MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 6893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017730	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017730	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017730	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017730	TGC	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017730	GAG	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017730	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017730	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017730	A	6	6	7622	7627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017730	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017730	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017730	TA	4	8	8187	8194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017730	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017730	ACG	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017730	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017730	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017730	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017730	AGTT	2	8	9009	9016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017730	CGA	2	6	9083	9088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017730	GCG	2	6	9097	9102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017730	GAG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017730	CCG	2	6	9230	9235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017730	ACG	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017730	CGC	2	6	9446	9451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017730	ACTC	2	8	9473	9480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017730	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017730	CG	3	6	9577	9582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017730	TGA	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017730	CAAC	2	8	9631	9638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017730	TCT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017730	GCAT	2	8	9726	9733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017730	GAA	3	9	9852	9860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017730	ACA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017730	CG	3	6	10042	10047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017730	TGC	2	6	10153	10158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017730	TTA	2	6	10160	10165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017730	TCG	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017730	GAA	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017730	CGA	2	6	10274	10279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017730	GC	3	6	10320	10325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017730	GATC	2	8	10334	10341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017730	AGA	2	6	10417	10422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017730	GAAATT	3	18	10440	10457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017730	CGT	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017730	ATT	2	6	10563	10568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017730	GAA	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017730	GTG	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017730	CGT	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017730	CTT	2	6	10742	10747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017730	CACG	2	8	10757	10764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017730	CG	4	8	10841	10848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017730	GGT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017730	GAA	2	6	11035	11040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017730	ATG	2	6	11072	11077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017730	GCT	2	6	11082	11087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017730	GAA	2	6	11098	11103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017730	TGA	3	9	11127	11135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017730	CGA	2	6	11193	11198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017730	GCT	2	6	11202	11207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017730	TCT	2	6	11238	11243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017730	GGC	2	6	11257	11262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017730	CAG	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017730	GTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017730	GGT	2	6	11367	11372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017730	TGA	2	6	11376	11381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017730	CCA	2	6	11462	11467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017730	AGA	2	6	11490	11495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017730	GCT	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017730	GCGAAG	2	12	11534	11545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017730	CTG	2	6	11549	11554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017730	GTC	2	6	11597	11602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017730	TGC	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017730	GTT	2	6	12088	12093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017730	AAC	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017730	AGG	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017730	TGT	2	6	12363	12368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017730	TCGC	2	8	12458	12465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017730	GGAT	2	8	12468	12475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017730	GAA	2	6	13207	13212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017730	GTT	2	6	13233	13238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017730	T	7	7	13256	13262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017730	GT	3	6	13322	13327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017730	GGT	2	6	13354	13359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017730	T	6	6	13371	13376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017730	GAC	2	6	13455	13460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017730	CAA	2	6	13483	13488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017730	CAT	2	6	13493	13498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017730	TTATC	2	10	14079	14088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017730	AGG	2	6	14321	14326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017730	CAGTA	2	10	14625	14634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017730	GCG	2	6	14706	14711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017730	CGT	2	6	14732	14737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017730	GGC	2	6	14760	14765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017730	CTC	2	6	14774	14779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017730	A	6	6	17577	17582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017730	TAGCG	2	10	18340	18349	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017730	GAA	2	6	20110	20115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017730	GAAA	2	8	20235	20242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017730	TGG	2	6	20291	20296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017730	GCT	2	6	20376	20381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017730	CGA	2	6	20415	20420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017730	AGT	2	6	20908	20913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017730	GAG	2	6	21078	21083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017730	GAT	2	6	21194	21199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017730	CGG	2	6	21234	21239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017730	AGCTTC	2	12	21344	21355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017730	ACTC	2	8	21702	21709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017730	TCC	2	6	21722	21727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017730	AAT	2	6	21742	21747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017730	AG	3	6	21802	21807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017730	GTT	2	6	21840	21845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017730	TGT	2	6	21849	21854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017730	CAT	2	6	21878	21883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017730	GGT	2	6	22028	22033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017730	ATTT	2	8	22066	22073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017730	ACC	2	6	22074	22079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017730	TG	4	8	22084	22091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017730	TTCC	2	8	22108	22115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017730	GTCG	2	8	22124	22131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017730	CAT	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017730	GAG	2	6	22190	22195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017730	TTCGC	2	10	22211	22220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017730	TCT	2	6	22226	22231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017730	TCG	3	9	22245	22253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017730	TTG	2	6	22254	22259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017730	AGC	2	6	22271	22276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017730	AGG	2	6	22320	22325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017730	TGC	2	6	22376	22381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017730	GGC	2	6	22391	22396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017730	TCT	2	6	22569	22574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017730	AGC	2	6	22604	22609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017730	GTT	2	6	22615	22620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017730	ACC	2	6	22706	22711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017730	CCA	2	6	22713	22718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017730	AGG	2	6	22750	22755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017730	AGC	2	6	22757	22762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017730	GGCT	2	8	22764	22771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017730	TCC	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017730	CAAA	2	8	22928	22935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017730	CGA	2	6	24018	24023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017730	GTT	2	6	24025	24030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017730	TC	3	6	24763	24768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017730	TAT	2	6	24794	24799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017730	GAT	2	6	24821	24826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017730	CCA	2	6	24900	24905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017730	TC	3	6	24975	24980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017730	CGA	2	6	24995	25000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017730	CAA	2	6	25020	25025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017730	AGGA	2	8	25042	25049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017730	TTC	2	6	25054	25059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017730	TGC	2	6	25137	25142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017730	TCC	2	6	25193	25198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017730	AGCG	2	8	25209	25216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017730	T	6	6	25313	25318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017730	TTGA	2	8	25397	25404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017730	GTT	2	6	25656	25661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017730	CGA	2	6	25743	25748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017730	T	6	6	25804	25809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017730	AAT	2	6	25864	25869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_017730	T	6	6	25922	25927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017730	TGAT	2	8	25996	26003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017730	CT	3	6	26037	26042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_017730	GGT	2	6	26046	26051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017730	TTG	2	6	26237	26242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017730	AG	3	6	31308	31313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017730	TAT	2	6	31331	31336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017730	TA	3	6	31691	31696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017730	CGT	2	6	39420	39425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_017730	ATC	2	6	39496	39501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_017730	G	8	8	41639	41646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017730	TTG	2	6	145257	145262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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