MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 2323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017437	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017437	AAG	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017437	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017437	CTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017437	T	7	7	1841	1847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017437	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017437	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017437	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017437	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017437	T	7	7	2255	2261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017437	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017437	A	6	6	2327	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017437	GCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017437	A	6	6	5660	5665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017437	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017437	CAAAAA	2	12	6846	6857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017437	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017437	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017437	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017437	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017437	A	6	6	7607	7612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017437	TATTT	2	10	7628	7637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017437	ATG	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017437	A	6	6	9726	9731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017437	TTC	3	9	9771	9779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017437	ATC	2	6	9787	9792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017437	A	6	6	9811	9816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017437	GAA	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017437	A	6	6	9881	9886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017437	TATT	2	8	9904	9911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017437	CCT	2	6	9925	9930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017437	TAG	2	6	11786	11791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017437	AGAA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017437	CTT	2	6	11836	11841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017437	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017437	TCA	2	6	11872	11877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017437	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017437	ATT	2	6	13966	13971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017437	AAG	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017437	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017437	CAAA	2	8	16665	16672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017437	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017437	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017437	GAA	2	6	18967	18972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017437	CTT	3	9	20485	20493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017437	T	6	6	20492	20497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017437	T	6	6	20499	20504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017437	GAA	2	6	21010	21015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017437	A	6	6	21072	21077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017437	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017437	TGG	2	6	21463	21468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017437	AAC	2	6	21502	21507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017437	AGC	2	6	21519	21524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017437	AGG	2	6	21608	21613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017437	TGA	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017437	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017437	TCC	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017437	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017437	CGCT	2	8	21861	21868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017437	TTAA	2	8	21882	21889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017437	GTTA	2	8	21919	21926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017437	GATC	2	8	21974	21981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017437	A	7	7	25153	25159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017437	TTA	2	6	25166	25171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017437	T	9	9	25181	25189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017437	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017437	CT	3	6	27112	27117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017437	ACT	2	6	27120	27125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017437	A	6	6	27136	27141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017437	T	7	7	27148	27154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017437	T	7	7	28462	28468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017437	TAA	2	6	28473	28478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017437	TC	3	6	28480	28485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017437	ATTG	2	8	28531	28538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017437	AG	3	6	28563	28568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017437	AGA	2	6	28585	28590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017437	AAAGA	2	10	33685	33694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017437	CTG	2	6	33713	33718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017437	GA	3	6	36976	36981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017437	T	9	9	37010	37018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017437	CTT	2	6	37070	37075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017437	AT	3	6	37078	37083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017437	CT	3	6	39345	39350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017437	TAA	2	6	39408	39413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017437	T	6	6	39428	39433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017437	AAG	2	6	39449	39454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017437	A	8	8	40706	40713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017437	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017437	T	6	6	40721	40726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017437	CTC	2	6	40727	40732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017437	AAG	2	6	40812	40817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017437	T	8	8	40902	40909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017437	GCT	2	6	41027	41032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017437	GAA	2	6	41093	41098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017437	CTT	2	6	41108	41113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017437	AGG	2	6	41122	41127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017437	AG	3	6	41192	41197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017437	GC	3	6	41241	41246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017437	TTG	2	6	41280	41285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017437	T	6	6	41302	41307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017437	GCT	2	6	41315	41320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017437	GA	3	6	41406	41411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017437	TC	3	6	41415	41420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017437	GC	3	6	41480	41485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017437	TAA	2	6	41488	41493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017437	TCT	2	6	41494	41499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017437	AAG	2	6	41598	41603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017437	GA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017437	TTC	2	6	41641	41646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017437	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017437	GAT	2	6	43267	43272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017437	AAG	2	6	43273	43278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017437	A	8	8	43311	43318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017437	GGA	2	6	43325	43330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017437	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017437	TGTT	2	8	44408	44415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017437	A	8	8	44447	44454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017437	AATA	2	8	44647	44654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017437	ACT	2	6	44655	44660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017437	AAG	2	6	46506	46511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017437	AG	3	6	48634	48639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017437	TGT	2	6	48653	48658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017437	T	9	9	49199	49207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017437	GTC	2	6	49332	49337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017437	AAG	2	6	49354	49359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017437	TAT	2	6	49383	49388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017437	T	8	8	49477	49484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017437	A	6	6	49528	49533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017437	AGA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017437	CTATT	2	10	50181	50190	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017437	AAG	2	6	50214	50219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017437	TCT	2	6	50228	50233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017437	ACT	2	6	50269	50274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017437	T	7	7	50289	50295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017437	AAT	2	6	50304	50309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017437	TGT	2	6	50326	50331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017437	GCC	2	6	50373	50378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017437	ATT	2	6	50422	50427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017437	CAA	2	6	50441	50446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017437	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017437	TAA	2	6	51998	52003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017437	T	6	6	52021	52026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017437	AGT	3	9	52065	52073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017437	GAT	2	6	52610	52615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017437	T	6	6	53713	53718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017437	T	6	6	53728	53733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017437	GTTT	2	8	54521	54528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017437	TGTT	2	8	54529	54536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017437	AATTT	2	10	54537	54546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017437	T	6	6	54544	54549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017437	TAAT	2	8	54573	54580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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