MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 2844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018620	ATC	2	6	639038	639043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_018620	TAT	2	6	639049	639054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018620	CCA	2	6	639076	639081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_018620	ACA	2	6	639157	639162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_018620	ATTT	2	8	639179	639186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018620	AATT	2	8	639202	639209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018620	ACA	2	6	639215	639220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_018620	TAAT	2	8	639226	639233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018620	TTA	2	6	639252	639257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018620	TAG	2	6	639264	639269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018620	TTA	2	6	639280	639285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018620	TAT	2	6	639308	639313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018620	GAT	2	6	639448	639453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018620	A	6	6	639454	639459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018620	AAAAC	2	10	639501	639510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_018620	ACT	2	6	639546	639551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_018620	ACA	2	6	639639	639644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_018620	GTC	2	6	639735	639740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_018620	GAA	2	6	639906	639911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018620	ATT	2	6	639912	639917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018620	AGC	2	6	639924	639929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_018620	A	6	6	639970	639975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018620	ATT	2	6	640018	640023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018620	TGT	2	6	640105	640110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018620	ACTA	2	8	640160	640167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_018620	TAC	2	6	640325	640330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_018620	TCT	2	6	640355	640360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_018620	ATA	2	6	640381	640386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018620	TAAT	2	8	640591	640598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018620	ACA	3	9	640615	640623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_018620	CTTC	2	8	640665	640672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_018620	A	8	8	640718	640725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018620	TTTA	2	8	640738	640745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018620	GATT	2	8	640817	640824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018620	ACT	2	6	640939	640944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_018620	TAG	2	6	640945	640950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018620	TAG	2	6	641007	641012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018620	GTTTT	2	10	641029	641038	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018620	ACC	2	6	641058	641063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_018620	TCC	2	6	641088	641093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_018620	TAA	2	6	641143	641148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_018620	CAA	2	6	641170	641175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018620	TTAG	2	8	641712	641719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018620	AAC	2	6	641763	641768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_018620	AGA	2	6	641778	641783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018620	CTTC	2	8	641799	641806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_018620	TCC	2	6	641843	641848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_018620	AAG	2	6	641908	641913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018620	TC	3	6	641918	641923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_018620	AAC	2	6	641952	641957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_018620	TCC	2	6	641996	642001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_018620	ATT	2	6	642010	642015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018620	TCT	2	6	642082	642087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_018620	TCGC	2	8	642094	642101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_018620	T	6	6	642193	642198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018620	TTTTTA	2	12	642233	642244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018620	TGC	2	6	643014	643019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_018620	TGA	2	6	643486	643491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_018620	GGTTT	2	10	643495	643504	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018620	CAG	2	6	643626	643631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018620	A	6	6	643691	643696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018620	T	6	6	644237	644242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018620	ATT	2	6	644252	644257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018620	TTTA	2	8	644319	644326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018620	A	6	6	644374	644379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018620	ACA	2	6	644417	644422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_018620	AAC	2	6	644423	644428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_018620	TAA	2	6	644457	644462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018620	T	6	6	644473	644478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018620	ATA	2	6	644493	644498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018620	TCT	2	6	644505	644510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_018620	AGAT	2	8	644542	644549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018620	TAAC	2	8	644563	644570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_018620	TAA	2	6	644573	644578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_018620	TCA	2	6	644593	644598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_018620	CT	3	6	644701	644706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_018620	ATTTCT	2	12	644773	644784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1578	NC_018620	TA	3	6	644809	644814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018620	CTT	2	6	644819	644824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_018620	TTC	2	6	644828	644833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_018620	TTTC	2	8	644860	644867	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_018620	CAA	2	6	644879	644884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_018620	A	7	7	644897	644903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018620	TTTATA	2	12	644976	644987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_018620	ATA	2	6	645300	645305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_018620	ACC	2	6	645315	645320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_018620	A	7	7	645324	645330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_018620	TCA	2	6	645364	645369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018620	TGA	2	6	645418	645423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018620	A	7	7	645763	645769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018620	TAA	2	6	645770	645775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018620	ATT	2	6	645779	645784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_018620	AAC	2	6	645789	645794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_018620	TAA	2	6	645842	645847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_018620	AGA	2	6	645867	645872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_018620	A	6	6	645995	646000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_018620	GAT	2	6	646110	646115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018620	ATT	2	6	646135	646140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018620	GAA	2	6	646377	646382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018620	TC	3	6	646399	646404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_018620	TAG	2	6	646417	646422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018620	CTT	2	6	646480	646485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_018620	GAA	2	6	646488	646493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_018620	AGGA	2	8	646495	646502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_018620	AAGAG	2	10	646578	646587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018620	A	6	6	647676	647681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018620	TCTTA	2	10	647726	647735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_018620	CA	3	6	647743	647748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_018620	AAATA	2	10	647757	647766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018620	A	7	7	647766	647772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018620	CTAAG	2	10	650732	650741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1613	NC_018620	TTC	2	6	650752	650757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_018620	A	6	6	650771	650776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018620	TAA	2	6	650790	650795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_018620	TCAA	2	8	650811	650818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_018620	A	7	7	650828	650834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_018620	ATG	2	6	651774	651779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_018620	TCT	2	6	651860	651865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_018620	AAAAT	2	10	652601	652610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_018620	TTAAT	2	10	652618	652627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_018620	TAA	2	6	652651	652656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_018620	A	6	6	652665	652670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_018620	ATC	2	6	652676	652681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_018620	ATA	2	6	652710	652715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018620	A	6	6	652727	652732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018620	TGC	2	6	652751	652756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_018620	GATT	2	8	655574	655581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018620	ACA	2	6	655587	655592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_018620	A	6	6	655596	655601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018620	T	7	7	655632	655638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_018620	ATT	2	6	655648	655653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018620	A	6	6	655693	655698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_018620	CACAA	2	10	657159	657168	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1635	NC_018620	T	9	9	657186	657194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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