MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018623	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018623	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018623	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018623	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018623	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018623	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018623	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018623	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018623	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018623	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018623	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018623	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018623	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018623	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018623	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018623	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018623	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018623	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018623	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018623	TCC	2	6	18549	18554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018623	GTT	2	6	20324	20329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018623	TCC	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018623	TTA	2	6	20340	20345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018623	T	6	6	20379	20384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018623	TCT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018623	AAT	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018623	TAA	2	6	21724	21729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018623	T	9	9	21771	21779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018623	TAA	2	6	21788	21793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018623	T	6	6	21811	21816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018623	ATT	2	6	23765	23770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018623	T	7	7	23806	23812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018623	AAG	2	6	23892	23897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018623	CTT	2	6	24519	24524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018623	AGG	2	6	24540	24545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018623	GTA	2	6	24553	24558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018623	GCA	2	6	24614	24619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018623	TTA	2	6	24623	24628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018623	AATT	2	8	24630	24637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018623	ATAA	2	8	24697	24704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018623	TCA	2	6	24758	24763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018623	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018623	T	7	7	26575	26581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018623	TTG	2	6	26625	26630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018623	ACT	2	6	26649	26654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018623	ATTA	2	8	26663	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018623	TAAAAA	2	12	26698	26709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018623	T	6	6	29344	29349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018623	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018623	A	6	6	30342	30347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018623	TTTC	2	8	31654	31661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018623	GA	3	6	31716	31721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018623	T	6	6	31772	31777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018623	AGA	2	6	31972	31977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018623	TC	3	6	31982	31987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018623	TCTA	2	8	32060	32067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018623	A	6	6	32366	32371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018623	AATT	2	8	32381	32388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018623	AAT	2	6	32410	32415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018623	TTAA	2	8	32421	32428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018623	TTA	2	6	33431	33436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018623	AAG	2	6	33452	33457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018623	A	6	6	33508	33513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018623	TGT	3	9	33527	33535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018623	TGA	2	6	33560	33565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018623	ACA	2	6	33570	33575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018623	ATT	2	6	33589	33594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018623	T	6	6	33593	33598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018623	TGG	2	6	34229	34234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018623	GA	3	6	34261	34266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018623	ATT	2	6	34268	34273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018623	ATAAA	2	10	34285	34294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018623	A	6	6	34302	34307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018623	TTC	2	6	37589	37594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018623	AG	3	6	37613	37618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018623	TTC	2	6	37630	37635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018623	TGC	2	6	37678	37683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018623	TG	3	6	37706	37711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018623	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018623	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018623	AGA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018623	TGTT	2	8	37991	37998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018623	ATCT	2	8	38009	38016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018623	ATAG	2	8	38043	38050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018623	TAT	2	6	38104	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018623	GAA	2	6	39480	39485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018623	GCA	2	6	39924	39929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018623	GAA	2	6	42408	42413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018623	AGT	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018623	TTTTAA	2	12	42720	42731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018623	CAA	2	6	42772	42777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018623	A	6	6	43437	43442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018623	GTT	2	6	43449	43454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018623	GAC	2	6	44138	44143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018623	ACG	2	6	44173	44178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018623	GTCG	2	8	44196	44203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018623	GTC	2	6	44214	44219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018623	GAA	2	6	49509	49514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018623	ATAA	2	8	49529	49536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018623	A	6	6	49538	49543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018623	TA	3	6	52212	52217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018623	GAT	2	6	52228	52233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018623	TCG	2	6	52295	52300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018623	TTG	2	6	52310	52315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018623	T	6	6	52326	52331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018623	T	8	8	52361	52368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018623	GTC	2	6	52414	52419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018623	A	6	6	52450	52455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018623	TTTTG	2	10	52485	52494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018623	AAG	2	6	52514	52519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018623	AAAG	2	8	52609	52616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018623	TTTA	2	8	52619	52626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018623	A	6	6	54477	54482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018623	T	7	7	54502	54508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018623	AAT	2	6	54530	54535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018623	AAAG	2	8	54787	54794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018623	ACT	2	6	54809	54814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018623	GTT	2	6	57781	57786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018623	TGG	2	6	57861	57866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018623	TAA	2	6	57971	57976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018623	A	6	6	58085	58090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018623	A	8	8	58100	58107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018623	TCTTT	2	10	59411	59420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018623	GGC	2	6	59450	59455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018623	GAG	2	6	59509	59514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018623	ATT	2	6	59558	59563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018623	TTA	2	6	59585	59590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018623	A	6	6	59607	59612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018623	TAA	2	6	59660	59665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018623	AGA	2	6	59736	59741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018623	GT	4	8	59893	59900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018623	T	7	7	59900	59906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018623	CTA	2	6	59975	59980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018623	CAA	2	6	63299	63304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018623	TG	3	6	63308	63313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018623	GTT	2	6	64379	64384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018623	A	6	6	64392	64397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018623	AGA	2	6	64407	64412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018623	AAT	2	6	64444	64449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018623	TTG	2	6	64473	64478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018623	GCTTT	2	10	64550	64559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018623	CTTT	2	8	64570	64577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018623	AAT	2	6	64638	64643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018623	TGT	2	6	66154	66159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018623	ATT	2	6	66179	66184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018623	A	6	6	71069	71074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018623	T	6	6	71075	71080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018623	A	7	7	71124	71130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018623	CACTT	2	10	71132	71141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_018623	ATA	2	6	71240	71245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018623	T	6	6	72130	72135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018623	TTA	3	9	74097	74105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018623	ATC	2	6	76094	76099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018623	TCA	2	6	77419	77424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018623	ATT	2	6	77506	77511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018623	TAAT	2	8	77657	77664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018623	TATT	2	8	77674	77681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018623	TTAA	2	8	77683	77690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018623	TAA	2	6	77714	77719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018623	GCGT	2	8	77722	77729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_018623	AATTT	2	10	77738	77747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_018623	TAT	2	6	77775	77780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018623	T	6	6	81797	81802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018623	TGT	2	6	81807	81812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_018623	A	8	8	84774	84781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018623	ATC	2	6	84787	84792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_018623	T	7	7	87406	87412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018623	T	7	7	87426	87432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018623	ATAA	2	8	87443	87450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018623	T	6	6	87456	87461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_018623	ATC	2	6	93407	93412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_018623	AAG	2	6	93548	93553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_018623	T	7	7	128398	128404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_018623	TG	4	8	128423	128430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018623	T	6	6	128437	128442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_018623	A	7	7	128454	128460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_018623	TGT	2	6	128535	128540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_018623	ACA	2	6	128607	128612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_018623	TAC	2	6	128623	128628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_018623	TTTA	2	8	128688	128695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018623	T	6	6	130177	130182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018623	AT	3	6	130235	130240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018623	CTT	2	6	130358	130363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_018623	ATT	2	6	130465	130470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_018623	CT	3	6	130614	130619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_018623	T	7	7	130625	130631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018623	TAA	2	6	130644	130649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018623	CT	3	6	130745	130750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_018623	ATT	2	6	130794	130799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_018623	TAA	2	6	195650	195655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_018623	A	6	6	195692	195697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_018623	CTA	2	6	195708	195713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_018623	TTG	2	6	196496	196501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018623	GAG	2	6	198260	198265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_018623	AG	3	6	198293	198298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018623	TA	3	6	198314	198319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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