MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue chromosome

Total Repeats: 2598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018219	AACT	2	8	717730	717737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2502	NC_018219	A	6	6	717739	717744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_018219	TTAAA	2	10	717751	717760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_018219	TAG	2	6	717771	717776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_018219	A	6	6	717916	717921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_018219	CTAC	2	8	717933	717940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_018219	AAT	2	6	718193	718198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_018219	GCA	2	6	720672	720677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_018219	TCCT	2	8	720731	720738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_018219	A	7	7	721649	721655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_018219	CTT	2	6	721678	721683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_018219	TTC	2	6	722549	722554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_018219	TAA	2	6	724562	724567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_018219	GAA	2	6	724615	724620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_018219	TA	3	6	724975	724980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_018219	A	7	7	725025	725031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018219	TGT	2	6	725075	725080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_018219	ATCA	2	8	725112	725119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_018219	AGA	2	6	726887	726892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_018219	CGA	2	6	726896	726901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_018219	ACT	2	6	726902	726907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_018219	CTA	2	6	726982	726987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_018219	AGTT	2	8	726988	726995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_018219	TAGACG	2	12	727024	727035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2525	NC_018219	CTT	2	6	727773	727778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_018219	ATA	2	6	730553	730558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_018219	CT	3	6	730573	730578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_018219	GAGG	2	8	730579	730586	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_018219	ACT	2	6	730643	730648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_018219	AGG	2	6	730671	730676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_018219	CTT	2	6	730687	730692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_018219	AAG	2	6	730718	730723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_018219	AGG	2	6	731614	731619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_018219	ATTG	2	8	731620	731627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_018219	A	6	6	731657	731662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_018219	GA	3	6	731703	731708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_018219	TCTTTT	2	12	731711	731722	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2538	NC_018219	CTG	2	6	731769	731774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_018219	AGA	2	6	731817	731822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_018219	AAG	2	6	731859	731864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_018219	CT	3	6	731876	731881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_018219	TCA	2	6	731942	731947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_018219	CTT	2	6	731956	731961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_018219	AGAA	2	8	731970	731977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_018219	TC	3	6	731989	731994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_018219	AAG	2	6	732003	732008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_018219	GTC	2	6	732064	732069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_018219	CT	3	6	732074	732079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_018219	GAA	2	6	732110	732115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_018219	AGG	2	6	732174	732179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_018219	AAG	2	6	733286	733291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_018219	TAT	2	6	746026	746031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_018219	T	6	6	746040	746045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_018219	ATC	2	6	746066	746071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_018219	TCT	2	6	746097	746102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_018219	CGGG	2	8	746111	746118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_018219	CTA	2	6	746158	746163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_018219	ACCT	2	8	747605	747612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_018219	TCG	2	6	747633	747638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_018219	AGA	2	6	747656	747661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_018219	TCT	2	6	747675	747680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_018219	ATG	2	6	747695	747700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_018219	AAGC	2	8	747711	747718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_018219	CTG	2	6	747742	747747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_018219	TAGC	2	8	747786	747793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2566	NC_018219	TCT	2	6	747840	747845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_018219	AAG	2	6	747921	747926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_018219	GGA	2	6	747944	747949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_018219	AGA	2	6	747959	747964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_018219	AAGA	2	8	747972	747979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_018219	AG	3	6	747984	747989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_018219	AGG	2	6	747997	748002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_018219	AGT	2	6	748003	748008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_018219	AGA	2	6	748056	748061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_018219	GAA	2	6	748083	748088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_018219	A	6	6	748093	748098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_018219	AAG	2	6	748109	748114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_018219	TTGA	2	8	748121	748128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_018219	CTA	2	6	748153	748158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_018219	TAG	2	6	748178	748183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_018219	CTC	2	6	748190	748195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_018219	CT	3	6	748200	748205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_018219	TC	3	6	748224	748229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2584	NC_018219	AGT	2	6	748230	748235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_018219	AG	3	6	748250	748255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_018219	GTT	2	6	748259	748264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_018219	AGGA	2	8	752969	752976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_018219	TCT	2	6	753030	753035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_018219	AAGA	2	8	753083	753090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_018219	TTAA	2	8	753092	753099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_018219	A	6	6	753135	753140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_018219	GA	3	6	753153	753158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_018219	AG	3	6	754921	754926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_018219	CTAT	2	8	754927	754934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_018219	GAA	2	6	755026	755031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_018219	CTG	2	6	755052	755057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_018219	GACCT	2	10	755079	755088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2598	NC_018219	T	6	6	755094	755099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.