MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 2720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017430	T	7	7	144465	144471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017430	TAA	2	6	150584	150589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017430	A	6	6	150588	150593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017430	AGA	2	6	150622	150627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017430	GAA	2	6	151519	151524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017430	AAG	2	6	151587	151592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017430	GTT	2	6	151595	151600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017430	T	7	7	151684	151690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017430	TTC	2	6	151702	151707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017430	ATCT	2	8	151762	151769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_017430	GCTG	2	8	151801	151808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017430	GA	3	6	151852	151857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017430	GCG	2	6	151889	151894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017430	GGA	2	6	151895	151900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017430	A	6	6	152334	152339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017430	A	6	6	153473	153478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017430	GCG	2	6	153495	153500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017430	TTCTA	2	10	157387	157396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
519	NC_017430	AG	3	6	157417	157422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017430	TAA	2	6	157432	157437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017430	AAAG	2	8	158217	158224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017430	TTTA	2	8	158226	158233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017430	CTA	2	6	158287	158292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017430	AAG	2	6	158329	158334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017430	TAAT	2	8	158343	158350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017430	T	6	6	158848	158853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017430	T	7	7	158872	158878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017430	T	7	7	158972	158978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017430	ATT	2	6	159091	159096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017430	T	7	7	159121	159127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017430	A	7	7	159155	159161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017430	TAAT	2	8	159179	159186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017430	GCTT	2	8	161815	161822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_017430	CAAAA	2	10	161845	161854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
535	NC_017430	TGT	2	6	161867	161872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017430	GAG	2	6	161966	161971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017430	T	7	7	165826	165832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017430	CTTC	2	8	165886	165893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017430	G	6	6	170271	170276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017430	TTAG	2	8	170294	170301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017430	TC	3	6	171881	171886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017430	AGG	2	6	171907	171912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017430	AG	3	6	172013	172018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017430	CT	3	6	172031	172036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017430	AAAC	2	8	172041	172048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_017430	T	6	6	173015	173020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017430	AAG	2	6	173035	173040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017430	ATA	2	6	173088	173093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017430	AAC	2	6	173112	173117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017430	ATT	2	6	173140	173145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017430	AGA	2	6	173164	173169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017430	T	7	7	173174	173180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017430	A	6	6	173184	173189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017430	GTAT	2	8	173223	173230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017430	TTA	2	6	173235	173240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017430	A	6	6	173240	173245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017430	ATT	2	6	173332	173337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017430	GGAA	2	8	178411	178418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017430	TGA	2	6	178445	178450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017430	TAT	2	6	178480	178485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017430	TG	3	6	178522	178527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017430	ATT	2	6	179500	179505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017430	GCT	2	6	179506	179511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017430	GGAAT	2	10	179519	179528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017430	TTGA	2	8	179593	179600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017430	ATG	2	6	179612	179617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017430	TGA	3	9	179621	179629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017430	TGA	2	6	179655	179660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017430	ATG	2	6	180683	180688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017430	TTCC	2	8	180811	180818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_017430	ACA	2	6	180838	180843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017430	TGT	2	6	180879	180884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017430	AAAC	2	8	180914	180921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017430	AAAG	2	8	182189	182196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017430	AAGA	2	8	182207	182214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017430	T	8	8	182231	182238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017430	AGAAAA	2	12	182249	182260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017430	A	7	7	182257	182263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017430	TCG	2	6	182298	182303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017430	TGT	2	6	182310	182315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017430	T	6	6	182328	182333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017430	T	7	7	182335	182341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017430	AAAG	2	8	182387	182394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017430	ACT	2	6	182947	182952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017430	TAG	2	6	182981	182986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017430	GCA	2	6	183036	183041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017430	TCGC	2	8	183079	183086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_017430	AGA	2	6	183090	183095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017430	GCA	2	6	183099	183104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_017430	AGA	2	6	183166	183171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017430	GA	3	6	183308	183313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017430	GTT	2	6	183319	183324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017430	GAG	2	6	183340	183345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017430	GAA	2	6	183360	183365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017430	TTG	2	6	183371	183376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017430	TGA	2	6	183528	183533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017430	CAG	3	9	183601	183609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017430	GTA	2	6	183644	183649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017430	GTTG	2	8	183684	183691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017430	GGA	3	9	183699	183707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017430	TC	3	6	183715	183720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_017430	ATT	2	6	183734	183739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017430	A	7	7	183764	183770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017430	T	8	8	183776	183783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017430	ATA	2	6	183826	183831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017430	A	6	6	183831	183836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017430	TAT	2	6	183907	183912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017430	GA	3	6	183947	183952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017430	GTT	2	6	185269	185274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017430	GTT	4	12	185667	185678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017430	T	6	6	185684	185689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017430	T	7	7	185692	185698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017430	T	6	6	185704	185709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017430	T	7	7	185754	185760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017430	A	7	7	185776	185782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017430	T	6	6	185799	185804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017430	ATC	2	6	187494	187499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017430	CGATA	2	10	187522	187531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
622	NC_017430	T	6	6	187535	187540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017430	TCC	2	6	187555	187560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017430	ACA	3	9	187561	187569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017430	AGT	2	6	187579	187584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017430	AAAC	2	8	187604	187611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_017430	TGC	2	6	187670	187675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017430	AGT	2	6	187738	187743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017430	AGT	2	6	187761	187766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017430	TTG	2	6	187769	187774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017430	TAT	2	6	187849	187854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017430	T	6	6	187868	187873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017430	GCA	2	6	187921	187926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017430	CTT	2	6	187936	187941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017430	GGAC	2	8	187963	187970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_017430	AAG	2	6	188073	188078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017430	TTG	2	6	188095	188100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017430	CAT	2	6	188105	188110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017430	T	7	7	188144	188150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017430	TAA	2	6	188223	188228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017430	TTG	2	6	188251	188256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_017430	CTT	2	6	199874	199879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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677	NC_017430	CT	3	6	201709	201714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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