	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018639	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018639	A	8	8	1641	1648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018639	AT	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018639	TTAA	2	8	1667	1674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018639	TAATT	2	10	2512	2521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018639	T	8	8	2520	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018639	CAA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018639	AAT	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018639	AAT	2	6	6081	6086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018639	A	6	6	6095	6100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018639	ATC	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018639	TA	3	6	6130	6135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018639	T	7	7	7118	7124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018639	ACC	2	6	7138	7143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018639	ACC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018639	ACC	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018639	ACC	2	6	7204	7209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018639	TTC	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018639	TGC	2	6	7278	7283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018639	AGA	2	6	7374	7379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018639	AC	3	6	7441	7446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018639	TCTG	2	8	7450	7457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018639	AGA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018639	AGG	2	6	7470	7475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.