MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 6051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017945	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017945	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017945	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017945	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017945	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017945	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017945	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017945	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017945	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017945	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017945	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017945	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017945	ACG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017945	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017945	T	7	7	8287	8293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017945	TTA	2	6	8411	8416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017945	AAC	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017945	AGG	2	6	12298	12303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017945	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017945	GAA	2	6	13211	13216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017945	GTT	2	6	13237	13242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017945	T	7	7	13260	13266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017945	GT	3	6	13326	13331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017945	GGT	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017945	T	6	6	13375	13380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017945	GAC	2	6	13459	13464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017945	TTATC	2	10	14083	14092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017945	AGG	2	6	14325	14330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017945	GAA	2	6	14364	14369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017945	ACC	2	6	14371	14376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017945	GGT	2	6	14391	14396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017945	CTT	2	6	14397	14402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017945	TGC	2	6	14476	14481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017945	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017945	A	6	6	17565	17570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017945	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017945	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017945	CAT	2	6	20755	20760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017945	CGTG	2	8	20786	20793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017945	A	7	7	20864	20870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017945	GAA	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017945	AGT	2	6	20924	20929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017945	GAA	2	6	20952	20957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017945	TCCC	2	8	20974	20981	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017945	CCT	2	6	20985	20990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017945	GCC	2	6	21011	21016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017945	GTC	2	6	21017	21022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017945	GAG	2	6	21094	21099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017945	GAT	2	6	21210	21215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017945	CGG	2	6	21251	21256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017945	AGCTTC	2	12	21361	21372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017945	TC	3	6	23153	23158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017945	TAT	2	6	23184	23189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017945	AGC	2	6	24262	24267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017945	T	6	6	24313	24318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017945	TCAT	2	8	24369	24376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017945	TGAT	2	8	24387	24394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017945	CT	3	6	24428	24433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017945	AT	3	6	24489	24494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017945	TTG	2	6	24629	24634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017945	GCTA	2	8	29681	29688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017945	AG	3	6	29703	29708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017945	TAT	2	6	29726	29731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017945	TA	3	6	30086	30091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017945	GAG	2	6	38521	38526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017945	CCT	2	6	39561	39566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017945	TACT	2	8	39587	39594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017945	GCA	2	6	39623	39628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017945	TAG	2	6	39663	39668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017945	AAGA	2	8	39669	39676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017945	ATT	2	6	39882	39887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017945	CAC	2	6	39892	39897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017945	C	7	7	39971	39977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_017945	T	6	6	40049	40054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017945	TGCG	2	8	40119	40126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017945	CACAT	2	10	40138	40147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017945	TGT	2	6	40943	40948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017945	TTC	2	6	41914	41919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017945	ATA	2	6	41939	41944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017945	TA	3	6	41943	41948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017945	GCTG	2	8	42002	42009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017945	TGA	2	6	42071	42076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017945	GCC	2	6	42618	42623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017945	GCA	2	6	42716	42721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017945	GTA	2	6	42730	42735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017945	TG	3	6	42904	42909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017945	GC	3	6	42926	42931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017945	TCGG	2	8	42954	42961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017945	TCT	2	6	43738	43743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017945	CT	3	6	43742	43747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017945	TC	3	6	43772	43777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017945	GCG	2	6	44044	44049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017945	GC	4	8	44124	44131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017945	GC	3	6	44134	44139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017945	CCG	2	6	44201	44206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017945	TGG	2	6	44236	44241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017945	AATG	2	8	44266	44273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017945	CG	3	6	44293	44298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017945	CCT	2	6	45853	45858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017945	ATT	2	6	45897	45902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017945	AAAT	2	8	45910	45917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017945	TGT	2	6	45961	45966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017945	TTGC	2	8	47639	47646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017945	AGC	2	6	47667	47672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017945	TTG	2	6	47683	47688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017945	GTT	2	6	47705	47710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017945	ACT	2	6	48172	48177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017945	TGG	2	6	48240	48245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017945	TAT	2	6	48254	48259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017945	AAG	2	6	48317	48322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017945	ACA	2	6	48415	48420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017945	TGA	2	6	48446	48451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017945	TTA	2	6	48490	48495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017945	TTG	2	6	48506	48511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017945	ATAC	2	8	48616	48623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017945	AAG	2	6	48624	48629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017945	GGC	2	6	48669	48674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017945	GC	3	6	48730	48735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017945	AGA	2	6	48814	48819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017945	ATG	2	6	48849	48854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017945	AGC	2	6	48903	48908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017945	TGC	2	6	48925	48930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017945	GCAT	2	8	49006	49013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017945	CAGTG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017945	AAG	2	6	49085	49090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017945	AGG	2	6	49140	49145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017945	TTC	2	6	49181	49186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017945	CCA	2	6	49231	49236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017945	GAA	2	6	49271	49276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017945	A	7	7	49349	49355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017945	GAG	2	6	49361	49366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017945	TGAGA	2	10	49397	49406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017945	AGTGA	2	10	49447	49456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017945	T	6	6	49661	49666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017945	AAG	2	6	49674	49679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017945	TGC	2	6	49717	49722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017945	TTC	2	6	49834	49839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017945	TCA	2	6	49849	49854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017945	C	6	6	49920	49925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_017945	T	6	6	49937	49942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017945	TGG	2	6	50037	50042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017945	CAT	2	6	50046	50051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017945	TCT	2	6	50123	50128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017945	AAG	2	6	50175	50180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017945	ATC	2	6	50477	50482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017945	TGG	2	6	50657	50662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017945	CG	3	6	50669	50674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017945	AC	3	6	50683	50688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017945	GTTT	2	8	50711	50718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017945	AAC	2	6	52499	52504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_017945	TCA	2	6	110312	110317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017945	CTC	2	6	110385	110390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_017945	GC	3	6	110420	110425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_017945	CGG	2	6	110457	110462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017945	ATC	2	6	110464	110469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_017945	G	6	6	110638	110643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017945	TATTGG	2	12	110714	110725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017945	GGCA	2	8	118097	118104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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312	NC_017945	TG	3	6	121920	121925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_017945	AT	3	6	157389	157394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_017945	ACC	2	6	157403	157408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
419	NC_017945	TCC	2	6	157568	157573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_017945	TGG	2	6	157652	157657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017945	GT	3	6	157661	157666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017945	T	6	6	157708	157713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017945	ATGC	2	8	157880	157887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
424	NC_017945	AGA	2	6	157915	157920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017945	GCT	2	6	161838	161843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_017945	GAG	2	6	165121	165126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017945	GGA	2	6	166458	166463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017945	TGC	2	6	166518	166523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_017945	TTG	2	6	166595	166600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017945	AGA	2	6	166610	166615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017945	AT	3	6	169943	169948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_017945	ATA	2	6	172543	172548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017945	AAACT	2	10	173151	173160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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