MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue chromosome

Total Repeats: 2598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018219	TTAA	2	8	19	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018219	CT	3	6	56	61	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018219	AGA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018219	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018219	AGAA	2	8	122	129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018219	AG	3	6	146	151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018219	TCT	2	6	175	180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018219	TTCC	2	8	181	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018219	GAA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018219	T	7	7	1320	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018219	TAAT	2	8	1328	1335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018219	TTA	2	6	1336	1341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018219	ATT	2	6	1342	1347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018219	T	7	7	1346	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018219	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018219	AATT	2	8	1384	1391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018219	TCAAT	2	10	1395	1404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018219	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018219	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018219	GCA	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018219	TCA	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018219	ACTAA	2	10	6438	6447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018219	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018219	ATTA	2	8	7688	7695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018219	AAG	2	6	10986	10991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018219	CT	3	6	11019	11024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018219	TCT	2	6	11096	11101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018219	TCT	2	6	11126	11131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018219	TA	3	6	11155	11160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018219	AAG	2	6	11169	11174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018219	CT	3	6	11180	11185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018219	TTC	2	6	11215	11220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018219	CTC	2	6	11235	11240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018219	AATT	2	8	12560	12567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018219	CTA	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018219	AAG	2	6	16185	16190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018219	T	6	6	16205	16210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018219	GAAG	2	8	16212	16219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018219	CTT	2	6	16286	16291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018219	TC	3	6	16742	16747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018219	TCC	2	6	17647	17652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018219	CTT	2	6	19106	19111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018219	GCCC	3	12	19131	19142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_018219	AAGA	2	8	19158	19165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018219	TAG	2	6	19173	19178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018219	TCT	2	6	19185	19190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018219	AGA	2	6	19197	19202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018219	CA	3	6	19241	19246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018219	TAC	2	6	19373	19378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018219	TGG	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018219	CATG	3	12	19498	19509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018219	TG	3	6	19521	19526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018219	GGC	2	6	19558	19563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018219	CAG	2	6	19566	19571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018219	TAG	2	6	19656	19661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018219	AAATA	2	10	22479	22488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018219	TAT	2	6	22491	22496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018219	TAG	2	6	22516	22521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018219	TTAT	2	8	22550	22557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018219	ATCT	2	8	27638	27645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018219	GTG	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018219	GCT	2	6	27786	27791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018219	AAAT	2	8	27794	27801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018219	T	6	6	28658	28663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018219	TAA	2	6	28667	28672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018219	CTCC	2	8	28677	28684	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018219	GACG	2	8	29419	29426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018219	CTA	2	6	29468	29473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018219	T	6	6	29482	29487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018219	CTA	2	6	29488	29493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018219	ACT	2	6	29494	29499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018219	GTAA	2	8	32011	32018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018219	A	6	6	32017	32022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018219	GAA	2	6	32061	32066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018219	TGA	2	6	32111	32116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018219	ATAG	2	8	32161	32168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018219	AG	3	6	32272	32277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018219	TCCC	2	8	32317	32324	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_018219	AG	3	6	32326	32331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018219	CTT	2	6	32456	32461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018219	CTAT	2	8	34521	34528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018219	TCT	2	6	34531	34536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018219	ACT	2	6	34539	34544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018219	CTT	2	6	37668	37673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018219	CTCG	2	8	38656	38663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018219	AGCG	2	8	38686	38693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018219	T	6	6	40586	40591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018219	AGA	2	6	40621	40626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018219	AG	3	6	40637	40642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018219	TTCT	2	8	44993	45000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018219	AGA	2	6	45011	45016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018219	AG	3	6	45030	45035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018219	AGTC	2	8	45119	45126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018219	CT	3	6	45132	45137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018219	AGTC	2	8	45139	45146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018219	TTC	2	6	45156	45161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018219	TTC	2	6	45186	45191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018219	C	6	6	45211	45216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_018219	AGC	2	6	45224	45229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018219	A	6	6	45252	45257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018219	TTA	2	6	45325	45330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018219	TAC	2	6	45376	45381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018219	AG	3	6	45393	45398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018219	AGAAAG	2	12	45980	45991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018219	CTT	2	6	46018	46023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018219	GATA	2	8	46024	46031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018219	TGC	2	6	46033	46038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018219	GA	3	6	46053	46058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018219	TAA	2	6	46080	46085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018219	TCT	2	6	46178	46183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018219	AAAAT	2	10	46193	46202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018219	C	8	8	47262	47269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_018219	TGA	2	6	52373	52378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018219	CTC	2	6	52379	52384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018219	AGC	2	6	52385	52390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018219	AGA	2	6	52410	52415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018219	TCT	2	6	52437	52442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018219	TTA	2	6	52509	52514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018219	TC	3	6	52549	52554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018219	AT	3	6	52568	52573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018219	TTC	2	6	52601	52606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018219	CTA	2	6	52608	52613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018219	AAG	2	6	56591	56596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018219	TAAGG	2	10	57441	57450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018219	AT	3	6	57453	57458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018219	TAA	2	6	57488	57493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018219	A	8	8	57511	57518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018219	CT	3	6	57549	57554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018219	TTACT	2	10	57569	57578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018219	AGTT	2	8	58809	58816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018219	TGG	2	6	60632	60637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018219	TGG	2	6	60712	60717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018219	CTA	2	6	60766	60771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018219	A	6	6	60793	60798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018219	AG	3	6	61930	61935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018219	TCA	2	6	63071	63076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018219	TAT	2	6	63120	63125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018219	AATT	2	8	65043	65050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018219	TTC	3	9	65055	65063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018219	CCT	2	6	65075	65080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018219	GTC	2	6	67342	67347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018219	CCT	2	6	67363	67368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_018219	AGGG	2	8	67373	67380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018219	AGTT	2	8	68912	68919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018219	CT	3	6	70130	70135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018219	TTC	2	6	70136	70141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018219	TAT	2	6	70183	70188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018219	TTA	2	6	71489	71494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018219	TAAT	2	8	73098	73105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_018219	CTAA	2	8	89811	89818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
297	NC_018219	ATT	2	6	89829	89834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018219	G	8	8	90008	90015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_018219	TCC	2	6	101583	101588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_018219	GAA	2	6	148637	148642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_018219	TTC	2	6	151901	151906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_018219	ATCT	2	8	199215	199222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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