MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017308	GGA	2	6	197081	197086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017308	CGCC	2	8	197132	197139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1003	NC_017308	AGC	2	6	197191	197196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017308	CA	4	8	197207	197214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017308	AAC	2	6	197233	197238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017308	AAC	2	6	197249	197254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017308	CCGC	2	8	197257	197264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1008	NC_017308	GCC	2	6	197307	197312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017308	GCC	2	6	197438	197443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017308	CGC	2	6	197647	197652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_017308	AAC	2	6	197682	197687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017308	GATGG	2	10	197711	197720	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017308	ACCA	2	8	197726	197733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_017308	CG	4	8	197754	197761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_017308	AAG	2	6	197796	197801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017308	CGC	2	6	197845	197850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_017308	GCC	2	6	197864	197869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017308	GTA	2	6	197897	197902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017308	GCG	2	6	197975	197980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017308	AGC	2	6	197983	197988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017308	AGC	2	6	198295	198300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017308	GCT	2	6	198310	198315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017308	AAG	2	6	199863	199868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017308	CGAA	2	8	200051	200058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_017308	GC	3	6	200059	200064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017308	GTA	2	6	200117	200122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017308	AAC	2	6	200123	200128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017308	GCT	2	6	201553	201558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017308	GTTC	2	8	204097	204104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017308	AGG	2	6	204118	204123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017308	AGT	2	6	205256	205261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017308	CTC	2	6	206880	206885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_017308	TAG	2	6	206886	206891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017308	GA	4	8	207113	207120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017308	ACC	2	6	209676	209681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_017308	GC	3	6	209714	209719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_017308	TCC	2	6	209737	209742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017308	ACG	2	6	211904	211909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017308	CG	3	6	212506	212511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_017308	TAGA	2	8	212527	212534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017308	TTG	2	6	212535	212540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017308	GTA	2	6	212548	212553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017308	GCG	2	6	214204	214209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017308	GAAAA	2	10	214253	214262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017308	A	6	6	214259	214264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017308	AAT	2	6	214311	214316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017308	GCCC	2	8	214357	214364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_017308	C	6	6	214362	214367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1049	NC_017308	GGC	2	6	214379	214384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017308	C	6	6	214394	214399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_017308	GCC	2	6	214408	214413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017308	TG	3	6	214418	214423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017308	TAG	2	6	214688	214693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017308	GTCT	2	8	214714	214721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_017308	CGAGA	2	10	214893	214902	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_017308	CAAAA	2	10	218512	218521	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_017308	A	6	6	218518	218523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017308	AAC	2	6	218527	218532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017308	AAC	2	6	218552	218557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017308	ATG	2	6	219500	219505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017308	GGT	2	6	219546	219551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017308	CGC	2	6	219599	219604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_017308	CGT	2	6	219614	219619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017308	AC	3	6	219665	219670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_017308	CGC	2	6	219720	219725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017308	GCG	2	6	219733	219738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017308	GC	3	6	219743	219748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017308	TGA	2	6	219815	219820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017308	TAC	2	6	219846	219851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017308	GCT	2	6	220062	220067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017308	CT	3	6	220078	220083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_017308	TGG	2	6	220087	220092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017308	GA	3	6	220118	220123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017308	CGG	2	6	220259	220264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017308	CTG	2	6	220303	220308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_017308	GAT	2	6	220443	220448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017308	TCA	2	6	220472	220477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017308	TGCT	2	8	220528	220535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_017308	TAC	2	6	220573	220578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017308	AGC	2	6	220637	220642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1084	NC_017308	ATG	2	6	220841	220846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_017308	ATG	2	6	220931	220936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017308	GTGC	2	8	220937	220944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017308	GAG	2	6	220990	220995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017308	GTT	2	6	221017	221022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017308	GGA	2	6	221079	221084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017308	GCC	2	6	221085	221090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1095	NC_017308	TCG	2	6	221141	221146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017308	TGA	2	6	221189	221194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017308	CGT	2	6	221289	221294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_017308	CAAGA	2	10	221436	221445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_017308	GGA	2	6	221479	221484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017308	TG	3	6	221526	221531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017308	CTT	2	6	221535	221540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017308	CTT	2	6	221583	221588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017308	GC	3	6	221626	221631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_017308	TGGCT	2	10	221632	221641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_017308	GGT	2	6	221644	221649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017308	ATT	2	6	221761	221766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017308	AAT	2	6	221781	221786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017308	T	7	7	221793	221799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017308	TGG	2	6	221867	221872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017308	GTG	2	6	221917	221922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017308	GT	3	6	222217	222222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017308	TGG	2	6	222247	222252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017308	CCG	2	6	222264	222269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_017308	T	6	6	222277	222282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017308	G	6	6	222303	222308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017308	TTA	2	6	222332	222337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017308	GTA	2	6	222371	222376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017308	TTCA	2	8	225488	225495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_017308	TCCT	2	8	227494	227501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017308	GATA	2	8	227609	227616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017308	GTAG	2	8	227623	227630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017308	T	7	7	227634	227640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017308	CCTA	2	8	227652	227659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_017308	ACT	2	6	229225	229230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017308	TGT	2	6	230531	230536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017308	AGCC	2	8	230570	230577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_017308	GGC	2	6	230641	230646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017308	CTA	2	6	231038	231043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017308	AGG	2	6	231064	231069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017308	CGA	2	6	231095	231100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017308	GCC	2	6	231121	231126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1135	NC_017308	TAA	2	6	232840	232845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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