MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 2790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018621	AAAG	2	8	213210	213217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018621	TAC	2	6	213236	213241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018621	GGT	2	6	213290	213295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018621	ATA	2	6	213366	213371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018621	TCT	2	6	213414	213419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018621	CATA	2	8	213487	213494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_018621	CCT	2	6	213546	213551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_018621	ATGT	2	8	213603	213610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018621	ACA	2	6	213615	213620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018621	GCC	2	6	213645	213650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_018621	AAG	2	6	213655	213660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018621	A	7	7	213689	213695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018621	AAG	2	6	215229	215234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018621	TGA	2	6	215266	215271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018621	TAA	2	6	215303	215308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018621	T	6	6	215336	215341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018621	AT	3	6	215381	215386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018621	GA	3	6	215441	215446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018621	GT	3	6	215481	215486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018621	CT	3	6	215518	215523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_018621	T	6	6	215546	215551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018621	T	6	6	215609	215614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018621	T	6	6	215655	215660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018621	A	6	6	215706	215711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018621	AG	3	6	215745	215750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018621	TC	3	6	215804	215809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_018621	ATA	2	6	222855	222860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018621	AG	3	6	222863	222868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018621	AAGA	2	8	222870	222877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018621	AGA	2	6	225833	225838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018621	ATAAA	2	10	225839	225848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018621	A	6	6	225860	225865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018621	T	8	8	225915	225922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018621	G	6	6	225980	225985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018621	CTT	2	6	226306	226311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_018621	TCG	2	6	226541	226546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_018621	AAT	2	6	226650	226655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018621	AACA	2	8	226688	226695	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_018621	ATTTT	2	10	226696	226705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018621	TTA	2	6	226706	226711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018621	A	8	8	226744	226751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018621	TAA	2	6	226769	226774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018621	TAAAGA	2	12	226781	226792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018621	TAA	2	6	226805	226810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018621	A	6	6	226849	226854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018621	A	6	6	228235	228240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018621	T	7	7	228241	228247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018621	AAG	2	6	228274	228279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018621	TAT	2	6	228290	228295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018621	T	6	6	229178	229183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018621	ATA	2	6	229198	229203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018621	CCT	2	6	229672	229677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_018621	ATA	2	6	229700	229705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018621	T	8	8	229747	229754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018621	A	6	6	232178	232183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018621	ATTA	2	8	232192	232199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018621	TA	4	8	232198	232205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018621	T	6	6	232209	232214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018621	T	6	6	232245	232250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018621	GAT	2	6	232262	232267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018621	GCG	2	6	232276	232281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018621	GAT	2	6	232319	232324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018621	T	6	6	235915	235920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018621	GC	3	6	236150	236155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_018621	GTCC	2	8	236202	236209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_018621	GTCT	2	8	236220	236227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_018621	T	6	6	236227	236232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018621	AG	3	6	236942	236947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018621	AT	3	6	237012	237017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018621	CTA	2	6	237121	237126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_018621	CTTG	2	8	238116	238123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_018621	GAAT	2	8	238167	238174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018621	GAA	3	9	238181	238189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018621	T	6	6	238204	238209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018621	AAG	2	6	238213	238218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018621	T	7	7	238228	238234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018621	AAG	2	6	238267	238272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018621	ACC	2	6	238286	238291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_018621	AATT	2	8	238306	238313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018621	GAT	2	6	238347	238352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018621	TTTC	2	8	238406	238413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_018621	GTT	2	6	238434	238439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018621	A	8	8	238474	238481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018621	AGA	2	6	238515	238520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018621	ATTATA	2	12	239647	239658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018621	A	6	6	239682	239687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018621	CTT	2	6	239719	239724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018621	TAT	2	6	239746	239751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018621	ATAA	2	8	239787	239794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018621	GA	3	6	239829	239834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018621	A	6	6	239864	239869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018621	GCA	2	6	239882	239887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018621	GCA	2	6	239892	239897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_018621	T	6	6	240108	240113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018621	GTTT	2	8	240836	240843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018621	TAG	2	6	240904	240909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018621	A	7	7	240996	241002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018621	AG	3	6	241038	241043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018621	TAT	2	6	241054	241059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018621	TCAT	2	8	241066	241073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_018621	ATA	2	6	241081	241086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018621	TGT	2	6	242602	242607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018621	TTGAAT	2	12	243960	243971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018621	AGGA	2	8	243996	244003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018621	AG	3	6	244004	244009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018621	T	7	7	244018	244024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018621	AAG	2	6	247793	247798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018621	AAT	2	6	250106	250111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018621	T	6	6	250164	250169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018621	CGA	2	6	252150	252155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018621	GAA	2	6	252223	252228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018621	AAT	2	6	252256	252261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018621	T	8	8	252272	252279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018621	TTG	2	6	252971	252976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018621	TGA	2	6	253024	253029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018621	T	6	6	253055	253060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018621	T	6	6	253104	253109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018621	T	6	6	253125	253130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018621	A	7	7	253133	253139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018621	TAT	2	6	255782	255787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018621	TTG	2	6	255812	255817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018621	TTTAA	2	10	255824	255833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018621	AAGAT	2	10	255898	255907	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018621	T	7	7	257880	257886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018621	T	6	6	261521	261526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018621	GT	3	6	261544	261549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018621	ATT	2	6	261662	261667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018621	A	6	6	261688	261693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018621	ATATAA	2	12	261709	261720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018621	T	6	6	261737	261742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018621	ACT	2	6	262671	262676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018621	TAAA	2	8	262959	262966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018621	ATT	2	6	262972	262977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018621	GTT	2	6	262993	262998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018621	T	8	8	262997	263004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018621	GAG	2	6	265252	265257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018621	GAAAA	2	10	265288	265297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018621	A	6	6	265294	265299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018621	GAA	2	6	265318	265323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018621	GTTC	2	8	266644	266651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
641	NC_018621	TC	3	6	266650	266655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_018621	A	6	6	266661	266666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_018621	AT	4	8	266688	266695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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