MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 2784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018627	TTTTTA	2	12	210481	210492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018627	GAA	2	6	210532	210537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018627	GTC	2	6	211072	211077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_018627	T	6	6	211161	211166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018627	GTTT	2	8	211870	211877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018627	T	6	6	211889	211894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018627	TTG	2	6	212990	212995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018627	ATC	2	6	213070	213075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018627	TGC	2	6	213186	213191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018627	AGC	2	6	213199	213204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_018627	CAT	2	6	213240	213245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_018627	AT	3	6	213244	213249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018627	AAAG	2	8	213265	213272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018627	TAC	2	6	213291	213296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018627	GGT	2	6	213345	213350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018627	TCT	2	6	213469	213474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_018627	CATA	2	8	213542	213549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_018627	CCT	2	6	213601	213606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_018627	ATGT	2	8	213658	213665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018627	ACA	2	6	213670	213675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018627	GCC	2	6	213700	213705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_018627	AAG	2	6	213710	213715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018627	A	7	7	213744	213750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018627	AAG	2	6	215284	215289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018627	TGA	2	6	215321	215326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018627	TAA	2	6	215358	215363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018627	T	6	6	215391	215396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018627	AT	3	6	215436	215441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018627	GA	3	6	215496	215501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018627	GT	3	6	215536	215541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018627	CT	3	6	215573	215578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_018627	T	8	8	215601	215608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018627	T	6	6	215666	215671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018627	T	6	6	215712	215717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018627	A	6	6	215763	215768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018627	AG	3	6	215802	215807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018627	TC	3	6	215861	215866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_018627	ATA	2	6	222912	222917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018627	AG	3	6	222920	222925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018627	AAGA	2	8	222927	222934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018627	AGA	2	6	225889	225894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018627	ATAAA	2	10	225895	225904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018627	A	6	6	225916	225921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018627	T	8	8	225971	225978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018627	G	6	6	226036	226041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018627	CTT	2	6	226362	226367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018627	TCG	2	6	226597	226602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018627	CACG	2	8	226676	226683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_018627	AAT	2	6	226706	226711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018627	AACA	2	8	226744	226751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_018627	ATTTT	2	10	226752	226761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018627	TTA	2	6	226762	226767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018627	A	8	8	226800	226807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018627	TAA	2	6	226825	226830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018627	TAAAGA	2	12	226837	226848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018627	TAA	2	6	226861	226866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018627	A	6	6	226905	226910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018627	A	6	6	228291	228296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018627	T	8	8	228297	228304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018627	AAG	2	6	228331	228336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018627	TAT	2	6	228347	228352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018627	T	6	6	229235	229240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018627	ATA	2	6	229255	229260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018627	CCT	2	6	229729	229734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_018627	ATA	2	6	229757	229762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018627	T	8	8	229804	229811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018627	A	6	6	232235	232240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018627	ATTA	2	8	232249	232256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018627	TA	4	8	232255	232262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018627	T	6	6	232266	232271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018627	T	6	6	232302	232307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018627	GAT	2	6	232319	232324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018627	GCG	2	6	232333	232338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018627	GAT	2	6	232376	232381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018627	T	6	6	235972	235977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018627	AG	3	6	237000	237005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018627	AT	3	6	237070	237075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018627	CTA	2	6	237179	237184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_018627	CTTG	2	8	238174	238181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_018627	GAAT	2	8	238225	238232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018627	GAA	3	9	238239	238247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018627	T	6	6	238262	238267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018627	AAG	2	6	238271	238276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018627	T	7	7	238286	238292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018627	AAG	2	6	238325	238330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018627	ACC	2	6	238344	238349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_018627	AATT	2	8	238364	238371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018627	GAT	2	6	238405	238410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018627	TTTC	2	8	238464	238471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_018627	GTT	2	6	238492	238497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018627	A	8	8	238533	238540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018627	AGA	2	6	238575	238580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018627	ATTATA	2	12	239707	239718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018627	A	6	6	239742	239747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018627	CTT	2	6	239779	239784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018627	TAT	2	6	239806	239811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018627	ATAA	2	8	239847	239854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018627	GA	3	6	239889	239894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018627	A	6	6	239924	239929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018627	GCA	2	6	239942	239947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018627	GCA	2	6	239952	239957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018627	T	6	6	240168	240173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018627	GTTT	2	8	240896	240903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018627	TAG	2	6	240964	240969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018627	A	7	7	241056	241062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018627	AG	3	6	241098	241103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018627	TAT	2	6	241114	241119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018627	TCAT	2	8	241126	241133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_018627	ATA	2	6	241141	241146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018627	TGT	2	6	242662	242667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018627	TTGAAT	2	12	244020	244031	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018627	AGGA	2	8	244056	244063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018627	AG	3	6	244064	244069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018627	T	7	7	244078	244084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018627	AAG	2	6	247853	247858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018627	AAT	2	6	250166	250171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018627	T	6	6	250224	250229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018627	CGA	2	6	252210	252215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_018627	GAA	2	6	252283	252288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018627	AAT	2	6	252316	252321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018627	T	8	8	252332	252339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018627	TTG	2	6	253031	253036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018627	TGA	2	6	253084	253089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018627	T	6	6	253115	253120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018627	T	7	7	253164	253170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018627	T	6	6	253186	253191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018627	A	7	7	253194	253200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018627	TAT	2	6	255843	255848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018627	TTG	2	6	255873	255878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018627	TTTAA	2	10	255885	255894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018627	AAGAT	2	10	255959	255968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018627	T	6	6	261583	261588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018627	GT	3	6	261606	261611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018627	ATT	2	6	261724	261729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018627	A	6	6	261750	261755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018627	ATATAA	2	12	261771	261782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018627	T	6	6	261799	261804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018627	TAAA	2	8	263024	263031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018627	ATT	2	6	263037	263042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018627	GTT	2	6	263058	263063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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