MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW4

Total Repeats: 2976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017951	AGG	2	6	548123	548128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017951	TCCCTC	2	12	549119	549130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017951	CTA	2	6	549141	549146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017951	A	8	8	549172	549179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017951	GAT	2	6	556212	556217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017951	AAAAG	2	10	558450	558459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017951	ACAA	2	8	558472	558479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017951	GAT	2	6	558480	558485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017951	GAAA	2	8	558495	558502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017951	A	6	6	558509	558514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017951	AGGA	2	8	558520	558527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017951	A	9	9	558551	558559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017951	CT	3	6	558577	558582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_017951	A	6	6	558588	558593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017951	AAT	2	6	558600	558605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017951	CTT	2	6	558629	558634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017951	AAC	2	6	558654	558659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017951	AGA	2	6	558663	558668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017951	CTT	2	6	558671	558676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017951	TCT	2	6	558679	558684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017951	TCA	2	6	558691	558696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017951	CAG	2	6	558710	558715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017951	GCA	2	6	558718	558723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017951	T	6	6	558750	558755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017951	AAT	2	6	558790	558795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017951	TC	3	6	558811	558816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_017951	A	6	6	558821	558826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017951	TCT	2	6	559710	559715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017951	ATA	2	6	559740	559745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017951	TTC	2	6	559763	559768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017951	CTG	2	6	559780	559785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017951	GAG	2	6	559815	559820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1534	NC_017951	TCT	2	6	560597	560602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1537	NC_017951	AAG	2	6	560694	560699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017951	TCT	2	6	560702	560707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017951	GCTT	2	8	560732	560739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1542	NC_017951	CTTT	2	8	560818	560825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_017951	T	8	8	560837	560844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017951	TCT	2	6	560857	560862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017951	AG	3	6	560871	560876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017951	A	9	9	560897	560905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017951	GA	3	6	562369	562374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_017951	CTTG	2	8	565572	565579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_017951	AGA	2	6	565582	565587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017951	GAAAA	2	10	565634	565643	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017951	CCA	2	6	566988	566993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1555	NC_017951	A	6	6	567022	567027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1557	NC_017951	ATT	2	6	567048	567053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017951	A	6	6	567062	567067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017951	ATTTT	2	10	567071	567080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1563	NC_017951	CAA	2	6	573076	573081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017951	TAAA	2	8	573119	573126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017951	A	6	6	573124	573129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017951	ATACT	2	10	573144	573153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_017951	TCT	2	6	573165	573170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1572	NC_017951	CAA	2	6	575645	575650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017951	A	6	6	575649	575654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017951	CAAA	3	12	575659	575670	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017951	AG	3	6	575703	575708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017951	AAC	2	6	575792	575797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_017951	A	7	7	577686	577692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_017951	TTC	2	6	595419	595424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017951	CTTC	2	8	595426	595433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_017951	CA	3	6	597147	597152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_017951	CAAA	2	8	597268	597275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_017951	GGC	2	6	597276	597281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017951	CA	3	6	597313	597318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_017951	GAA	2	6	597413	597418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017951	A	6	6	597509	597514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017951	A	6	6	597556	597561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017951	ACCT	2	8	598467	598474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_017951	TACA	2	8	598489	598496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_017951	AG	3	6	598503	598508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017951	GCA	2	6	598550	598555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1618	NC_017951	AGCA	2	8	601787	601794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017951	A	6	6	601804	601809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017951	TAC	2	6	601811	601816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017951	GA	3	6	603503	603508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017951	TAG	2	6	604106	604111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_017951	TAGGGG	2	12	606245	606256	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_017951	TTA	2	6	606502	606507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017951	TC	3	6	606517	606522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_017951	TCT	2	6	606609	606614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017951	CTT	2	6	606625	606630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_017951	CAA	2	6	606633	606638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_017951	TTGC	2	8	606720	606727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1638	NC_017951	CCT	2	6	606750	606755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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